RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623271.1

KIFC3-235, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

Gene KIFC3, Length 2,393 nt, Biotype TEC, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-235ENST00000623271 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.59■■■□□ 2.33
KIFC3-235ENST00000623271 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.83■■□□□ 1.73
KIFC3-235ENST00000623271 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
KIFC3-235ENST00000623271 ABCC9O60706 1549 aa24.76■■□□□ 1.55
KIFC3-235ENST00000623271 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.67■■□□□ 1.54
KIFC3-235ENST00000623271 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.37■■□□□ 1.49
KIFC3-235ENST00000623271 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.2■■□□□ 1.46
KIFC3-235ENST00000623271 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.13■■□□□ 1.45
KIFC3-235ENST00000623271 NACADO15069 1562 aa24.11■■□□□ 1.45
KIFC3-235ENST00000623271 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.98■■□□□ 1.43
KIFC3-235ENST00000623271 SCRIBQ14160 1630 aa23.88■■□□□ 1.41
KIFC3-235ENST00000623271 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.57■■□□□ 1.36
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KIFC3-235ENST00000623271 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
KIFC3-235ENST00000623271 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.09■■□□□ 1.29
KIFC3-235ENST00000623271 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
KIFC3-235ENST00000623271 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.91■■□□□ 1.26
KIFC3-235ENST00000623271 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
KIFC3-235ENST00000623271 SMARCA4P51532 1647 aa22.8■■□□□ 1.24
KIFC3-235ENST00000623271 WIZO95785 1651 aa22.73■■□□□ 1.23
KIFC3-235ENST00000623271 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
KIFC3-235ENST00000623271 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.47■■□□□ 1.19
KIFC3-235ENST00000623271 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.46■■□□□ 1.19
KIFC3-235ENST00000623271 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
KIFC3-235ENST00000623271 SMARCA2P51531 1590 aa22.42■■□□□ 1.18
KIFC3-235ENST00000623271 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.36■■□□□ 1.17
KIFC3-235ENST00000623271 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
KIFC3-235ENST00000623271 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.31■■□□□ 1.16
KIFC3-235ENST00000623271 NCAPD3P42695 1498 aa22.27■■□□□ 1.15
KIFC3-235ENST00000623271 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.22■■□□□ 1.15
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KIFC3-235ENST00000623271 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.72■■□□□ 1.07
KIFC3-235ENST00000623271 HRCP23327 699 aa21.72■■□□□ 1.07
KIFC3-235ENST00000623271 TRIM41Q8WV44 630 aa21.7■■□□□ 1.07
KIFC3-235ENST00000623271 NESP48681 1621 aa21.69■■□□□ 1.06
KIFC3-235ENST00000623271 PRDM2Q13029 1718 aa21.61■■□□□ 1.05
KIFC3-235ENST00000623271 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.61■■□□□ 1.05
KIFC3-235ENST00000623271 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.61■■□□□ 1.05
KIFC3-235ENST00000623271 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
KIFC3-235ENST00000623271 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.55■■□□□ 1.04
KIFC3-235ENST00000623271 SYNJ1O43426 1573 aa21.52■■□□□ 1.04
KIFC3-235ENST00000623271 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.51■■□□□ 1.03
KIFC3-235ENST00000623271 CUX1P39880 1505 aa21.43■■□□□ 1.02
KIFC3-235ENST00000623271 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
KIFC3-235ENST00000623271 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.4■■□□□ 1.02
KIFC3-235ENST00000623271 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.4■■□□□ 1.02
KIFC3-235ENST00000623271 TOP2BQ02880 1626 aa21.39■■□□□ 1.02
KIFC3-235ENST00000623271 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.38■■□□□ 1.01
KIFC3-235ENST00000623271 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.36■■□□□ 1.01
KIFC3-235ENST00000623271 SOGA1O94964 1423 aa21.3■■□□□ 1
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KIFC3-235ENST00000623271 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
KIFC3-235ENST00000623271 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.12■□□□□ 0.97
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KIFC3-235ENST00000623271 CUX2O14529 1486 aa21.06■□□□□ 0.96
KIFC3-235ENST00000623271 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
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KIFC3-235ENST00000623271 WDR97A6NE52 1622 aa20.94■□□□□ 0.94
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KIFC3-235ENST00000623271 CUL7Q14999 1698 aa20.69■□□□□ 0.9
KIFC3-235ENST00000623271 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
KIFC3-235ENST00000623271 GRIN2BQ13224 1484 aa20.67■□□□□ 0.9
KIFC3-235ENST00000623271 CEP162Q5TB80 1403 aa20.66■□□□□ 0.9
KIFC3-235ENST00000623271 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.61■□□□□ 0.89
KIFC3-235ENST00000623271 ADAMTS12P58397 1594 aa20.6■□□□□ 0.89
KIFC3-235ENST00000623271 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.57■□□□□ 0.88
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