RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622766.1

MYSM1-208, Transcript of Myb like, SWIRM and MPN domains 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MYSM1, Length 6,020 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYSM1-208	ENST00000622766	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MYSM1-208	ENST00000622766	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MYSM1-208	ENST00000622766	SLC24A1	O60721	1099 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MYSM1-208	ENST00000622766	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MYSM1-208	ENST00000622766	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MYSM1-208	ENST00000622766	POTED	Q86YR6	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MYSM1-208	ENST00000622766	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MYSM1-208	ENST00000622766	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MYSM1-208	ENST00000622766	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MYSM1-208	ENST00000622766	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MYSM1-208	ENST00000622766	KCNA4	P22459	653 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MYSM1-208	ENST00000622766	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
MYSM1-208	ENST00000622766	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
MYSM1-208	ENST00000622766	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
MYSM1-208	ENST00000622766	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
MYSM1-208	ENST00000622766	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		4.39	□□□□□ -1.71
MYSM1-208	ENST00000622766	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MYSM1-208	ENST00000622766	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MYSM1-208	ENST00000622766	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MYSM1-208	ENST00000622766	MYT1	Q01538	1121 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MYSM1-208	ENST00000622766	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MYSM1-208	ENST00000622766	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MYSM1-208	ENST00000622766	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MYSM1-208	ENST00000622766	BCAN	Q96GW7	911 aa		4.29	□□□□□ -1.72
MYSM1-208	ENST00000622766	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MYSM1-208	ENST00000622766	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MYSM1-208	ENST00000622766	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MYSM1-208	ENST00000622766	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MYSM1-208	ENST00000622766	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MYSM1-208	ENST00000622766	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MYSM1-208	ENST00000622766	FKBP8	Q14318	412 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MYSM1-208	ENST00000622766	C14orf37	Q86TY3	774 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MYSM1-208	ENST00000622766	ARX	Q96QS3	562 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYSM1-208	ENST00000622766	ADRA2B	P18089	450 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MYSM1-208	ENST00000622766	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MYSM1-208	ENST00000622766	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MYSM1-208	ENST00000622766	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYSM1-208	ENST00000622766	PLCB2	Q00722	1185 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MYSM1-208	ENST00000622766	NBR1	Q14596	966 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MYSM1-208	ENST00000622766	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MYSM1-208	ENST00000622766	CFAP44	Q96MT7	982 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MYSM1-208	ENST00000622766	ARID3A	Q99856	593 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MYSM1-208	ENST00000622766	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MYSM1-208	ENST00000622766	MSH5	O43196	834 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MYSM1-208	ENST00000622766	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MYSM1-208	ENST00000622766	KLHL34	Q8N239	644 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MYSM1-208	ENST00000622766	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MYSM1-208	ENST00000622766	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
MYSM1-208	ENST00000622766	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYSM1-208	ENST00000622766	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MYSM1-208	ENST00000622766	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MYSM1-208	ENST00000622766	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MYSM1-208	ENST00000622766	ZBTB22	O15209	634 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MYSM1-208	ENST00000622766	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MYSM1-208	ENST00000622766	APLP2	Q06481	763 aa		3.95	□□□□□ -1.78
MYSM1-208	ENST00000622766	FBLN2	P98095	1184 aa		3.95	□□□□□ -1.78
MYSM1-208	ENST00000622766	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
MYSM1-208	ENST00000622766	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		3.94	□□□□□ -1.78
MYSM1-208	ENST00000622766	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		3.93	□□□□□ -1.78
MYSM1-208	ENST00000622766	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
MYSM1-208	ENST00000622766	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MYSM1-208	ENST00000622766	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MYSM1-208	ENST00000622766	FBXO3	Q9UK99	471 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MYSM1-208	ENST00000622766	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MYSM1-208	ENST00000622766	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MYSM1-208	ENST00000622766	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MYSM1-208	ENST00000622766	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MYSM1-208	ENST00000622766	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
MYSM1-208	ENST00000622766	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MYSM1-208	ENST00000622766	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MYSM1-208	ENST00000622766	USP35	Q9P2H5	1018 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MYSM1-208	ENST00000622766	NEUROD2	Q15784	382 aa		3.84	□□□□□ -1.8
MYSM1-208	ENST00000622766	PLEKHG5	O94827	1062 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MYSM1-208	ENST00000622766	TRIM41	Q8WV44	630 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MYSM1-208	ENST00000622766	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MYSM1-208	ENST00000622766	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
MYSM1-208	ENST00000622766	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
MYSM1-208	ENST00000622766	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MYSM1-208	ENST00000622766	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MYSM1-208	ENST00000622766	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MYSM1-208	ENST00000622766	RAD21	O60216	631 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MYSM1-208	ENST00000622766	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	ARID3C	A6NKF2	412 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	NEFL	P07196	543 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	APBB1	O00213	710 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	WDR70	Q9NW82	654 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	FOXD1	Q16676	465 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MYSM1-208	ENST00000622766	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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