RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601141.5

SIN3B-211, Transcript of SIN3 transcription regulator family member B, humanhuman

TSL 2

Gene SIN3B, Length 1,473 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3B-211ENST00000601141 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.96■■■■■ 5.43
SIN3B-211ENST00000601141 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.31■■■■■ 4.52
SIN3B-211ENST00000601141 ABCC9O60706 1549 aa42.02■■■■■ 4.32
SIN3B-211ENST00000601141 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
SIN3B-211ENST00000601141 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.84■■■■■ 4.13
SIN3B-211ENST00000601141 NACADO15069 1562 aa40.62■■■■■ 4.09
SIN3B-211ENST00000601141 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.58■■■■■ 4.09
SIN3B-211ENST00000601141 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.49■■■■■ 4.07
SIN3B-211ENST00000601141 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.49■■■■■ 4.07
SIN3B-211ENST00000601141 SCRIBQ14160 1630 aa39.64■■■■□ 3.94
SIN3B-211ENST00000601141 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.64■■■■□ 3.94
SIN3B-211ENST00000601141 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.36■■■■□ 3.892e-6■□□□□ 9.6
SIN3B-211ENST00000601141 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.31■■■■□ 3.88
SIN3B-211ENST00000601141 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.07■■■■□ 3.85
SIN3B-211ENST00000601141 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.72
SIN3B-211ENST00000601141 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.11■■■■□ 3.69
SIN3B-211ENST00000601141 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.11■■■■□ 3.69
SIN3B-211ENST00000601141 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38■■■■□ 3.67
SIN3B-211ENST00000601141 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
SIN3B-211ENST00000601141 SMARCA4P51532 1647 aa37.91■■■■□ 3.66
SIN3B-211ENST00000601141 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.77■■■■□ 3.64
SIN3B-211ENST00000601141 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.58■■■■□ 3.61
SIN3B-211ENST00000601141 SMARCA2P51531 1590 aa37.57■■■■□ 3.6
SIN3B-211ENST00000601141 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
SIN3B-211ENST00000601141 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.49■■■■□ 3.59
SIN3B-211ENST00000601141 NCAPD3P42695 1498 aa37.46■■■■□ 3.59
SIN3B-211ENST00000601141 WIZO95785 1651 aa37.39■■■■□ 3.58
SIN3B-211ENST00000601141 HMGXB3Q12766 1538 aa37.34■■■■□ 3.57
SIN3B-211ENST00000601141 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
SIN3B-211ENST00000601141 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
SIN3B-211ENST00000601141 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
SIN3B-211ENST00000601141 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.58■■■■□ 3.45
SIN3B-211ENST00000601141 NESP48681 1621 aa36.49■■■■□ 3.43
SIN3B-211ENST00000601141 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.43■■■■□ 3.42
SIN3B-211ENST00000601141 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.43■■■■□ 3.42
SIN3B-211ENST00000601141 CFTRP13569 1480 aa36.3■■■■□ 3.4
SIN3B-211ENST00000601141 ERCC6Q03468 1493 aa36.21■■■■□ 3.39
SIN3B-211ENST00000601141 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.19■■■■□ 3.38
SIN3B-211ENST00000601141 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.05■■■■□ 3.36
SIN3B-211ENST00000601141 PRDM2Q13029 1718 aa36.05■■■■□ 3.36
SIN3B-211ENST00000601141 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.04■■■■□ 3.36
SIN3B-211ENST00000601141 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.96■■■■□ 3.35
SIN3B-211ENST00000601141 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
SIN3B-211ENST00000601141 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.79■■■■□ 3.32
SIN3B-211ENST00000601141 WDR62O43379 1518 aa35.64■■■■□ 3.3
SIN3B-211ENST00000601141 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
SIN3B-211ENST00000601141 CUX2O14529 1486 aa35.59■■■■□ 3.29
