RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597782.5

TIMM50-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM50, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-210ENST00000597782 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.39■■■■■ 4.22
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TIMM50-210ENST00000597782 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.16■■■■□ 3.54
TIMM50-210ENST00000597782 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.44■■■■□ 3.26
TIMM50-210ENST00000597782 NACADO15069 1562 aa35.17■■■■□ 3.22
TIMM50-210ENST00000597782 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.11■■■■□ 3.21
TIMM50-210ENST00000597782 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.8■■■■□ 3.16
TIMM50-210ENST00000597782 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.65■■■■□ 3.14
TIMM50-210ENST00000597782 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.64■■■■□ 3.14
TIMM50-210ENST00000597782 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.44■■■■□ 3.1
TIMM50-210ENST00000597782 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
TIMM50-210ENST00000597782 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.26■■■■□ 3.07
TIMM50-210ENST00000597782 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.19■■■■□ 3.06
TIMM50-210ENST00000597782 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.95■■■■□ 3.03
TIMM50-210ENST00000597782 SCRIBQ14160 1630 aa33.87■■■■□ 3.01
TIMM50-210ENST00000597782 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.57■■■□□ 2.96
TIMM50-210ENST00000597782 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.54■■■□□ 2.96
TIMM50-210ENST00000597782 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.95
TIMM50-210ENST00000597782 NCAPD3P42695 1498 aa32.44■■■□□ 2.78
TIMM50-210ENST00000597782 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.33■■■□□ 2.77
TIMM50-210ENST00000597782 SMARCA2P51531 1590 aa32.31■■■□□ 2.76
TIMM50-210ENST00000597782 SMARCA4P51532 1647 aa32.29■■■□□ 2.76
TIMM50-210ENST00000597782 ERCC6Q03468 1493 aa32.23■■■□□ 2.75
TIMM50-210ENST00000597782 HMGXB3Q12766 1538 aa32.21■■■□□ 2.75
TIMM50-210ENST00000597782 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
TIMM50-210ENST00000597782 CUX2O14529 1486 aa32.11■■■□□ 2.73
TIMM50-210ENST00000597782 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
TIMM50-210ENST00000597782 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.09■■■□□ 2.73
TIMM50-210ENST00000597782 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.94■■■□□ 2.7
TIMM50-210ENST00000597782 NESP48681 1621 aa31.89■■■□□ 2.7
TIMM50-210ENST00000597782 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.85■■■□□ 2.69
TIMM50-210ENST00000597782 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.74■■■□□ 2.67
TIMM50-210ENST00000597782 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.63■■■□□ 2.65
TIMM50-210ENST00000597782 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
TIMM50-210ENST00000597782 WIZO95785 1651 aa31.49■■■□□ 2.63
TIMM50-210ENST00000597782 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.49■■■□□ 2.63
TIMM50-210ENST00000597782 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.47■■■□□ 2.63
TIMM50-210ENST00000597782 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.31■■■□□ 2.6
TIMM50-210ENST00000597782 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
TIMM50-210ENST00000597782 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.21■■■□□ 2.59
TIMM50-210ENST00000597782 WDR62O43379 1518 aa31.19■■■□□ 2.58
TIMM50-210ENST00000597782 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.14■■■□□ 2.57
TIMM50-210ENST00000597782 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.57
TIMM50-210ENST00000597782 CFTRP13569 1480 aa31.09■■■□□ 2.57
TIMM50-210ENST00000597782 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
TIMM50-210ENST00000597782 TRIM41Q8WV44 630 aa30.77■■■□□ 2.52
TIMM50-210ENST00000597782 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.76■■■□□ 2.51
