RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597709.1

CPAMD8-211, Transcript of C3 and PZP like, alpha-2-macroglobulin domain containing 8, humanhuman

TSL 4

Gene CPAMD8, Length 567 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPAMD8-211ENST00000597709 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.46■■■■■ 5.19
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CPAMD8-211ENST00000597709 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.82■■■■□ 3.8
CPAMD8-211ENST00000597709 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.8■■■■□ 3.8
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CPAMD8-211ENST00000597709 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.5■■■■□ 3.75
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CPAMD8-211ENST00000597709 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.61■■■■□ 3.61
CPAMD8-211ENST00000597709 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.35■■■■□ 3.57
CPAMD8-211ENST00000597709 SMARCA4P51532 1647 aa36.87■■■■□ 3.49
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CPAMD8-211ENST00000597709 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.62■■■■□ 3.45
CPAMD8-211ENST00000597709 SMARCA2P51531 1590 aa36.59■■■■□ 3.45
CPAMD8-211ENST00000597709 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.53■■■■□ 3.44
CPAMD8-211ENST00000597709 HMGXB3Q12766 1538 aa36.5■■■■□ 3.43
CPAMD8-211ENST00000597709 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
CPAMD8-211ENST00000597709 WIZO95785 1651 aa36.2■■■■□ 3.39
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CPAMD8-211ENST00000597709 ERCC6Q03468 1493 aa35.73■■■■□ 3.31
CPAMD8-211ENST00000597709 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.62■■■■□ 3.29
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CPAMD8-211ENST00000597709 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
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CPAMD8-211ENST00000597709 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.17■■■■□ 3.22
CPAMD8-211ENST00000597709 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.15■■■■□ 3.22
CPAMD8-211ENST00000597709 WDR62O43379 1518 aa35.11■■■■□ 3.21
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CPAMD8-211ENST00000597709 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.71■■■■□ 3.15
CPAMD8-211ENST00000597709 TOPBP1Q92547 1522 aa34.65■■■■□ 3.14
CPAMD8-211ENST00000597709 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.57■■■■□ 3.12
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CPAMD8-211ENST00000597709 IFT140Q96RY7 1462 aa34.44■■■■□ 3.1
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CPAMD8-211ENST00000597709 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.06■■■□□ 2.88
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CPAMD8-211ENST00000597709 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.96■■■□□ 2.87
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