RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618351.1

ACACA-242, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ACACA, Length 716 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACA-242ENST00000618351 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.78■■■■■ 5.88
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ACACA-242ENST00000618351 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.37■■■■■ 4.69
ACACA-242ENST00000618351 NACADO15069 1562 aa44.03■■■■■ 4.64
ACACA-242ENST00000618351 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.75■■■■■ 4.59
ACACA-242ENST00000618351 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.52■■■■■ 4.56
ACACA-242ENST00000618351 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.48■■■■■ 4.55
ACACA-242ENST00000618351 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.41■■■■■ 4.54
ACACA-242ENST00000618351 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.26■■■■■ 4.52
ACACA-242ENST00000618351 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.12■■■■■ 4.49
ACACA-242ENST00000618351 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
ACACA-242ENST00000618351 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.81■■■■■ 4.44
ACACA-242ENST00000618351 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.53■■■■■ 4.4
ACACA-242ENST00000618351 SCRIBQ14160 1630 aa42.4■■■■■ 4.38
ACACA-242ENST00000618351 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.16■■■■■ 4.34
ACACA-242ENST00000618351 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
ACACA-242ENST00000618351 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.99■■■■■ 4.31
ACACA-242ENST00000618351 NCAPD3P42695 1498 aa40.61■■■■■ 4.09
ACACA-242ENST00000618351 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.47■■■■■ 4.07
ACACA-242ENST00000618351 SMARCA4P51532 1647 aa40.46■■■■■ 4.07
ACACA-242ENST00000618351 SMARCA2P51531 1590 aa40.39■■■■■ 4.06
ACACA-242ENST00000618351 HMGXB3Q12766 1538 aa40.37■■■■■ 4.05
ACACA-242ENST00000618351 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.26■■■■■ 4.04
ACACA-242ENST00000618351 CUX2O14529 1486 aa40.26■■■■■ 4.03
ACACA-242ENST00000618351 ERCC6Q03468 1493 aa40.23■■■■■ 4.03
ACACA-242ENST00000618351 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
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ACACA-242ENST00000618351 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.45■■■■□ 3.91
ACACA-242ENST00000618351 WIZO95785 1651 aa39.44■■■■□ 3.9
ACACA-242ENST00000618351 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.33■■■■□ 3.89
ACACA-242ENST00000618351 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.17■■■■□ 3.86
ACACA-242ENST00000618351 WDR62O43379 1518 aa39.13■■■■□ 3.85
ACACA-242ENST00000618351 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.99■■■■□ 3.83
ACACA-242ENST00000618351 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.98■■■■□ 3.83
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ACACA-242ENST00000618351 CFTRP13569 1480 aa38.91■■■■□ 3.82
ACACA-242ENST00000618351 PRDM2Q13029 1718 aa38.66■■■■□ 3.78
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ACACA-242ENST00000618351 TRIM41Q8WV44 630 aa38.4■■■■□ 3.74
ACACA-242ENST00000618351 OSCARQ8IYS5 282 aa38.26■■■■□ 3.72
ACACA-242ENST00000618351 IFT140Q96RY7 1462 aa38.21■■■■□ 3.71
ACACA-242ENST00000618351 TOPBP1Q92547 1522 aa38.19■■■■□ 3.7
ACACA-242ENST00000618351 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
ACACA-242ENST00000618351 ABCC8Q09428 1581 aa38.08■■■■□ 3.69
ACACA-242ENST00000618351 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.08■■■■□ 3.69
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ACACA-242ENST00000618351 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.94■■■■□ 3.66
ACACA-242ENST00000618351 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.94■■■■□ 3.66
ACACA-242ENST00000618351 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
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ACACA-242ENST00000618351 ARHGEF11O15085 1522 aa37.79■■■■□ 3.64
ACACA-242ENST00000618351 CHD1O14646 1710 aa37.78■■■■□ 3.64
ACACA-242ENST00000618351 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.75■■■■□ 3.63
ACACA-242ENST00000618351 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.62■■■■□ 3.61
ACACA-242ENST00000618351 WDR97A6NE52 1622 aa37.54■■■■□ 3.6
ACACA-242ENST00000618351 SOGA1O94964 1423 aa37.54■■■■□ 3.6
ACACA-242ENST00000618351 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.54■■■■□ 3.6
ACACA-242ENST00000618351 CUX1P39880 1505 aa37.51■■■■□ 3.59
ACACA-242ENST00000618351 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
ACACA-242ENST00000618351 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.42■■■■□ 3.58
ACACA-242ENST00000618351 FBLN2P98095 1184 aa37.42■■■■□ 3.58
ACACA-242ENST00000618351 ARAP1Q96P48 1450 aa37.41■■■■□ 3.58
ACACA-242ENST00000618351 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.36■■■■□ 3.57
ACACA-242ENST00000618351 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
ACACA-242ENST00000618351 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.32■■■■□ 3.57
ACACA-242ENST00000618351 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
ACACA-242ENST00000618351 GRIN2BQ13224 1484 aa37.28■■■■□ 3.56
ACACA-242ENST00000618351 SYNJ1O43426 1573 aa37.25■■■■□ 3.55
ACACA-242ENST00000618351 PBRM1Q86U86 1689 aa37.25■■■■□ 3.55
ACACA-242ENST00000618351 SYNJ2O15056 1496 aa37.2■■■■□ 3.54
ACACA-242ENST00000618351 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
ACACA-242ENST00000618351 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.14■■■■□ 3.54
ACACA-242ENST00000618351 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.13■■■■□ 3.53
ACACA-242ENST00000618351 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.11■■■■□ 3.53
ACACA-242ENST00000618351 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
ACACA-242ENST00000618351 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.93■■■■□ 3.5
ACACA-242ENST00000618351 TOP2BQ02880 1626 aa36.89■■■■□ 3.5
ACACA-242ENST00000618351 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.87■■■■□ 3.49
ACACA-242ENST00000618351 ADAMTS12P58397 1594 aa36.86■■■■□ 3.49
ACACA-242ENST00000618351 GRIN2AQ12879 1464 aa36.82■■■■□ 3.49
ACACA-242ENST00000618351 CEP170Q5SW79 1584 aa36.74■■■■□ 3.47
ACACA-242ENST00000618351 NUP160Q12769 1436 aa36.71■■■■□ 3.47
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ACACA-242ENST00000618351 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.66■■■■□ 3.46
ACACA-242ENST00000618351 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.65■■■■□ 3.46
ACACA-242ENST00000618351 SHROOM2Q13796 1616 aa36.64■■■■□ 3.46
ACACA-242ENST00000618351 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.36■■■■□ 3.41
ACACA-242ENST00000618351 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
ACACA-242ENST00000618351 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.22■■■■□ 3.39
ACACA-242ENST00000618351 JPH4Q96JJ6 628 aa36.21■■■■□ 3.39
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