SIN3B-211ENST00000601141 TOPBP1Q92547 1522 aa35.5■■■■□ 3.27
SIN3B-211ENST00000601141 ABCC8Q09428 1581 aa35.5■■■■□ 3.27
SIN3B-211ENST00000601141 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.49■■■■□ 3.27
SIN3B-211ENST00000601141 CUX1P39880 1505 aa35.41■■■■□ 3.26
SIN3B-211ENST00000601141 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.36■■■■□ 3.25
SIN3B-211ENST00000601141 SYNJ1O43426 1573 aa35.25■■■■□ 3.23
SIN3B-211ENST00000601141 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
SIN3B-211ENST00000601141 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.22■■■■□ 3.23
SIN3B-211ENST00000601141 TOP2BQ02880 1626 aa35.21■■■■□ 3.23
SIN3B-211ENST00000601141 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.19■■■■□ 3.22
SIN3B-211ENST00000601141 IFT140Q96RY7 1462 aa35.16■■■■□ 3.22
SIN3B-211ENST00000601141 SOGA1O94964 1423 aa35.11■■■■□ 3.21
SIN3B-211ENST00000601141 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.1■■■■□ 3.21
SIN3B-211ENST00000601141 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
SIN3B-211ENST00000601141 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
SIN3B-211ENST00000601141 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.88■■■■□ 3.18
SIN3B-211ENST00000601141 TRIM41Q8WV44 630 aa34.88■■■■□ 3.17
SIN3B-211ENST00000601141 WDR97A6NE52 1622 aa34.87■■■■□ 3.17
SIN3B-211ENST00000601141 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
SIN3B-211ENST00000601141 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
SIN3B-211ENST00000601141 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.85■■■■□ 3.173e-6■■□□□ 13.8
SIN3B-211ENST00000601141 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.71■■■■□ 3.15
SIN3B-211ENST00000601141 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.71■■■■□ 3.15
SIN3B-211ENST00000601141 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.7■■■■□ 3.15
SIN3B-211ENST00000601141 GRIN2BQ13224 1484 aa34.63■■■■□ 3.13
SIN3B-211ENST00000601141 PBRM1Q86U86 1689 aa34.6■■■■□ 3.13
SIN3B-211ENST00000601141 KIF27Q86VH2 1401 aa34.59■■■■□ 3.13
SIN3B-211ENST00000601141 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.55■■■■□ 3.12
SIN3B-211ENST00000601141 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
SIN3B-211ENST00000601141 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.47■■■■□ 3.11
SIN3B-211ENST00000601141 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.42■■■■□ 3.1
SIN3B-211ENST00000601141 FBLN2P98095 1184 aa34.4■■■■□ 3.1
SIN3B-211ENST00000601141 IGF1RP08069 1367 aa34.36■■■■□ 3.09
SIN3B-211ENST00000601141 ADAMTS12P58397 1594 aa34.36■■■■□ 3.09
SIN3B-211ENST00000601141 SYNJ2O15056 1496 aa34.35■■■■□ 3.09
SIN3B-211ENST00000601141 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
SIN3B-211ENST00000601141 CHD1O14646 1710 aa34.33■■■■□ 3.09
SIN3B-211ENST00000601141 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.32■■■■□ 3.08
SIN3B-211ENST00000601141 CUL7Q14999 1698 aa34.26■■■■□ 3.08
SIN3B-211ENST00000601141 OSCARQ8IYS5 282 aa34.22■■■■□ 3.07
SIN3B-211ENST00000601141 EEA1Q15075 1411 aa34.21■■■■□ 3.07
SIN3B-211ENST00000601141 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.19■■■■□ 3.06
SIN3B-211ENST00000601141 GRIN2AQ12879 1464 aa34.19■■■■□ 3.06
SIN3B-211ENST00000601141 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
SIN3B-211ENST00000601141 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.12■■■■□ 3.05
SIN3B-211ENST00000601141 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.04■■■■□ 3.04
SIN3B-211ENST00000601141 PRXQ9BXM0 1461 aa34.01■■■■□ 3.04
SIN3B-211ENST00000601141 CEP170Q5SW79 1584 aa34■■■■□ 3.03
SIN3B-211ENST00000601141 NUP160Q12769 1436 aa34■■■■□ 3.03
SIN3B-211ENST00000601141 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.95■■■■□ 3.03
SIN3B-211ENST00000601141 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.94■■■■□ 3.02
SIN3B-211ENST00000601141 KIF21BO75037 1637 aa33.82■■■■□ 3.01
SIN3B-211ENST00000601141 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.79■■■■□ 3
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