RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598058.1

USF2-210, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 2

Gene USF2, Length 510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-210ENST00000598058 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.83■■■■■ 5.41
USF2-210ENST00000598058 ABCC9O60706 1549 aa44.27■■■■■ 4.68
USF2-210ENST00000598058 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.93■■■■■ 4.62
USF2-210ENST00000598058 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.04■■■■■ 4.32
USF2-210ENST00000598058 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.86■■■■■ 4.29
USF2-210ENST00000598058 NACADO15069 1562 aa41.69■■■■■ 4.26
USF2-210ENST00000598058 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.34■■■■■ 4.21
USF2-210ENST00000598058 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.17■■■■■ 4.18
USF2-210ENST00000598058 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.08■■■■■ 4.17
USF2-210ENST00000598058 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.87■■■■■ 4.13
USF2-210ENST00000598058 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.76■■■■■ 4.12
USF2-210ENST00000598058 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
USF2-210ENST00000598058 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.38■■■■■ 4.06
USF2-210ENST00000598058 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.36■■■■■ 4.05
USF2-210ENST00000598058 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.97■■■■□ 3.99
USF2-210ENST00000598058 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.95■■■■□ 3.99
USF2-210ENST00000598058 SCRIBQ14160 1630 aa39.93■■■■□ 3.98
USF2-210ENST00000598058 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
USF2-210ENST00000598058 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.81■■■■□ 3.8
USF2-210ENST00000598058 NCAPD3P42695 1498 aa38.54■■■■□ 3.76
USF2-210ENST00000598058 CUX2O14529 1486 aa38.41■■■■□ 3.74
USF2-210ENST00000598058 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.31■■■■□ 3.72
USF2-210ENST00000598058 ERCC6Q03468 1493 aa38.3■■■■□ 3.72
USF2-210ENST00000598058 SMARCA2P51531 1590 aa38.2■■■■□ 3.71
USF2-210ENST00000598058 HMGXB3Q12766 1538 aa38.17■■■■□ 3.7
USF2-210ENST00000598058 SMARCA4P51532 1647 aa38.11■■■■□ 3.69
USF2-210ENST00000598058 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
USF2-210ENST00000598058 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
USF2-210ENST00000598058 NESP48681 1621 aa37.9■■■■□ 3.66
USF2-210ENST00000598058 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.82■■■■□ 3.65
USF2-210ENST00000598058 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.67■■■■□ 3.62
USF2-210ENST00000598058 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
USF2-210ENST00000598058 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.57■■■■□ 3.6
USF2-210ENST00000598058 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.52■■■■□ 3.6
USF2-210ENST00000598058 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.33■■■■□ 3.57
USF2-210ENST00000598058 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.32■■■■□ 3.57
USF2-210ENST00000598058 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.16■■■■□ 3.54
USF2-210ENST00000598058 WDR62O43379 1518 aa37.06■■■■□ 3.52
USF2-210ENST00000598058 WIZO95785 1651 aa37.02■■■■□ 3.52
USF2-210ENST00000598058 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.94■■■■□ 3.5
USF2-210ENST00000598058 TRIM41Q8WV44 630 aa36.86■■■■□ 3.49
USF2-210ENST00000598058 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.86■■■■□ 3.49
USF2-210ENST00000598058 CFTRP13569 1480 aa36.82■■■■□ 3.49
USF2-210ENST00000598058 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
USF2-210ENST00000598058 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
USF2-210ENST00000598058 OSCARQ8IYS5 282 aa36.62■■■■□ 3.45
USF2-210ENST00000598058 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
USF2-210ENST00000598058 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
USF2-210ENST00000598058 IFT140Q96RY7 1462 aa36.24■■■■□ 3.39
USF2-210ENST00000598058 PRDM2Q13029 1718 aa36.23■■■■□ 3.39
USF2-210ENST00000598058 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.23■■■■□ 3.39
USF2-210ENST00000598058 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.38
USF2-210ENST00000598058 ABCC8Q09428 1581 aa36.1■■■■□ 3.37
USF2-210ENST00000598058 TOPBP1Q92547 1522 aa36.1■■■■□ 3.37
USF2-210ENST00000598058 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.02■■■■□ 3.36
USF2-210ENST00000598058 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.02■■■■□ 3.36
USF2-210ENST00000598058 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.02■■■■□ 3.36
USF2-210ENST00000598058 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.93■■■■□ 3.34
USF2-210ENST00000598058 ARHGEF11O15085 1522 aa35.93■■■■□ 3.34
USF2-210ENST00000598058 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
USF2-210ENST00000598058 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.79■■■■□ 3.323e-9■■■■■ 36.3
USF2-210ENST00000598058 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
USF2-210ENST00000598058 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.72■■■■□ 3.31
USF2-210ENST00000598058 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
USF2-210ENST00000598058 FBLN2P98095 1184 aa35.64■■■■□ 3.3
USF2-210ENST00000598058 CHD1O14646 1710 aa35.61■■■■□ 3.29
USF2-210ENST00000598058 SOGA1O94964 1423 aa35.58■■■■□ 3.29
USF2-210ENST00000598058 ARAP1Q96P48 1450 aa35.55■■■■□ 3.28
USF2-210ENST00000598058 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.55■■■■□ 3.28
USF2-210ENST00000598058 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
USF2-210ENST00000598058 WDR97A6NE52 1622 aa35.48■■■■□ 3.27
USF2-210ENST00000598058 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
USF2-210ENST00000598058 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.42■■■■□ 3.26
USF2-210ENST00000598058 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.41■■■■□ 3.26
USF2-210ENST00000598058 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
USF2-210ENST00000598058 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
USF2-210ENST00000598058 GRIN2BQ13224 1484 aa35.33■■■■□ 3.25
USF2-210ENST00000598058 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.32■■■■□ 3.25
USF2-210ENST00000598058 CUX1P39880 1505 aa35.32■■■■□ 3.24
USF2-210ENST00000598058 SYNJ1O43426 1573 aa35.29■■■■□ 3.24
USF2-210ENST00000598058 SYNJ2O15056 1496 aa35.25■■■■□ 3.23
USF2-210ENST00000598058 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.13■■■■□ 3.21
USF2-210ENST00000598058 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.06■■■■□ 3.2
USF2-210ENST00000598058 PBRM1Q86U86 1689 aa34.99■■■■□ 3.19
USF2-210ENST00000598058 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.95■■■■□ 3.19
USF2-210ENST00000598058 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.88■■■■□ 3.17
USF2-210ENST00000598058 GRIN2AQ12879 1464 aa34.84■■■■□ 3.17
USF2-210ENST00000598058 NUP160Q12769 1436 aa34.77■■■■□ 3.16
USF2-210ENST00000598058 ADAMTS12P58397 1594 aa34.72■■■■□ 3.15
USF2-210ENST00000598058 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
USF2-210ENST00000598058 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.71■■■■□ 3.15
USF2-210ENST00000598058 TOP2BQ02880 1626 aa34.67■■■■□ 3.14
USF2-210ENST00000598058 CEP170Q5SW79 1584 aa34.66■■■■□ 3.14
USF2-210ENST00000598058 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.66■■■■□ 3.14
USF2-210ENST00000598058 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.64■■■■□ 3.14
USF2-210ENST00000598058 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.61■■■■□ 3.13
USF2-210ENST00000598058 SHROOM2Q13796 1616 aa34.59■■■■□ 3.13
USF2-210ENST00000598058 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.49■■■■□ 3.11
USF2-210ENST00000598058 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
USF2-210ENST00000598058 JPH4Q96JJ6 628 aa34.43■■■■□ 3.1
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