RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621995.1

RAD9A-210, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component A, humanhuman

TSL 3

Gene RAD9A, Length 912 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9A-210ENST00000621995 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.97■■■■■ 7.83
RAD9A-210ENST00000621995 ABCC9O60706 1549 aa58.22■■■■■ 6.91
RAD9A-210ENST00000621995 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.61■■■■■ 6.81
RAD9A-210ENST00000621995 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.23■■■■■ 6.43
RAD9A-210ENST00000621995 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.14■■■■■ 6.42
RAD9A-210ENST00000621995 NACADO15069 1562 aa54.63■■■■■ 6.34
RAD9A-210ENST00000621995 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.22■■■■■ 6.27
RAD9A-210ENST00000621995 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.14■■■■■ 6.26
RAD9A-210ENST00000621995 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.9■■■■■ 6.22
RAD9A-210ENST00000621995 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.72■■■■■ 6.19
RAD9A-210ENST00000621995 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.61■■■■■ 6.17
RAD9A-210ENST00000621995 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.88■■■■■ 6.06
RAD9A-210ENST00000621995 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.81■■■■■ 6.04
RAD9A-210ENST00000621995 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.8■■■■■ 6.04
RAD9A-210ENST00000621995 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.57■■■■■ 6.01
RAD9A-210ENST00000621995 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.51■■■■■ 6
RAD9A-210ENST00000621995 SCRIBQ14160 1630 aa52.46■■■■■ 5.99
RAD9A-210ENST00000621995 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.31■■■■■ 5.96
RAD9A-210ENST00000621995 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.12■■■■■ 5.77
RAD9A-210ENST00000621995 NCAPD3P42695 1498 aa50.49■■■■■ 5.67
RAD9A-210ENST00000621995 CUX2O14529 1486 aa50.43■■■■■ 5.66
RAD9A-210ENST00000621995 ERCC6Q03468 1493 aa50.27■■■■■ 5.64
RAD9A-210ENST00000621995 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.24■■■■■ 5.63
RAD9A-210ENST00000621995 SMARCA2P51531 1590 aa50.03■■■■■ 5.6
RAD9A-210ENST00000621995 HMGXB3Q12766 1538 aa50.01■■■■■ 5.6
RAD9A-210ENST00000621995 SMARCA4P51532 1647 aa50■■■■■ 5.6
RAD9A-210ENST00000621995 NESP48681 1621 aa49.87■■■■■ 5.57
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RAD9A-210ENST00000621995 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.66■■■■■ 5.54
RAD9A-210ENST00000621995 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.55■■■■■ 5.52
RAD9A-210ENST00000621995 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.46■■■■■ 5.51
RAD9A-210ENST00000621995 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.4■■■■■ 5.5
RAD9A-210ENST00000621995 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.29■■■■■ 5.48
RAD9A-210ENST00000621995 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.16■■■■■ 5.46
RAD9A-210ENST00000621995 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.15■■■■■ 5.46
RAD9A-210ENST00000621995 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.91■■■■■ 5.42
RAD9A-210ENST00000621995 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.75■■■■■ 5.4
RAD9A-210ENST00000621995 WDR62O43379 1518 aa48.66■■■■■ 5.38
RAD9A-210ENST00000621995 WIZO95785 1651 aa48.64■■■■■ 5.38
RAD9A-210ENST00000621995 TRIM41Q8WV44 630 aa48.58■■■■■ 5.37
RAD9A-210ENST00000621995 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.43■■■■■ 5.34
RAD9A-210ENST00000621995 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.34■■■■■ 5.33
RAD9A-210ENST00000621995 CFTRP13569 1480 aa48.23■■■■■ 5.31
RAD9A-210ENST00000621995 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.07■■■■■ 5.28
RAD9A-210ENST00000621995 OSCARQ8IYS5 282 aa48.05■■■■■ 5.28
RAD9A-210ENST00000621995 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48■■■■■ 5.27
RAD9A-210ENST00000621995 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.98■■■■■ 5.27
RAD9A-210ENST00000621995 PRDM2Q13029 1718 aa47.61■■■■■ 5.21
RAD9A-210ENST00000621995 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.51■■■■■ 5.2
RAD9A-210ENST00000621995 IFT140Q96RY7 1462 aa47.5■■■■■ 5.19
RAD9A-210ENST00000621995 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.48■■■■■ 5.19
RAD9A-210ENST00000621995 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.46■■■■■ 5.19
RAD9A-210ENST00000621995 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.46■■■■■ 5.19
RAD9A-210ENST00000621995 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.46■■■■■ 5.19
RAD9A-210ENST00000621995 TOPBP1Q92547 1522 aa47.36■■■■■ 5.17
RAD9A-210ENST00000621995 ARHGEF11O15085 1522 aa47.26■■■■■ 5.16
RAD9A-210ENST00000621995 ABCC8Q09428 1581 aa47.2■■■■■ 5.15
RAD9A-210ENST00000621995 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
RAD9A-210ENST00000621995 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.11■■■■■ 5.13
RAD9A-210ENST00000621995 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.01■■■■■ 5.12
RAD9A-210ENST00000621995 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47■■■■■ 5.11
RAD9A-210ENST00000621995 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.96■■■■■ 5.11
RAD9A-210ENST00000621995 CHD1O14646 1710 aa46.92■■■■■ 5.1
RAD9A-210ENST00000621995 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.88■■■■■ 5.1
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RAD9A-210ENST00000621995 FBLN2P98095 1184 aa46.78■■■■■ 5.08
RAD9A-210ENST00000621995 ARAP1Q96P48 1450 aa46.76■■■■■ 5.08
RAD9A-210ENST00000621995 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.7■■■■■ 5.07
RAD9A-210ENST00000621995 SOGA1O94964 1423 aa46.62■■■■■ 5.05
RAD9A-210ENST00000621995 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.61■■■■■ 5.05
RAD9A-210ENST00000621995 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.59■■■■■ 5.05
RAD9A-210ENST00000621995 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.48■■■■■ 5.03
RAD9A-210ENST00000621995 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.45■■■■■ 5.03
RAD9A-210ENST00000621995 WDR97A6NE52 1622 aa46.44■■■■■ 5.03
RAD9A-210ENST00000621995 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.41■■■■■ 5.02
RAD9A-210ENST00000621995 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.35■■■■■ 5.01
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RAD9A-210ENST00000621995 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
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RAD9A-210ENST00000621995 GRIN2BQ13224 1484 aa46.27■■■■■ 5
RAD9A-210ENST00000621995 SYNJ2O15056 1496 aa46.19■■■■■ 4.99
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RAD9A-210ENST00000621995 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.91■■■■■ 4.94
RAD9A-210ENST00000621995 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.88■■■■■ 4.93
RAD9A-210ENST00000621995 GRIN2AQ12879 1464 aa45.68■■■■■ 4.9
RAD9A-210ENST00000621995 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.66■■■■■ 4.9
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RAD9A-210ENST00000621995 NUP160Q12769 1436 aa45.57■■■■■ 4.89
RAD9A-210ENST00000621995 ADAMTS12P58397 1594 aa45.57■■■■■ 4.89
RAD9A-210ENST00000621995 CEP170Q5SW79 1584 aa45.54■■■■■ 4.88
RAD9A-210ENST00000621995 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.43■■■■■ 4.86
RAD9A-210ENST00000621995 SHROOM2Q13796 1616 aa45.42■■■■■ 4.86
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RAD9A-210ENST00000621995 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.41■■■■■ 4.86
RAD9A-210ENST00000621995 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.31■■■■■ 4.84
RAD9A-210ENST00000621995 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
RAD9A-210ENST00000621995 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.12■■■■■ 4.81
RAD9A-210ENST00000621995 JPH4Q96JJ6 628 aa45.11■■■■■ 4.81
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