RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616614.4

FMR1-216, Transcript of fragile X mental retardation 1, humanhuman

TSL 5

Gene FMR1, Length 1,409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1-216ENST00000616614 NISCHQ9Y2I1 1504 aa76.79■■■■■ 9.88
FMR1-216ENST00000616614 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa67.93■■■■■ 8.46
FMR1-216ENST00000616614 ABCC9O60706 1549 aa66.35■■■■■ 8.21
FMR1-216ENST00000616614 DCAF8L2P0C7V8 631 aa64.1■■■■■ 7.85
FMR1-216ENST00000616614 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP64.04■■■■■ 7.84
FMR1-216ENST00000616614 NACADO15069 1562 aa63.86■■■■■ 7.81
FMR1-216ENST00000616614 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa63.83■■■■■ 7.81
FMR1-216ENST00000616614 MYO15BQ96JP2 1530 aa63.59■■■■■ 7.77
FMR1-216ENST00000616614 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa63.48■■■■■ 7.75
FMR1-216ENST00000616614 UNC13AQ9UPW8 1703 aa62.37■■■■■ 7.57
FMR1-216ENST00000616614 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP62.16■■■■■ 7.54
FMR1-216ENST00000616614 SCRIBQ14160 1630 aa62.16■■■■■ 7.54
FMR1-216ENST00000616614 BICRAQ9NZM4 1560 aa62.01■■■■■ 7.52
FMR1-216ENST00000616614 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa61.21■■■■■ 7.39
FMR1-216ENST00000616614 DNAJC5BQ9UF47 199 aa60.74■■■■■ 7.31
FMR1-216ENST00000616614 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP60.29■■■■■ 7.24
FMR1-216ENST00000616614 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa59.96■■■■■ 7.19
FMR1-216ENST00000616614 CECR2Q9BXF3 1484 aa59.89■■■■■ 7.18
FMR1-216ENST00000616614 SMARCA4P51532 1647 aa59.45■■■■■ 7.11
FMR1-216ENST00000616614 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP59.42■■■■■ 7.1
FMR1-216ENST00000616614 MROH2BQ7Z745 1585 aa59.24■■■■■ 7.07
FMR1-216ENST00000616614 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa59.12■■■■■ 7.05
FMR1-216ENST00000616614 NCAPD3P42695 1498 aa59.01■■■■■ 7.04
FMR1-216ENST00000616614 SMARCA2P51531 1590 aa58.94■■■■■ 7.03
FMR1-216ENST00000616614 PEG3Q9GZU2 1588 aa58.87■■■■■ 7.01
FMR1-216ENST00000616614 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP58.72■■■■■ 6.99
FMR1-216ENST00000616614 HMGXB3Q12766 1538 aa58.67■■■■■ 6.98
FMR1-216ENST00000616614 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP58.59■■■■■ 6.97
FMR1-216ENST00000616614 WIZO95785 1651 aa58.57■■■■■ 6.97
FMR1-216ENST00000616614 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP57.93■■■■■ 6.86
FMR1-216ENST00000616614 NESP48681 1621 aa57.56■■■■■ 6.8
FMR1-216ENST00000616614 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP57.54■■■■■ 6.8
FMR1-216ENST00000616614 CCDC88BA6NC98 1476 aa57.34■■■■■ 6.77
FMR1-216ENST00000616614 CADPSQ9ULU8 1353 aa57.33■■■■■ 6.77
FMR1-216ENST00000616614 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa57.29■■■■■ 6.76
FMR1-216ENST00000616614 CFTRP13569 1480 aa57.05■■■■■ 6.72
FMR1-216ENST00000616614 ERCC6Q03468 1493 aa57.05■■■■■ 6.72
FMR1-216ENST00000616614 PDS5BQ9NTI5 1447 aa56.94■■■■■ 6.71
FMR1-216ENST00000616614 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa56.73■■■■■ 6.67
FMR1-216ENST00000616614 FANCD2Q9BXW9 1451 aa56.65■■■■■ 6.66
FMR1-216ENST00000616614 CEP164Q9UPV0 1460 aa56.49■■■■■ 6.63
FMR1-216ENST00000616614 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP56.48■■■■■ 6.63
FMR1-216ENST00000616614 PRDM2Q13029 1718 aa56.41■■■■■ 6.62
FMR1-216ENST00000616614 MRC2Q9UBG0 1479 aa56.35■■■■■ 6.61
FMR1-216ENST00000616614 CUX2O14529 1486 aa56.3■■■■■ 6.6
FMR1-216ENST00000616614 WDR62O43379 1518 aa56.15■■■■■ 6.58
FMR1-216ENST00000616614 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP56.1■■■■■ 6.57
FMR1-216ENST00000616614 TOPBP1Q92547 1522 aa55.79■■■■■ 6.52
FMR1-216ENST00000616614 ABCC8Q09428 1581 aa55.69■■■■■ 6.51
