RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597020.5

AP2S1-204, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit sigma 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP2S1, Length 707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1-204ENST00000597020 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.62■■■■■ 4.73
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AP2S1-204ENST00000597020 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.38■■■■□ 3.73
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AP2S1-204ENST00000597020 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.84■■■■□ 3.65
AP2S1-204ENST00000597020 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.76■■■■□ 3.64
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AP2S1-204ENST00000597020 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.46■■■■□ 3.59
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AP2S1-204ENST00000597020 SCRIBQ14160 1630 aa36.55■■■■□ 3.44
AP2S1-204ENST00000597020 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.44■■■■□ 3.42
AP2S1-204ENST00000597020 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.34■■■■□ 3.41
AP2S1-204ENST00000597020 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
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AP2S1-204ENST00000597020 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.02■■■■□ 3.2
AP2S1-204ENST00000597020 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.91■■■■□ 3.18
AP2S1-204ENST00000597020 SMARCA2P51531 1590 aa34.9■■■■□ 3.18
AP2S1-204ENST00000597020 CUX2O14529 1486 aa34.89■■■■□ 3.18
AP2S1-204ENST00000597020 ERCC6Q03468 1493 aa34.88■■■■□ 3.17
AP2S1-204ENST00000597020 SMARCA4P51532 1647 aa34.88■■■■□ 3.17
AP2S1-204ENST00000597020 HMGXB3Q12766 1538 aa34.84■■■■□ 3.17
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AP2S1-204ENST00000597020 NESP48681 1621 aa34.51■■■■□ 3.11
AP2S1-204ENST00000597020 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.39■■■■□ 3.1
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AP2S1-204ENST00000597020 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.18■■■■□ 3.06
AP2S1-204ENST00000597020 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.99■■■■□ 3.03
AP2S1-204ENST00000597020 WIZO95785 1651 aa33.97■■■■□ 3.03
AP2S1-204ENST00000597020 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.85■■■■□ 3.01
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AP2S1-204ENST00000597020 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.69■■■□□ 2.98
AP2S1-204ENST00000597020 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.61■■■□□ 2.97
AP2S1-204ENST00000597020 CFTRP13569 1480 aa33.56■■■□□ 2.96
AP2S1-204ENST00000597020 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
AP2S1-204ENST00000597020 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
AP2S1-204ENST00000597020 PRDM2Q13029 1718 aa33.41■■■□□ 2.94
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AP2S1-204ENST00000597020 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
AP2S1-204ENST00000597020 OSCARQ8IYS5 282 aa33.26■■■□□ 2.91
AP2S1-204ENST00000597020 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.11■■■□□ 2.89
AP2S1-204ENST00000597020 IFT140Q96RY7 1462 aa33.03■■■□□ 2.88
AP2S1-204ENST00000597020 ABCC8Q09428 1581 aa32.99■■■□□ 2.87
AP2S1-204ENST00000597020 TOPBP1Q92547 1522 aa32.96■■■□□ 2.87
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AP2S1-204ENST00000597020 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.86■■■□□ 2.85
AP2S1-204ENST00000597020 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.83■■■□□ 2.85
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AP2S1-204ENST00000597020 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.83■■■□□ 2.85
AP2S1-204ENST00000597020 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
AP2S1-204ENST00000597020 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
AP2S1-204ENST00000597020 ARHGEF11O15085 1522 aa32.67■■■□□ 2.82
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AP2S1-204ENST00000597020 SOGA1O94964 1423 aa32.46■■■□□ 2.79
AP2S1-204ENST00000597020 WDR97A6NE52 1622 aa32.45■■■□□ 2.79
AP2S1-204ENST00000597020 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.44■■■□□ 2.78
AP2S1-204ENST00000597020 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.43■■■□□ 2.78
AP2S1-204ENST00000597020 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
AP2S1-204ENST00000597020 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.35■■■□□ 2.77
AP2S1-204ENST00000597020 ARAP1Q96P48 1450 aa32.3■■■□□ 2.76
AP2S1-204ENST00000597020 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.29■■■□□ 2.76
AP2S1-204ENST00000597020 CUX1P39880 1505 aa32.27■■■□□ 2.76
AP2S1-204ENST00000597020 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
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AP2S1-204ENST00000597020 SYNJ1O43426 1573 aa32.24■■■□□ 2.75
AP2S1-204ENST00000597020 GRIN2BQ13224 1484 aa32.22■■■□□ 2.75
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AP2S1-204ENST00000597020 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.18■■■□□ 2.74
AP2S1-204ENST00000597020 PBRM1Q86U86 1689 aa32.15■■■□□ 2.74
AP2S1-204ENST00000597020 SYNJ2O15056 1496 aa32.13■■■□□ 2.73
AP2S1-204ENST00000597020 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.07■■■□□ 2.72
AP2S1-204ENST00000597020 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32■■■□□ 2.71
AP2S1-204ENST00000597020 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.98■■■□□ 2.71
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AP2S1-204ENST00000597020 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.81■■■□□ 2.68
AP2S1-204ENST00000597020 GRIN2AQ12879 1464 aa31.78■■■□□ 2.68
AP2S1-204ENST00000597020 TOP2BQ02880 1626 aa31.78■■■□□ 2.68
AP2S1-204ENST00000597020 ADAMTS12P58397 1594 aa31.75■■■□□ 2.67
AP2S1-204ENST00000597020 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.66■■■□□ 2.66
AP2S1-204ENST00000597020 NUP160Q12769 1436 aa31.66■■■□□ 2.66
AP2S1-204ENST00000597020 CEP170Q5SW79 1584 aa31.66■■■□□ 2.66
AP2S1-204ENST00000597020 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.65■■■□□ 2.66
AP2S1-204ENST00000597020 SHROOM2Q13796 1616 aa31.6■■■□□ 2.65
AP2S1-204ENST00000597020 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.6■■■□□ 2.65
AP2S1-204ENST00000597020 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
AP2S1-204ENST00000597020 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
AP2S1-204ENST00000597020 JPH4Q96JJ6 628 aa31.37■■■□□ 2.61
AP2S1-204ENST00000597020 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.33■■■□□ 2.61
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