RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593944.5

ERF-203, Transcript of ETS2 repressor factor, humanhuman

TSL 4

Gene ERF, Length 555 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERF-203ENST00000593944 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.24■■■■■ 4.99
ERF-203ENST00000593944 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.35■■■■■ 4.21
ERF-203ENST00000593944 ABCC9O60706 1549 aa41.09■■■■■ 4.17
ERF-203ENST00000593944 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.25■■■■□ 3.87
ERF-203ENST00000593944 NACADO15069 1562 aa39.06■■■■□ 3.84
ERF-203ENST00000593944 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.96■■■■□ 3.83
ERF-203ENST00000593944 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.63■■■■□ 3.78
ERF-203ENST00000593944 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
ERF-203ENST00000593944 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.32■■■■□ 3.72
ERF-203ENST00000593944 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.28■■■■□ 3.72
ERF-203ENST00000593944 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.24■■■■□ 3.71
ERF-203ENST00000593944 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.23■■■■□ 3.71
ERF-203ENST00000593944 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.05■■■■□ 3.68
ERF-203ENST00000593944 SCRIBQ14160 1630 aa37.69■■■■□ 3.62
ERF-203ENST00000593944 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.65■■■■□ 3.62
ERF-203ENST00000593944 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
ERF-203ENST00000593944 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.11■■■■□ 3.53
ERF-203ENST00000593944 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.01■■■■□ 3.51
ERF-203ENST00000593944 NCAPD3P42695 1498 aa36.07■■■■□ 3.37
ERF-203ENST00000593944 SMARCA4P51532 1647 aa35.99■■■■□ 3.35
ERF-203ENST00000593944 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.99■■■■□ 3.35
ERF-203ENST00000593944 SMARCA2P51531 1590 aa35.91■■■■□ 3.34
ERF-203ENST00000593944 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
ERF-203ENST00000593944 HMGXB3Q12766 1538 aa35.81■■■■□ 3.32
ERF-203ENST00000593944 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
ERF-203ENST00000593944 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.66■■■■□ 3.3
ERF-203ENST00000593944 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.62■■■■□ 3.29
ERF-203ENST00000593944 ERCC6Q03468 1493 aa35.49■■■■□ 3.27
ERF-203ENST00000593944 NESP48681 1621 aa35.36■■■■□ 3.25
ERF-203ENST00000593944 CUX2O14529 1486 aa35.33■■■■□ 3.25
ERF-203ENST00000593944 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.2■■■■□ 3.23
ERF-203ENST00000593944 WIZO95785 1651 aa35.17■■■■□ 3.22
ERF-203ENST00000593944 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.05■■■■□ 3.2
ERF-203ENST00000593944 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.03■■■■□ 3.2
ERF-203ENST00000593944 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
ERF-203ENST00000593944 CADPSQ9ULU8 1353 aa35■■■■□ 3.19
ERF-203ENST00000593944 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
ERF-203ENST00000593944 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.87■■■■□ 3.17
ERF-203ENST00000593944 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
ERF-203ENST00000593944 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.67■■■■□ 3.14
ERF-203ENST00000593944 CFTRP13569 1480 aa34.65■■■■□ 3.14
ERF-203ENST00000593944 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.6■■■■□ 3.13
ERF-203ENST00000593944 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.58■■■■□ 3.13
ERF-203ENST00000593944 WDR62O43379 1518 aa34.56■■■■□ 3.12
ERF-203ENST00000593944 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.41■■■■□ 3.1
ERF-203ENST00000593944 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
ERF-203ENST00000593944 PRDM2Q13029 1718 aa34.22■■■■□ 3.07
ERF-203ENST00000593944 TOPBP1Q92547 1522 aa33.94■■■■□ 3.02
ERF-203ENST00000593944 ABCC8Q09428 1581 aa33.94■■■■□ 3.02
ERF-203ENST00000593944 IFT140Q96RY7 1462 aa33.9■■■■□ 3.02
ERF-203ENST00000593944 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.85■■■■□ 3.01
ERF-203ENST00000593944 OSCARQ8IYS5 282 aa33.8■■■■□ 3
ERF-203ENST00000593944 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
ERF-203ENST00000593944 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
ERF-203ENST00000593944 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
ERF-203ENST00000593944 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
ERF-203ENST00000593944 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
ERF-203ENST00000593944 TRIM41Q8WV44 630 aa33.57■■■□□ 2.96
ERF-203ENST00000593944 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.53■■■□□ 2.962e-11■■■■■ 57.8
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ERF-203ENST00000593944 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.48■■■□□ 2.95
ERF-203ENST00000593944 CUX1P39880 1505 aa33.45■■■□□ 2.95
ERF-203ENST00000593944 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.44■■■□□ 2.94
ERF-203ENST00000593944 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
ERF-203ENST00000593944 WDR97A6NE52 1622 aa33.31■■■□□ 2.92
ERF-203ENST00000593944 FBLN2P98095 1184 aa33.3■■■□□ 2.92
ERF-203ENST00000593944 CHD1O14646 1710 aa33.25■■■□□ 2.91
ERF-203ENST00000593944 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.24■■■□□ 2.91
ERF-203ENST00000593944 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.24■■■□□ 2.91
ERF-203ENST00000593944 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.24■■■□□ 2.91
ERF-203ENST00000593944 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.19■■■□□ 2.9
ERF-203ENST00000593944 ARHGEF11O15085 1522 aa33.19■■■□□ 2.9
ERF-203ENST00000593944 GRIN2BQ13224 1484 aa33.18■■■□□ 2.9
ERF-203ENST00000593944 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.14■■■□□ 2.9
ERF-203ENST00000593944 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
ERF-203ENST00000593944 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.1■■■□□ 2.89
ERF-203ENST00000593944 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.09■■■□□ 2.89
ERF-203ENST00000593944 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.05■■■□□ 2.88
ERF-203ENST00000593944 SYNJ2O15056 1496 aa33.03■■■□□ 2.88
ERF-203ENST00000593944 TOP2BQ02880 1626 aa33■■■□□ 2.87
ERF-203ENST00000593944 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.99■■■□□ 2.87
ERF-203ENST00000593944 PBRM1Q86U86 1689 aa32.98■■■□□ 2.87
ERF-203ENST00000593944 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.97■■■□□ 2.87
ERF-203ENST00000593944 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.97■■■□□ 2.87
ERF-203ENST00000593944 SYNJ1O43426 1573 aa32.96■■■□□ 2.87
ERF-203ENST00000593944 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.93■■■□□ 2.86
ERF-203ENST00000593944 ARAP1Q96P48 1450 aa32.88■■■□□ 2.85
ERF-203ENST00000593944 GRIN2AQ12879 1464 aa32.73■■■□□ 2.83
ERF-203ENST00000593944 ADAMTS12P58397 1594 aa32.72■■■□□ 2.83
ERF-203ENST00000593944 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.7■■■□□ 2.83
ERF-203ENST00000593944 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.69■■■□□ 2.82
ERF-203ENST00000593944 NUP160Q12769 1436 aa32.61■■■□□ 2.81
ERF-203ENST00000593944 CEP170Q5SW79 1584 aa32.57■■■□□ 2.8
ERF-203ENST00000593944 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
ERF-203ENST00000593944 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.41■■■□□ 2.78
ERF-203ENST00000593944 KIF27Q86VH2 1401 aa32.41■■■□□ 2.78
ERF-203ENST00000593944 SHROOM2Q13796 1616 aa32.4■■■□□ 2.78
ERF-203ENST00000593944 IGF1RP08069 1367 aa32.35■■■□□ 2.77
ERF-203ENST00000593944 JPH4Q96JJ6 628 aa32.32■■■□□ 2.76
ERF-203ENST00000593944 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
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