FMR1-216ENST00000616614 DNMBPQ6XZF7 1577 aa55.69■■■■■ 6.5
FMR1-216ENST00000616614 CUX1P39880 1505 aa55.54■■■■■ 6.48
FMR1-216ENST00000616614 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP55.35■■■■■ 6.45
FMR1-216ENST00000616614 IFT140Q96RY7 1462 aa55.31■■■■■ 6.44
FMR1-216ENST00000616614 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP55.29■■■■■ 6.44
FMR1-216ENST00000616614 FGD5Q6ZNL6 1462 aa55.27■■■■■ 6.44
FMR1-216ENST00000616614 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa55.18■■■■■ 6.42
FMR1-216ENST00000616614 SOGA1O94964 1423 aa55.14■■■■■ 6.42
FMR1-216ENST00000616614 SYNJ1O43426 1573 aa55.14■■■■■ 6.42
FMR1-216ENST00000616614 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP55.14■■■■■ 6.42
FMR1-216ENST00000616614 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP55.13■■■■■ 6.42
FMR1-216ENST00000616614 TOP2BQ02880 1626 aa55.07■■■■■ 6.41
FMR1-216ENST00000616614 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa55.03■■■■■ 6.4
FMR1-216ENST00000616614 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP54.87■■■■■ 6.37
FMR1-216ENST00000616614 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP54.85■■■■■ 6.37
FMR1-216ENST00000616614 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP54.81■■■■■ 6.36
FMR1-216ENST00000616614 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa54.73■■■■■ 6.35
FMR1-216ENST00000616614 WDR97A6NE52 1622 aa54.69■■■■■ 6.35
FMR1-216ENST00000616614 GAPVD1Q14C86 1478 aa54.47■■■■■ 6.31
FMR1-216ENST00000616614 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa54.44■■■■■ 6.31
FMR1-216ENST00000616614 GRIN2BQ13224 1484 aa54.4■■■■■ 6.3
FMR1-216ENST00000616614 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa54.32■■■■■ 6.29
FMR1-216ENST00000616614 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.29■■■■■ 6.28
FMR1-216ENST00000616614 TRIM41Q8WV44 630 aa54.27■■■■■ 6.28
FMR1-216ENST00000616614 PBRM1Q86U86 1689 aa54.22■■■■■ 6.27
FMR1-216ENST00000616614 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP54.19■■■■■ 6.26
FMR1-216ENST00000616614 OSCARQ8IYS5 282 aa54.12■■■■■ 6.25
FMR1-216ENST00000616614 FBLN2P98095 1184 aa54.11■■■■■ 6.25
FMR1-216ENST00000616614 KIF27Q86VH2 1401 aa54.08■■■■■ 6.25
FMR1-216ENST00000616614 ERICH3Q5RHP9 1530 aa54.03■■■■■ 6.24
FMR1-216ENST00000616614 SYNJ2O15056 1496 aa54.01■■■■■ 6.24
FMR1-216ENST00000616614 CHD1O14646 1710 aa54■■■■■ 6.24
FMR1-216ENST00000616614 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP54■■■■■ 6.23
FMR1-216ENST00000616614 CHIC1Q5VXU3 224 aa53.93■■■■■ 6.22
FMR1-216ENST00000616614 IGF1RP08069 1367 aa53.93■■■■■ 6.22
FMR1-216ENST00000616614 ADAMTS12P58397 1594 aa53.89■■■■■ 6.22
FMR1-216ENST00000616614 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa53.86■■■■■ 6.21
FMR1-216ENST00000616614 FHAD1B1AJZ9 1412 aa53.85■■■■■ 6.21
FMR1-216ENST00000616614 GRIN2AQ12879 1464 aa53.72■■■■■ 6.19
FMR1-216ENST00000616614 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa53.55■■■■■ 6.16
FMR1-216ENST00000616614 CUL7Q14999 1698 aa53.54■■■■■ 6.16
FMR1-216ENST00000616614 CLASP1Q7Z460 1538 aa53.51■■■■■ 6.16
FMR1-216ENST00000616614 NUP160Q12769 1436 aa53.49■■■■■ 6.15
FMR1-216ENST00000616614 CEP170Q5SW79 1584 aa53.45■■■■■ 6.15
FMR1-216ENST00000616614 CSRNP3Q8WYN3 585 aa53.25■■■■■ 6.11
FMR1-216ENST00000616614 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa53.23■■■■■ 6.11
FMR1-216ENST00000616614 ARHGEF11O15085 1522 aa53.22■■■■■ 6.11
FMR1-216ENST00000616614 EEA1Q15075 1411 aa53.22■■■■■ 6.11
FMR1-216ENST00000616614 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP53.21■■■■■ 6.11
FMR1-216ENST00000616614 PRXQ9BXM0 1461 aa53.19■■■■■ 6.11
FMR1-216ENST00000616614 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa53.16■■■■■ 6.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.8 ms