RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615284.1

SYTL1-209, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2

Gene SYTL1, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-209ENST00000615284 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.44■■■■□ 3.74
SYTL1-209ENST00000615284 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.22■■■■□ 3.07
SYTL1-209ENST00000615284 ABCC9O60706 1549 aa33.55■■■□□ 2.96
SYTL1-209ENST00000615284 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.28■■■□□ 2.76
SYTL1-209ENST00000615284 NACADO15069 1562 aa32.24■■■□□ 2.75
SYTL1-209ENST00000615284 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.21■■■□□ 2.75
SYTL1-209ENST00000615284 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.05■■■□□ 2.72
SYTL1-209ENST00000615284 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
SYTL1-209ENST00000615284 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.85■■■□□ 2.69
SYTL1-209ENST00000615284 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.45■■■□□ 2.63
SYTL1-209ENST00000615284 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.36■■■□□ 2.613e-6■■□□□ 12.4
SYTL1-209ENST00000615284 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.24■■■□□ 2.59
SYTL1-209ENST00000615284 SCRIBQ14160 1630 aa31.13■■■□□ 2.57
SYTL1-209ENST00000615284 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.01■■■□□ 2.56
SYTL1-209ENST00000615284 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.92■■■□□ 2.54
SYTL1-209ENST00000615284 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
SYTL1-209ENST00000615284 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.35■■■□□ 2.45
SYTL1-209ENST00000615284 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.19■■■□□ 2.42
SYTL1-209ENST00000615284 SMARCA4P51532 1647 aa29.82■■■□□ 2.36
SYTL1-209ENST00000615284 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
SYTL1-209ENST00000615284 NCAPD3P42695 1498 aa29.76■■■□□ 2.35
SYTL1-209ENST00000615284 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.73■■■□□ 2.35
SYTL1-209ENST00000615284 SMARCA2P51531 1590 aa29.7■■■□□ 2.35
SYTL1-209ENST00000615284 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.58■■■□□ 2.33
SYTL1-209ENST00000615284 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.57■■■□□ 2.32
SYTL1-209ENST00000615284 HMGXB3Q12766 1538 aa29.56■■■□□ 2.32
SYTL1-209ENST00000615284 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SYTL1-209ENST00000615284 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
SYTL1-209ENST00000615284 WIZO95785 1651 aa29.24■■■□□ 2.27
SYTL1-209ENST00000615284 NESP48681 1621 aa28.98■■■□□ 2.23
SYTL1-209ENST00000615284 ERCC6Q03468 1493 aa28.97■■■□□ 2.23
SYTL1-209ENST00000615284 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.96■■■□□ 2.23
SYTL1-209ENST00000615284 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
SYTL1-209ENST00000615284 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.89■■■□□ 2.22
SYTL1-209ENST00000615284 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.82■■■□□ 2.2
SYTL1-209ENST00000615284 CUX2O14529 1486 aa28.72■■■□□ 2.19
SYTL1-209ENST00000615284 CFTRP13569 1480 aa28.67■■■□□ 2.18
SYTL1-209ENST00000615284 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.64■■■□□ 2.17
SYTL1-209ENST00000615284 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.61■■■□□ 2.17
SYTL1-209ENST00000615284 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SYTL1-209ENST00000615284 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.52■■■□□ 2.16
SYTL1-209ENST00000615284 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.49■■■□□ 2.15
SYTL1-209ENST00000615284 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.46■■■□□ 2.15
SYTL1-209ENST00000615284 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
SYTL1-209ENST00000615284 PRDM2Q13029 1718 aa28.39■■■□□ 2.14
SYTL1-209ENST00000615284 WDR62O43379 1518 aa28.36■■■□□ 2.13
SYTL1-209ENST00000615284 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
SYTL1-209ENST00000615284 ABCC8Q09428 1581 aa28.13■■■□□ 2.09
SYTL1-209ENST00000615284 TOPBP1Q92547 1522 aa28.03■■■□□ 2.08
SYTL1-209ENST00000615284 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.02■■■□□ 2.08
SYTL1-209ENST00000615284 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.99■■■□□ 2.07
SYTL1-209ENST00000615284 IFT140Q96RY7 1462 aa27.92■■■□□ 2.06
SYTL1-209ENST00000615284 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
SYTL1-209ENST00000615284 CUX1P39880 1505 aa27.76■■■□□ 2.03
SYTL1-209ENST00000615284 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
SYTL1-209ENST00000615284 SOGA1O94964 1423 aa27.73■■■□□ 2.03
SYTL1-209ENST00000615284 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
SYTL1-209ENST00000615284 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.7■■■□□ 2.02
SYTL1-209ENST00000615284 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.64■■■□□ 2.02
SYTL1-209ENST00000615284 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
SYTL1-209ENST00000615284 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.6■■■□□ 2.01
SYTL1-209ENST00000615284 OSCARQ8IYS5 282 aa27.59■■■□□ 2.01
SYTL1-209ENST00000615284 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
SYTL1-209ENST00000615284 WDR97A6NE52 1622 aa27.56■■■□□ 2
SYTL1-209ENST00000615284 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
SYTL1-209ENST00000615284 TOP2BQ02880 1626 aa27.52■■■□□ 2
SYTL1-209ENST00000615284 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.49■■□□□ 1.99
SYTL1-209ENST00000615284 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.46■■□□□ 1.99
SYTL1-209ENST00000615284 SYNJ1O43426 1573 aa27.45■■□□□ 1.99
SYTL1-209ENST00000615284 GRIN2BQ13224 1484 aa27.4■■□□□ 1.98
SYTL1-209ENST00000615284 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.38■■□□□ 1.97
SYTL1-209ENST00000615284 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SYTL1-209ENST00000615284 FBLN2P98095 1184 aa27.34■■□□□ 1.97
SYTL1-209ENST00000615284 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.32■■□□□ 1.96
SYTL1-209ENST00000615284 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.3■■□□□ 1.96
SYTL1-209ENST00000615284 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SYTL1-209ENST00000615284 CHD1O14646 1710 aa27.27■■□□□ 1.96
SYTL1-209ENST00000615284 PBRM1Q86U86 1689 aa27.25■■□□□ 1.95
SYTL1-209ENST00000615284 SYNJ2O15056 1496 aa27.23■■□□□ 1.95
SYTL1-209ENST00000615284 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.14■■□□□ 1.94
SYTL1-209ENST00000615284 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.07■■□□□ 1.92
SYTL1-209ENST00000615284 KIF27Q86VH2 1401 aa27.06■■□□□ 1.92
SYTL1-209ENST00000615284 ADAMTS12P58397 1594 aa27.04■■□□□ 1.92
SYTL1-209ENST00000615284 ARHGEF11O15085 1522 aa27.02■■□□□ 1.92
SYTL1-209ENST00000615284 GRIN2AQ12879 1464 aa27.02■■□□□ 1.92
SYTL1-209ENST00000615284 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.01■■□□□ 1.92
SYTL1-209ENST00000615284 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.01■■□□□ 1.92
SYTL1-209ENST00000615284 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.01■■□□□ 1.92
SYTL1-209ENST00000615284 CLASP1Q7Z460 1538 aa27■■□□□ 1.91
SYTL1-209ENST00000615284 TRIM41Q8WV44 630 aa26.98■■□□□ 1.91
SYTL1-209ENST00000615284 IGF1RP08069 1367 aa26.96■■□□□ 1.91
SYTL1-209ENST00000615284 NUP160Q12769 1436 aa26.91■■□□□ 1.9
SYTL1-209ENST00000615284 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.85■■□□□ 1.89
SYTL1-209ENST00000615284 CUL7Q14999 1698 aa26.85■■□□□ 1.89
SYTL1-209ENST00000615284 CEP170Q5SW79 1584 aa26.84■■□□□ 1.89
SYTL1-209ENST00000615284 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.8■■□□□ 1.88
SYTL1-209ENST00000615284 ARAP1Q96P48 1450 aa26.78■■□□□ 1.88
SYTL1-209ENST00000615284 JPH4Q96JJ6 628 aa26.71■■□□□ 1.87
SYTL1-209ENST00000615284 SHROOM2Q13796 1616 aa26.69■■□□□ 1.86
SYTL1-209ENST00000615284 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms