RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.67■■■■■ 4.1
CD99-211ENST00000623253 ABCC9O60706 1549 aa36.86■■■■□ 3.49
CD99-211ENST00000623253 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.51■■■■□ 3.43
CD99-211ENST00000623253 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.92■■■■□ 3.18
CD99-211ENST00000623253 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.77■■■■□ 3.16
CD99-211ENST00000623253 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.66■■■■□ 3.14
CD99-211ENST00000623253 NACADO15069 1562 aa34.61■■■■□ 3.13
CD99-211ENST00000623253 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.36■■■■□ 3.094e-8■■■■■ 30
CD99-211ENST00000623253 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.05■■■■□ 3.04
CD99-211ENST00000623253 MYO15BQ96JP2 1530 aa34■■■■□ 3.03
CD99-211ENST00000623253 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.87■■■■□ 3.01
CD99-211ENST00000623253 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
CD99-211ENST00000623253 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.51■■■□□ 2.95
CD99-211ENST00000623253 SCRIBQ14160 1630 aa33.37■■■□□ 2.93
CD99-211ENST00000623253 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.36■■■□□ 2.93
CD99-211ENST00000623253 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.22■■■□□ 2.91
CD99-211ENST00000623253 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.2■■■□□ 2.91
CD99-211ENST00000623253 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
CD99-211ENST00000623253 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.06■■■□□ 2.72
CD99-211ENST00000623253 NCAPD3P42695 1498 aa31.97■■■□□ 2.71
CD99-211ENST00000623253 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.87■■■□□ 2.69
CD99-211ENST00000623253 ERCC6Q03468 1493 aa31.85■■■□□ 2.69
CD99-211ENST00000623253 CUX2O14529 1486 aa31.77■■■□□ 2.68
CD99-211ENST00000623253 SMARCA4P51532 1647 aa31.75■■■□□ 2.67
CD99-211ENST00000623253 SMARCA2P51531 1590 aa31.74■■■□□ 2.67
CD99-211ENST00000623253 HMGXB3Q12766 1538 aa31.68■■■□□ 2.66
CD99-211ENST00000623253 NESP48681 1621 aa31.59■■■□□ 2.65
CD99-211ENST00000623253 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CD99-211ENST00000623253 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
CD99-211ENST00000623253 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.39■■■□□ 2.62
CD99-211ENST00000623253 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.36■■■□□ 2.61
CD99-211ENST00000623253 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.26■■■□□ 2.6
CD99-211ENST00000623253 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
CD99-211ENST00000623253 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.16■■■□□ 2.58
CD99-211ENST00000623253 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.11■■■□□ 2.57
CD99-211ENST00000623253 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.04■■■□□ 2.56
CD99-211ENST00000623253 WIZO95785 1651 aa30.97■■■□□ 2.55
CD99-211ENST00000623253 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.88■■■□□ 2.53
CD99-211ENST00000623253 WDR62O43379 1518 aa30.77■■■□□ 2.52
CD99-211ENST00000623253 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.73■■■□□ 2.51
CD99-211ENST00000623253 TRIM41Q8WV44 630 aa30.69■■■□□ 2.5
CD99-211ENST00000623253 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.69■■■□□ 2.5
CD99-211ENST00000623253 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
CD99-211ENST00000623253 CFTRP13569 1480 aa30.6■■■□□ 2.49
CD99-211ENST00000623253 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CD99-211ENST00000623253 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CD99-211ENST00000623253 OSCARQ8IYS5 282 aa30.4■■■□□ 2.46
CD99-211ENST00000623253 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.25■■■□□ 2.43
CD99-211ENST00000623253 PRDM2Q13029 1718 aa30.18■■■□□ 2.42
CD99-211ENST00000623253 IFT140Q96RY7 1462 aa30.11■■■□□ 2.41
CD99-211ENST00000623253 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
CD99-211ENST00000623253 TOPBP1Q92547 1522 aa30.06■■■□□ 2.4
CD99-211ENST00000623253 ABCC8Q09428 1581 aa29.98■■■□□ 2.39
CD99-211ENST00000623253 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.93■■■□□ 2.38
CD99-211ENST00000623253 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.93■■■□□ 2.38
CD99-211ENST00000623253 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.93■■■□□ 2.38
CD99-211ENST00000623253 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.91■■■□□ 2.38
CD99-211ENST00000623253 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CD99-211ENST00000623253 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.84■■■□□ 2.377e-6■■□□□ 13.1
CD99-211ENST00000623253 ARHGEF11O15085 1522 aa29.83■■■□□ 2.37
CD99-211ENST00000623253 FBLN2P98095 1184 aa29.8■■■□□ 2.36
CD99-211ENST00000623253 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CD99-211ENST00000623253 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.75■■■□□ 2.35
CD99-211ENST00000623253 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CD99-211ENST00000623253 CHD1O14646 1710 aa29.69■■■□□ 2.34
CD99-211ENST00000623253 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.68■■■□□ 2.34
CD99-211ENST00000623253 SOGA1O94964 1423 aa29.66■■■□□ 2.34
CD99-211ENST00000623253 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
CD99-211ENST00000623253 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.55■■■□□ 2.32
CD99-211ENST00000623253 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CD99-211ENST00000623253 ARAP1Q96P48 1450 aa29.52■■■□□ 2.32
CD99-211ENST00000623253 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.5■■■□□ 2.31
CD99-211ENST00000623253 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CD99-211ENST00000623253 CUX1P39880 1505 aa29.46■■■□□ 2.31
CD99-211ENST00000623253 WDR97A6NE52 1622 aa29.41■■■□□ 2.3
CD99-211ENST00000623253 GRIN2BQ13224 1484 aa29.38■■■□□ 2.29
CD99-211ENST00000623253 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
CD99-211ENST00000623253 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.34■■■□□ 2.29
CD99-211ENST00000623253 SYNJ1O43426 1573 aa29.34■■■□□ 2.29
CD99-211ENST00000623253 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CD99-211ENST00000623253 SYNJ2O15056 1496 aa29.29■■■□□ 2.28
CD99-211ENST00000623253 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.26■■■□□ 2.27
CD99-211ENST00000623253 PBRM1Q86U86 1689 aa29.19■■■□□ 2.26
CD99-211ENST00000623253 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.16■■■□□ 2.26
CD99-211ENST00000623253 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.11■■■□□ 2.25
CD99-211ENST00000623253 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
CD99-211ENST00000623253 GRIN2AQ12879 1464 aa29■■■□□ 2.23
CD99-211ENST00000623253 ADAMTS12P58397 1594 aa28.92■■■□□ 2.22
CD99-211ENST00000623253 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.92■■■□□ 2.22
CD99-211ENST00000623253 TOP2BQ02880 1626 aa28.91■■■□□ 2.22
CD99-211ENST00000623253 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.89■■■□□ 2.22
CD99-211ENST00000623253 CEP170Q5SW79 1584 aa28.88■■■□□ 2.21
CD99-211ENST00000623253 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.88■■■□□ 2.21
CD99-211ENST00000623253 NUP160Q12769 1436 aa28.88■■■□□ 2.21
CD99-211ENST00000623253 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CD99-211ENST00000623253 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.79■■■□□ 2.2
CD99-211ENST00000623253 SHROOM2Q13796 1616 aa28.73■■■□□ 2.19
CD99-211ENST00000623253 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
CD99-211ENST00000623253 JPH4Q96JJ6 628 aa28.68■■■□□ 2.18
CD99-211ENST00000623253 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.8 ms