TIMM50-210ENST00000597782 PRDM2Q13029 1718 aa30.73■■■□□ 2.51
TIMM50-210ENST00000597782 OSCARQ8IYS5 282 aa30.69■■■□□ 2.5
TIMM50-210ENST00000597782 IFT140Q96RY7 1462 aa30.57■■■□□ 2.48
TIMM50-210ENST00000597782 ABCC8Q09428 1581 aa30.54■■■□□ 2.48
TIMM50-210ENST00000597782 TOPBP1Q92547 1522 aa30.52■■■□□ 2.48
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
TIMM50-210ENST00000597782 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.41■■■□□ 2.46
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TIMM50-210ENST00000597782 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
TIMM50-210ENST00000597782 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.19■■■□□ 2.426e-8■■■■□ 23.2
TIMM50-210ENST00000597782 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
TIMM50-210ENST00000597782 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
TIMM50-210ENST00000597782 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.18■■■□□ 2.42
TIMM50-210ENST00000597782 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.18■■■□□ 2.42
TIMM50-210ENST00000597782 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.18■■■□□ 2.42
TIMM50-210ENST00000597782 FBLN2P98095 1184 aa30.14■■■□□ 2.42
TIMM50-210ENST00000597782 SOGA1O94964 1423 aa30.12■■■□□ 2.41
TIMM50-210ENST00000597782 ARHGEF11O15085 1522 aa30.12■■■□□ 2.41
TIMM50-210ENST00000597782 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.07■■■□□ 2.4
TIMM50-210ENST00000597782 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TIMM50-210ENST00000597782 CHD1O14646 1710 aa30.04■■■□□ 2.4
TIMM50-210ENST00000597782 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.03■■■□□ 2.4
TIMM50-210ENST00000597782 WDR97A6NE52 1622 aa29.97■■■□□ 2.39
TIMM50-210ENST00000597782 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.96■■■□□ 2.39
TIMM50-210ENST00000597782 CUX1P39880 1505 aa29.94■■■□□ 2.38
TIMM50-210ENST00000597782 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.92■■■□□ 2.38
TIMM50-210ENST00000597782 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
TIMM50-210ENST00000597782 GRIN2BQ13224 1484 aa29.87■■■□□ 2.37
TIMM50-210ENST00000597782 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
TIMM50-210ENST00000597782 ARAP1Q96P48 1450 aa29.8■■■□□ 2.36
TIMM50-210ENST00000597782 SYNJ1O43426 1573 aa29.79■■■□□ 2.36
TIMM50-210ENST00000597782 SYNJ2O15056 1496 aa29.76■■■□□ 2.35
TIMM50-210ENST00000597782 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.74■■■□□ 2.35
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TIMM50-210ENST00000597782 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.71■■■□□ 2.35
TIMM50-210ENST00000597782 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.67■■■□□ 2.34
TIMM50-210ENST00000597782 PBRM1Q86U86 1689 aa29.66■■■□□ 2.34
TIMM50-210ENST00000597782 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
TIMM50-210ENST00000597782 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.59■■■□□ 2.33
TIMM50-210ENST00000597782 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.52■■■□□ 2.32
TIMM50-210ENST00000597782 TOP2BQ02880 1626 aa29.51■■■□□ 2.31
TIMM50-210ENST00000597782 GRIN2AQ12879 1464 aa29.45■■■□□ 2.31
TIMM50-210ENST00000597782 ADAMTS12P58397 1594 aa29.4■■■□□ 2.3
TIMM50-210ENST00000597782 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.37■■■□□ 2.29
TIMM50-210ENST00000597782 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.32■■■□□ 2.28
TIMM50-210ENST00000597782 NUP160Q12769 1436 aa29.32■■■□□ 2.28
TIMM50-210ENST00000597782 CEP170Q5SW79 1584 aa29.29■■■□□ 2.28
TIMM50-210ENST00000597782 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.2■■■□□ 2.26
TIMM50-210ENST00000597782 SHROOM2Q13796 1616 aa29.15■■■□□ 2.26
TIMM50-210ENST00000597782 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
TIMM50-210ENST00000597782 JPH4Q96JJ6 628 aa29.08■■■□□ 2.25
TIMM50-210ENST00000597782 KIF27Q86VH2 1401 aa29.02■■■□□ 2.24
TIMM50-210ENST00000597782 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.98■■■□□ 2.23
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