RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593560.6

ARRDC2-204, Transcript of arrestin domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene ARRDC2, Length 1,109 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC2-204ENST00000593560 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.37■■■■■ 6.45
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ARRDC2-204ENST00000593560 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.54■■■■■ 5.2
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ARRDC2-204ENST00000593560 NACADO15069 1562 aa47.16■■■■■ 5.14
ARRDC2-204ENST00000593560 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.84■■■■■ 5.09
ARRDC2-204ENST00000593560 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.63■■■■■ 5.06
ARRDC2-204ENST00000593560 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.48■■■■■ 5.03
ARRDC2-204ENST00000593560 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.44■■■■■ 5.03
ARRDC2-204ENST00000593560 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.22■■■■■ 4.99
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ARRDC2-204ENST00000593560 SCRIBQ14160 1630 aa45.33■■■■■ 4.85
ARRDC2-204ENST00000593560 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.25■■■■■ 4.83
ARRDC2-204ENST00000593560 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.17■■■■■ 4.82
ARRDC2-204ENST00000593560 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.81
ARRDC2-204ENST00000593560 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.7■■■■■ 4.59
ARRDC2-204ENST00000593560 NCAPD3P42695 1498 aa43.57■■■■■ 4.57
ARRDC2-204ENST00000593560 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.39■■■■■ 4.54
ARRDC2-204ENST00000593560 CUX2O14529 1486 aa43.31■■■■■ 4.52
ARRDC2-204ENST00000593560 ERCC6Q03468 1493 aa43.25■■■■■ 4.51
ARRDC2-204ENST00000593560 SMARCA4P51532 1647 aa43.23■■■■■ 4.51
ARRDC2-204ENST00000593560 SMARCA2P51531 1590 aa43.21■■■■■ 4.51
ARRDC2-204ENST00000593560 HMGXB3Q12766 1538 aa43.18■■■■■ 4.5
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ARRDC2-204ENST00000593560 NESP48681 1621 aa42.97■■■■■ 4.47
ARRDC2-204ENST00000593560 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
ARRDC2-204ENST00000593560 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.85■■■■■ 4.45
ARRDC2-204ENST00000593560 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.66■■■■■ 4.42
ARRDC2-204ENST00000593560 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.6■■■■■ 4.41
ARRDC2-204ENST00000593560 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
ARRDC2-204ENST00000593560 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.37■■■■■ 4.37
ARRDC2-204ENST00000593560 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.37■■■■■ 4.37
ARRDC2-204ENST00000593560 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.23■■■■■ 4.35
ARRDC2-204ENST00000593560 WIZO95785 1651 aa42.12■■■■■ 4.33
ARRDC2-204ENST00000593560 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.02■■■■■ 4.32
ARRDC2-204ENST00000593560 WDR62O43379 1518 aa41.94■■■■■ 4.3
ARRDC2-204ENST00000593560 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.78■■■■■ 4.28
ARRDC2-204ENST00000593560 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.72■■■■■ 4.27
ARRDC2-204ENST00000593560 CFTRP13569 1480 aa41.68■■■■■ 4.26
ARRDC2-204ENST00000593560 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
ARRDC2-204ENST00000593560 TRIM41Q8WV44 630 aa41.58■■■■■ 4.25
ARRDC2-204ENST00000593560 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
ARRDC2-204ENST00000593560 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
ARRDC2-204ENST00000593560 OSCARQ8IYS5 282 aa41.31■■■■■ 4.2
ARRDC2-204ENST00000593560 PRDM2Q13029 1718 aa41.18■■■■■ 4.18
ARRDC2-204ENST00000593560 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.12■■■■■ 4.17
ARRDC2-204ENST00000593560 IFT140Q96RY7 1462 aa40.98■■■■■ 4.15
ARRDC2-204ENST00000593560 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
ARRDC2-204ENST00000593560 TOPBP1Q92547 1522 aa40.91■■■■■ 4.14
ARRDC2-204ENST00000593560 ABCC8Q09428 1581 aa40.79■■■■■ 4.12
ARRDC2-204ENST00000593560 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.78■■■■■ 4.12
ARRDC2-204ENST00000593560 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.78■■■■■ 4.12
ARRDC2-204ENST00000593560 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.78■■■■■ 4.12
ARRDC2-204ENST00000593560 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.71■■■■■ 4.11
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ARRDC2-204ENST00000593560 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.36■■■■■ 4.05
ARRDC2-204ENST00000593560 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.33■■■■■ 4.05
ARRDC2-204ENST00000593560 FBLN2P98095 1184 aa40.31■■■■■ 4.04
ARRDC2-204ENST00000593560 SOGA1O94964 1423 aa40.29■■■■■ 4.04
ARRDC2-204ENST00000593560 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
ARRDC2-204ENST00000593560 ARAP1Q96P48 1450 aa40.21■■■■■ 4.03
ARRDC2-204ENST00000593560 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.16■■■■■ 4.02
ARRDC2-204ENST00000593560 WDR97A6NE52 1622 aa40.12■■■■■ 4.01
ARRDC2-204ENST00000593560 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.1■■■■■ 4.01
ARRDC2-204ENST00000593560 CUX1P39880 1505 aa40.09■■■■■ 4.01
ARRDC2-204ENST00000593560 CLASP1Q7Z460 1538 aa40■■■■□ 3.99
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ARRDC2-204ENST00000593560 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
ARRDC2-204ENST00000593560 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
ARRDC2-204ENST00000593560 GRIN2BQ13224 1484 aa39.96■■■■□ 3.99
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ARRDC2-204ENST00000593560 SYNJ2O15056 1496 aa39.86■■■■□ 3.97
ARRDC2-204ENST00000593560 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.78■■■■□ 3.96
ARRDC2-204ENST00000593560 PBRM1Q86U86 1689 aa39.75■■■■□ 3.95
ARRDC2-204ENST00000593560 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.7■■■■□ 3.95
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ARRDC2-204ENST00000593560 GRIN2AQ12879 1464 aa39.44■■■■□ 3.9
ARRDC2-204ENST00000593560 ADAMTS12P58397 1594 aa39.37■■■■□ 3.89
ARRDC2-204ENST00000593560 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.36■■■■□ 3.89
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ARRDC2-204ENST00000593560 TOP2BQ02880 1626 aa39.35■■■■□ 3.89
ARRDC2-204ENST00000593560 CEP170Q5SW79 1584 aa39.32■■■■□ 3.88
ARRDC2-204ENST00000593560 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.27■■■■□ 3.88
ARRDC2-204ENST00000593560 SHROOM2Q13796 1616 aa39.19■■■■□ 3.86
ARRDC2-204ENST00000593560 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.19■■■■□ 3.86
ARRDC2-204ENST00000593560 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
ARRDC2-204ENST00000593560 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
ARRDC2-204ENST00000593560 JPH4Q96JJ6 628 aa38.96■■■■□ 3.83
ARRDC2-204ENST00000593560 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.82■■■■□ 3.81
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