RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593068.6

TMEM259-211, Transcript of transmembrane protein 259, humanhuman

TSL 5

Gene TMEM259, Length 1,965 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259-211ENST00000593068 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.43■■■■■ 4.06
TMEM259-211ENST00000593068 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.23■■■■□ 3.23
TMEM259-211ENST00000593068 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
TMEM259-211ENST00000593068 ABCC9O60706 1549 aa33.56■■■□□ 2.96
TMEM259-211ENST00000593068 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.54■■■□□ 2.96
TMEM259-211ENST00000593068 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.32■■■□□ 2.93
TMEM259-211ENST00000593068 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.1■■■□□ 2.89
TMEM259-211ENST00000593068 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.93■■■□□ 2.86
TMEM259-211ENST00000593068 NACADO15069 1562 aa32.82■■■□□ 2.85
TMEM259-211ENST00000593068 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.59■■■□□ 2.81
TMEM259-211ENST00000593068 SCRIBQ14160 1630 aa32.55■■■□□ 2.8
TMEM259-211ENST00000593068 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.07■■■□□ 2.72
TMEM259-211ENST00000593068 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
TMEM259-211ENST00000593068 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.71■■■□□ 2.67
TMEM259-211ENST00000593068 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.67■■■□□ 2.661e-9■■□□□ 14
TMEM259-211ENST00000593068 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.52■■■□□ 2.64
TMEM259-211ENST00000593068 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
TMEM259-211ENST00000593068 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.3■■■□□ 2.6
TMEM259-211ENST00000593068 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
TMEM259-211ENST00000593068 SMARCA4P51532 1647 aa31.13■■■□□ 2.57
TMEM259-211ENST00000593068 WIZO95785 1651 aa31.07■■■□□ 2.56
TMEM259-211ENST00000593068 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
TMEM259-211ENST00000593068 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.68■■■□□ 2.5
TMEM259-211ENST00000593068 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
TMEM259-211ENST00000593068 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.62■■■□□ 2.49
TMEM259-211ENST00000593068 SMARCA2P51531 1590 aa30.54■■■□□ 2.48
TMEM259-211ENST00000593068 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
TMEM259-211ENST00000593068 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.38■■■□□ 2.45
TMEM259-211ENST00000593068 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.33■■■□□ 2.45
TMEM259-211ENST00000593068 NCAPD3P42695 1498 aa30.32■■■□□ 2.44
TMEM259-211ENST00000593068 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.28■■■□□ 2.44
TMEM259-211ENST00000593068 HMGXB3Q12766 1538 aa30.27■■■□□ 2.44
TMEM259-211ENST00000593068 ABCC8Q09428 1581 aa29.79■■■□□ 2.36
TMEM259-211ENST00000593068 TRIM41Q8WV44 630 aa29.76■■■□□ 2.35
TMEM259-211ENST00000593068 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.75■■■□□ 2.35
TMEM259-211ENST00000593068 CFTRP13569 1480 aa29.65■■■□□ 2.34
TMEM259-211ENST00000593068 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.56■■■□□ 2.32
TMEM259-211ENST00000593068 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.5■■■□□ 2.311e-7■■□□□ 12.4
TMEM259-211ENST00000593068 PRDM2Q13029 1718 aa29.49■■■□□ 2.31
TMEM259-211ENST00000593068 NESP48681 1621 aa29.47■■■□□ 2.31
TMEM259-211ENST00000593068 SYNJ1O43426 1573 aa29.46■■■□□ 2.31
TMEM259-211ENST00000593068 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
TMEM259-211ENST00000593068 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.3■■■□□ 2.28
TMEM259-211ENST00000593068 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM259-211ENST00000593068 TOP2BQ02880 1626 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM259-211ENST00000593068 CUX1P39880 1505 aa29.26■■■□□ 2.28
TMEM259-211ENST00000593068 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.24■■■□□ 2.27
TMEM259-211ENST00000593068 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.22■■■□□ 2.27
