RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614791.1

GPX4-211, Transcript of glutathione peroxidase 4, humanhuman

TSL 3

Gene GPX4, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPX4-211ENST00000614791 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.94■■■■■ 7.03
GPX4-211ENST00000614791 ABCC9O60706 1549 aa52.66■■■■■ 6.02
GPX4-211ENST00000614791 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.64■■■■■ 6.02
GPX4-211ENST00000614791 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.1■■■■■ 5.61
GPX4-211ENST00000614791 NACADO15069 1562 aa49.83■■■■■ 5.57
GPX4-211ENST00000614791 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.82■■■■■ 5.57
GPX4-211ENST00000614791 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.43■■■■■ 5.5
GPX4-211ENST00000614791 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.22■■■■■ 5.47
GPX4-211ENST00000614791 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.18■■■■■ 5.46
GPX4-211ENST00000614791 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.88■■■■■ 5.42
GPX4-211ENST00000614791 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.84■■■■■ 5.41
GPX4-211ENST00000614791 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.7■■■■■ 5.39
GPX4-211ENST00000614791 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.66■■■■■ 5.38
GPX4-211ENST00000614791 SCRIBQ14160 1630 aa48.05■■■■■ 5.28
GPX4-211ENST00000614791 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.97■■■■■ 5.27
GPX4-211ENST00000614791 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.51■■■■■ 5.2
GPX4-211ENST00000614791 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
GPX4-211ENST00000614791 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.41■■■■■ 5.18
GPX4-211ENST00000614791 NCAPD3P42695 1498 aa46.1■■■■■ 4.97
GPX4-211ENST00000614791 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.97■■■■■ 4.95
GPX4-211ENST00000614791 SMARCA4P51532 1647 aa45.86■■■■■ 4.93
GPX4-211ENST00000614791 SMARCA2P51531 1590 aa45.76■■■■■ 4.92
GPX4-211ENST00000614791 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
GPX4-211ENST00000614791 HMGXB3Q12766 1538 aa45.65■■■■■ 4.9
GPX4-211ENST00000614791 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
GPX4-211ENST00000614791 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.43■■■■■ 4.86
GPX4-211ENST00000614791 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.43■■■■■ 4.86
GPX4-211ENST00000614791 ERCC6Q03468 1493 aa45.4■■■■■ 4.86
GPX4-211ENST00000614791 NESP48681 1621 aa45.3■■■■■ 4.84
GPX4-211ENST00000614791 CUX2O14529 1486 aa45.25■■■■■ 4.83
GPX4-211ENST00000614791 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.22■■■■■ 4.83
GPX4-211ENST00000614791 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.91■■■■■ 4.78
GPX4-211ENST00000614791 WIZO95785 1651 aa44.83■■■■■ 4.77
GPX4-211ENST00000614791 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.74■■■■■ 4.75
GPX4-211ENST00000614791 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.73■■■■■ 4.75
GPX4-211ENST00000614791 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
GPX4-211ENST00000614791 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
GPX4-211ENST00000614791 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.57■■■■■ 4.73
GPX4-211ENST00000614791 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.29■■■■■ 4.68
GPX4-211ENST00000614791 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
GPX4-211ENST00000614791 CFTRP13569 1480 aa44.21■■■■■ 4.67
GPX4-211ENST00000614791 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.15■■■■■ 4.66
GPX4-211ENST00000614791 WDR62O43379 1518 aa44.15■■■■■ 4.66
GPX4-211ENST00000614791 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.14■■■■■ 4.66
GPX4-211ENST00000614791 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.88■■■■■ 4.61
GPX4-211ENST00000614791 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
GPX4-211ENST00000614791 PRDM2Q13029 1718 aa43.53■■■■■ 4.56
