RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614916.1

5S_rRNA.22-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 106 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.59■■■■□ 3.77
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5S_rRNA.22-201ENST00000614916 NACADO15069 1562 aa32.31■■■□□ 2.76
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.15■■■□□ 2.74
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32■■■□□ 2.71
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.69■■■□□ 2.66
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.59■■■□□ 2.65
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5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SCRIBQ14160 1630 aa31.31■■■□□ 2.6
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.28■■■□□ 2.6
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5S_rRNA.22-201ENST00000614916 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.53■■■□□ 2.48
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.35■■■□□ 2.45
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5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SMARCA2P51531 1590 aa29.77■■■□□ 2.36
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.77■■■□□ 2.36
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.7■■■□□ 2.35
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 HMGXB3Q12766 1538 aa29.66■■■□□ 2.34
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 WIZO95785 1651 aa29.43■■■□□ 2.3
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 NESP48681 1621 aa29.22■■■□□ 2.27
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ERCC6Q03468 1493 aa29.04■■■□□ 2.24
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.04■■■□□ 2.24
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.98■■■□□ 2.23
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.86■■■□□ 2.21
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CUX2O14529 1486 aa28.81■■■□□ 2.2
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.8■■■□□ 2.2
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.78■■■□□ 2.2
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CFTRP13569 1480 aa28.78■■■□□ 2.2
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 PRDM2Q13029 1718 aa28.64■■■□□ 2.18
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.63■■■□□ 2.17
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.57■■■□□ 2.16
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.57■■■□□ 2.16
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 WDR62O43379 1518 aa28.49■■■□□ 2.15
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5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ABCC8Q09428 1581 aa28.15■■■□□ 2.1
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5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CUX1P39880 1505 aa27.92■■■□□ 2.06
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5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SOGA1O94964 1423 aa27.81■■■□□ 2.04
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5S_rRNA.22-201ENST00000614916 FBLN2P98095 1184 aa27.42■■□□□ 1.98
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5S_rRNA.22-201ENST00000614916 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.13■■□□□ 1.93
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 KIF27Q86VH2 1401 aa27.13■■□□□ 1.93
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5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CEP170Q5SW79 1584 aa27.01■■□□□ 1.92
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5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ARAP1Q96P48 1450 aa26.98■■□□□ 1.91
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.9■■□□□ 1.9
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.85■■□□□ 1.89
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.84■■□□□ 1.89
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SHROOM2Q13796 1616 aa26.83■■□□□ 1.88
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