TMEM259-211ENST00000593068 SOGA1O94964 1423 aa29.19■■■□□ 2.26
TMEM259-211ENST00000593068 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.12■■■□□ 2.25
TMEM259-211ENST00000593068 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.08■■■□□ 2.25
TMEM259-211ENST00000593068 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.07■■■□□ 2.24
TMEM259-211ENST00000593068 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.07■■■□□ 2.24
TMEM259-211ENST00000593068 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.04■■■□□ 2.24
TMEM259-211ENST00000593068 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.97■■■□□ 2.23
TMEM259-211ENST00000593068 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
TMEM259-211ENST00000593068 TOPBP1Q92547 1522 aa28.95■■■□□ 2.23
TMEM259-211ENST00000593068 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.95■■■□□ 2.22
TMEM259-211ENST00000593068 EEA1Q15075 1411 aa28.92■■■□□ 2.22
TMEM259-211ENST00000593068 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.86■■■□□ 2.21
TMEM259-211ENST00000593068 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
TMEM259-211ENST00000593068 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.78■■■□□ 2.2
TMEM259-211ENST00000593068 CUX2O14529 1486 aa28.74■■■□□ 2.19
TMEM259-211ENST00000593068 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.74■■■□□ 2.19
TMEM259-211ENST00000593068 KIF27Q86VH2 1401 aa28.72■■■□□ 2.19
TMEM259-211ENST00000593068 ERCC6Q03468 1493 aa28.72■■■□□ 2.19
TMEM259-211ENST00000593068 KIF21BO75037 1637 aa28.63■■■□□ 2.17
TMEM259-211ENST00000593068 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.63■■■□□ 2.17
TMEM259-211ENST00000593068 HRCP23327 699 aa28.61■■■□□ 2.17
TMEM259-211ENST00000593068 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.61■■■□□ 2.17
TMEM259-211ENST00000593068 GOLGA3Q08378 1498 aa28.6■■■□□ 2.17
TMEM259-211ENST00000593068 WDR62O43379 1518 aa28.6■■■□□ 2.17
TMEM259-211ENST00000593068 WDR97A6NE52 1622 aa28.6■■■□□ 2.17
TMEM259-211ENST00000593068 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.58■■■□□ 2.17
TMEM259-211ENST00000593068 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
TMEM259-211ENST00000593068 PRXQ9BXM0 1461 aa28.54■■■□□ 2.16
TMEM259-211ENST00000593068 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TMEM259-211ENST00000593068 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TMEM259-211ENST00000593068 IGF1RP08069 1367 aa28.52■■■□□ 2.16
TMEM259-211ENST00000593068 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TMEM259-211ENST00000593068 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.48■■■□□ 2.15
TMEM259-211ENST00000593068 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.44■■■□□ 2.14
TMEM259-211ENST00000593068 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.43■■■□□ 2.14
TMEM259-211ENST00000593068 CEP162Q5TB80 1403 aa28.39■■■□□ 2.14
TMEM259-211ENST00000593068 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.38■■■□□ 2.13
TMEM259-211ENST00000593068 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM259-211ENST00000593068 IFT140Q96RY7 1462 aa28.35■■■□□ 2.13
TMEM259-211ENST00000593068 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TMEM259-211ENST00000593068 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.131e-11■■■■■ 37.1
TMEM259-211ENST00000593068 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
TMEM259-211ENST00000593068 CUL7Q14999 1698 aa28.27■■■□□ 2.12
TMEM259-211ENST00000593068 PBRM1Q86U86 1689 aa28.26■■■□□ 2.11
TMEM259-211ENST00000593068 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TMEM259-211ENST00000593068 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TMEM259-211ENST00000593068 CLIP1P30622 1438 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM259-211ENST00000593068 GRIN2BQ13224 1484 aa28.14■■■□□ 2.09
TMEM259-211ENST00000593068 ADAMTS12P58397 1594 aa28.08■■■□□ 2.09
TMEM259-211ENST00000593068 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.04■■■□□ 2.08
TMEM259-211ENST00000593068 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.03■■■□□ 2.08
TMEM259-211ENST00000593068 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28■■■□□ 2.07
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