GPX4-211ENST00000614791 OSCARQ8IYS5 282 aa43.38■■■■■ 4.53
GPX4-211ENST00000614791 TOPBP1Q92547 1522 aa43.33■■■■■ 4.53
GPX4-211ENST00000614791 IFT140Q96RY7 1462 aa43.28■■■■■ 4.52
GPX4-211ENST00000614791 TRIM41Q8WV44 630 aa43.26■■■■■ 4.52
GPX4-211ENST00000614791 ABCC8Q09428 1581 aa43.24■■■■■ 4.51
GPX4-211ENST00000614791 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
GPX4-211ENST00000614791 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.13■■■■■ 4.5
GPX4-211ENST00000614791 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.91■■■■■ 4.46
GPX4-211ENST00000614791 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
GPX4-211ENST00000614791 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
GPX4-211ENST00000614791 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
GPX4-211ENST00000614791 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
GPX4-211ENST00000614791 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.8■■■■■ 4.44
GPX4-211ENST00000614791 SOGA1O94964 1423 aa42.78■■■■■ 4.44
GPX4-211ENST00000614791 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
GPX4-211ENST00000614791 CUX1P39880 1505 aa42.66■■■■■ 4.42
GPX4-211ENST00000614791 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.65■■■■■ 4.42
GPX4-211ENST00000614791 FBLN2P98095 1184 aa42.62■■■■■ 4.41
GPX4-211ENST00000614791 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.6■■■■■ 4.41
GPX4-211ENST00000614791 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.6■■■■■ 4.41
GPX4-211ENST00000614791 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.6■■■■■ 4.41
GPX4-211ENST00000614791 ARHGEF11O15085 1522 aa42.53■■■■■ 4.4
GPX4-211ENST00000614791 CHD1O14646 1710 aa42.49■■■■■ 4.39
GPX4-211ENST00000614791 WDR97A6NE52 1622 aa42.39■■■■■ 4.38
GPX4-211ENST00000614791 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.39■■■■■ 4.38
GPX4-211ENST00000614791 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.37■■■■■ 4.37
GPX4-211ENST00000614791 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
GPX4-211ENST00000614791 GRIN2BQ13224 1484 aa42.32■■■■■ 4.37
GPX4-211ENST00000614791 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
GPX4-211ENST00000614791 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.21■■■■■ 4.35
GPX4-211ENST00000614791 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.18■■■■■ 4.34
GPX4-211ENST00000614791 SYNJ2O15056 1496 aa42.16■■■■■ 4.34
GPX4-211ENST00000614791 ARAP1Q96P48 1450 aa42.15■■■■■ 4.34
GPX4-211ENST00000614791 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.1■■■■■ 4.33
GPX4-211ENST00000614791 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.08■■■■■ 4.33
GPX4-211ENST00000614791 SYNJ1O43426 1573 aa42.05■■■■■ 4.32
GPX4-211ENST00000614791 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.02■■■■■ 4.32
GPX4-211ENST00000614791 PBRM1Q86U86 1689 aa42.01■■■■■ 4.32
GPX4-211ENST00000614791 TOP2BQ02880 1626 aa41.96■■■■■ 4.31
GPX4-211ENST00000614791 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.92■■■■■ 4.3
GPX4-211ENST00000614791 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
GPX4-211ENST00000614791 GRIN2AQ12879 1464 aa41.76■■■■■ 4.28
GPX4-211ENST00000614791 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.69■■■■■ 4.26
GPX4-211ENST00000614791 ADAMTS12P58397 1594 aa41.68■■■■■ 4.26
GPX4-211ENST00000614791 NUP160Q12769 1436 aa41.65■■■■■ 4.26
GPX4-211ENST00000614791 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.62■■■■■ 4.25
GPX4-211ENST00000614791 CEP170Q5SW79 1584 aa41.58■■■■■ 4.25
GPX4-211ENST00000614791 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.5■■■■■ 4.23
GPX4-211ENST00000614791 SHROOM2Q13796 1616 aa41.36■■■■■ 4.21
GPX4-211ENST00000614791 JPH4Q96JJ6 628 aa41.34■■■■■ 4.21
GPX4-211ENST00000614791 IGF1RP08069 1367 aa41.3■■■■■ 4.2
GPX4-211ENST00000614791 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.19
GPX4-211ENST00000614791 KIF27Q86VH2 1401 aa41.23■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms