RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619337.4

YTHDF3-211, Transcript of YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene YTHDF3, Length 545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3-211ENST00000619337 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.07■■■■■ 6.73
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YTHDF3-211ENST00000619337 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.53■■■■■ 5.36
YTHDF3-211ENST00000619337 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.19■■■■■ 5.3
YTHDF3-211ENST00000619337 NACADO15069 1562 aa48.03■■■■■ 5.28
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YTHDF3-211ENST00000619337 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.15■■■■■ 5.14
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YTHDF3-211ENST00000619337 SCRIBQ14160 1630 aa46.39■■■■■ 5.02
YTHDF3-211ENST00000619337 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.29■■■■■ 5
YTHDF3-211ENST00000619337 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.27■■■■■ 5
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YTHDF3-211ENST00000619337 NCAPD3P42695 1498 aa44.35■■■■■ 4.69
YTHDF3-211ENST00000619337 SMARCA4P51532 1647 aa44.29■■■■■ 4.68
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YTHDF3-211ENST00000619337 SMARCA2P51531 1590 aa44.13■■■■■ 4.65
YTHDF3-211ENST00000619337 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.97■■■■■ 4.63
YTHDF3-211ENST00000619337 HMGXB3Q12766 1538 aa43.97■■■■■ 4.63
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YTHDF3-211ENST00000619337 NESP48681 1621 aa43.81■■■■■ 4.6
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YTHDF3-211ENST00000619337 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.46■■■■■ 4.55
YTHDF3-211ENST00000619337 WIZO95785 1651 aa43.46■■■■■ 4.55
YTHDF3-211ENST00000619337 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
YTHDF3-211ENST00000619337 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.26■■■■■ 4.52
YTHDF3-211ENST00000619337 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.19■■■■■ 4.5
YTHDF3-211ENST00000619337 CADPSQ9ULU8 1353 aa43■■■■■ 4.47
YTHDF3-211ENST00000619337 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
YTHDF3-211ENST00000619337 TRIM41Q8WV44 630 aa42.98■■■■■ 4.47
YTHDF3-211ENST00000619337 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.92■■■■■ 4.46
YTHDF3-211ENST00000619337 WDR62O43379 1518 aa42.83■■■■■ 4.45
YTHDF3-211ENST00000619337 CFTRP13569 1480 aa42.6■■■■■ 4.41
YTHDF3-211ENST00000619337 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.6■■■■■ 4.41
YTHDF3-211ENST00000619337 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.56■■■■■ 4.4
YTHDF3-211ENST00000619337 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.47■■■■■ 4.39
YTHDF3-211ENST00000619337 OSCARQ8IYS5 282 aa42.36■■■■■ 4.37
YTHDF3-211ENST00000619337 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
YTHDF3-211ENST00000619337 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
YTHDF3-211ENST00000619337 PRDM2Q13029 1718 aa42.05■■■■■ 4.32
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YTHDF3-211ENST00000619337 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.85■■■■■ 4.29
YTHDF3-211ENST00000619337 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.85■■■■■ 4.29
YTHDF3-211ENST00000619337 IFT140Q96RY7 1462 aa41.79■■■■■ 4.28
YTHDF3-211ENST00000619337 ABCC8Q09428 1581 aa41.76■■■■■ 4.27
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YTHDF3-211ENST00000619337 ARHGEF11O15085 1522 aa41.68■■■■■ 4.26
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YTHDF3-211ENST00000619337 SOGA1O94964 1423 aa41.28■■■■■ 4.2
YTHDF3-211ENST00000619337 CUX1P39880 1505 aa41.26■■■■■ 4.2
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YTHDF3-211ENST00000619337 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.21■■■■■ 4.19
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YTHDF3-211ENST00000619337 FBLN2P98095 1184 aa41.13■■■■■ 4.17
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YTHDF3-211ENST00000619337 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.83■■■■■ 4.13
YTHDF3-211ENST00000619337 TOP2BQ02880 1626 aa40.81■■■■■ 4.12
YTHDF3-211ENST00000619337 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.78■■■■■ 4.12
YTHDF3-211ENST00000619337 GRIN2BQ13224 1484 aa40.77■■■■■ 4.12
YTHDF3-211ENST00000619337 SYNJ1O43426 1573 aa40.77■■■■■ 4.12
YTHDF3-211ENST00000619337 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.75■■■■■ 4.11
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YTHDF3-211ENST00000619337 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
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YTHDF3-211ENST00000619337 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
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YTHDF3-211ENST00000619337 ADAMTS12P58397 1594 aa40.21■■■■■ 4.03
YTHDF3-211ENST00000619337 GRIN2AQ12879 1464 aa40.2■■■■■ 4.03
YTHDF3-211ENST00000619337 KIF27Q86VH2 1401 aa40.19■■■■■ 4.02
YTHDF3-211ENST00000619337 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.07■■■■■ 4.01
YTHDF3-211ENST00000619337 IGF1RP08069 1367 aa40.05■■■■■ 4
YTHDF3-211ENST00000619337 NUP160Q12769 1436 aa40.03■■■■■ 4
YTHDF3-211ENST00000619337 CEP170Q5SW79 1584 aa40.01■■■■■ 4
YTHDF3-211ENST00000619337 SHROOM2Q13796 1616 aa39.9■■■■□ 3.98
YTHDF3-211ENST00000619337 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.84■■■■□ 3.97
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