RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593048.5

CIRBP-241, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 650 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-241ENST00000593048 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.88■■■■□ 3.97
CIRBP-241ENST00000593048 ABCC9O60706 1549 aa35.73■■■■□ 3.31
CIRBP-241ENST00000593048 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.64■■■■□ 3.3
CIRBP-241ENST00000593048 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.93■■■■□ 3.02
CIRBP-241ENST00000593048 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.8■■■■□ 3
CIRBP-241ENST00000593048 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.77■■■■□ 3
CIRBP-241ENST00000593048 NACADO15069 1562 aa33.71■■■□□ 2.99
CIRBP-241ENST00000593048 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.28■■■□□ 2.92
CIRBP-241ENST00000593048 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.25■■■□□ 2.91
CIRBP-241ENST00000593048 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.21■■■□□ 2.91
CIRBP-241ENST00000593048 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
CIRBP-241ENST00000593048 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.02■■■□□ 2.88
CIRBP-241ENST00000593048 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.92■■■□□ 2.86
CIRBP-241ENST00000593048 SCRIBQ14160 1630 aa32.56■■■□□ 2.8
CIRBP-241ENST00000593048 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.54■■■□□ 2.8
CIRBP-241ENST00000593048 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.31■■■□□ 2.76
CIRBP-241ENST00000593048 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.23■■■□□ 2.75
CIRBP-241ENST00000593048 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
CIRBP-241ENST00000593048 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.18■■■□□ 2.58
CIRBP-241ENST00000593048 NCAPD3P42695 1498 aa31.13■■■□□ 2.57
CIRBP-241ENST00000593048 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.07■■■□□ 2.56
CIRBP-241ENST00000593048 SMARCA4P51532 1647 aa31.05■■■□□ 2.56
CIRBP-241ENST00000593048 SMARCA2P51531 1590 aa31■■■□□ 2.55
CIRBP-241ENST00000593048 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
CIRBP-241ENST00000593048 CUX2O14529 1486 aa30.94■■■□□ 2.54
CIRBP-241ENST00000593048 HMGXB3Q12766 1538 aa30.88■■■□□ 2.53
CIRBP-241ENST00000593048 ERCC6Q03468 1493 aa30.83■■■□□ 2.53
CIRBP-241ENST00000593048 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
CIRBP-241ENST00000593048 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.73■■■□□ 2.51
CIRBP-241ENST00000593048 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.71■■■□□ 2.51
CIRBP-241ENST00000593048 NESP48681 1621 aa30.65■■■□□ 2.5
CIRBP-241ENST00000593048 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
CIRBP-241ENST00000593048 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.41■■■□□ 2.46
CIRBP-241ENST00000593048 WIZO95785 1651 aa30.36■■■□□ 2.45
CIRBP-241ENST00000593048 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.28■■■□□ 2.44
CIRBP-241ENST00000593048 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.28■■■□□ 2.44
CIRBP-241ENST00000593048 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.24■■■□□ 2.43
CIRBP-241ENST00000593048 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
CIRBP-241ENST00000593048 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CIRBP-241ENST00000593048 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.98■■■□□ 2.39
CIRBP-241ENST00000593048 WDR62O43379 1518 aa29.96■■■□□ 2.39
CIRBP-241ENST00000593048 CFTRP13569 1480 aa29.89■■■□□ 2.38
CIRBP-241ENST00000593048 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.89■■■□□ 2.38
CIRBP-241ENST00000593048 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.87■■■□□ 2.37
CIRBP-241ENST00000593048 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.7■■■□□ 2.35
CIRBP-241ENST00000593048 TRIM41Q8WV44 630 aa29.61■■■□□ 2.33
CIRBP-241ENST00000593048 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
CIRBP-241ENST00000593048 PRDM2Q13029 1718 aa29.5■■■□□ 2.31
CIRBP-241ENST00000593048 OSCARQ8IYS5 282 aa29.4■■■□□ 2.3
CIRBP-241ENST00000593048 TOPBP1Q92547 1522 aa29.31■■■□□ 2.28
CIRBP-241ENST00000593048 ABCC8Q09428 1581 aa29.3■■■□□ 2.28
CIRBP-241ENST00000593048 IFT140Q96RY7 1462 aa29.29■■■□□ 2.28
CIRBP-241ENST00000593048 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
CIRBP-241ENST00000593048 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.2■■■□□ 2.26
CIRBP-241ENST00000593048 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
CIRBP-241ENST00000593048 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.14■■■□□ 2.26
CIRBP-241ENST00000593048 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.14■■■□□ 2.26
CIRBP-241ENST00000593048 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.14■■■□□ 2.26
CIRBP-241ENST00000593048 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CIRBP-241ENST00000593048 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CIRBP-241ENST00000593048 ARHGEF11O15085 1522 aa29.01■■■□□ 2.23
CIRBP-241ENST00000593048 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.233e-10■■■■■ 35.8
CIRBP-241ENST00000593048 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CIRBP-241ENST00000593048 SOGA1O94964 1423 aa28.96■■■□□ 2.23
CIRBP-241ENST00000593048 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.95■■■□□ 2.22
CIRBP-241ENST00000593048 CHD1O14646 1710 aa28.9■■■□□ 2.22
CIRBP-241ENST00000593048 FBLN2P98095 1184 aa28.89■■■□□ 2.22
CIRBP-241ENST00000593048 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.88■■■□□ 2.21
CIRBP-241ENST00000593048 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CIRBP-241ENST00000593048 CUX1P39880 1505 aa28.86■■■□□ 2.21
CIRBP-241ENST00000593048 WDR97A6NE52 1622 aa28.72■■■□□ 2.19
CIRBP-241ENST00000593048 ARAP1Q96P48 1450 aa28.72■■■□□ 2.19
CIRBP-241ENST00000593048 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.71■■■□□ 2.19
CIRBP-241ENST00000593048 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.69■■■□□ 2.18
CIRBP-241ENST00000593048 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CIRBP-241ENST00000593048 GRIN2BQ13224 1484 aa28.66■■■□□ 2.18
CIRBP-241ENST00000593048 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
CIRBP-241ENST00000593048 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.59■■■□□ 2.17
CIRBP-241ENST00000593048 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.58■■■□□ 2.17
CIRBP-241ENST00000593048 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.55■■■□□ 2.16
CIRBP-241ENST00000593048 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.161e-6■■■■■ 58.5
CIRBP-241ENST00000593048 SYNJ2O15056 1496 aa28.53■■■□□ 2.16
CIRBP-241ENST00000593048 SYNJ1O43426 1573 aa28.49■■■□□ 2.15
CIRBP-241ENST00000593048 PBRM1Q86U86 1689 aa28.47■■■□□ 2.15
CIRBP-241ENST00000593048 TOP2BQ02880 1626 aa28.44■■■□□ 2.14
CIRBP-241ENST00000593048 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.44■■■□□ 2.14
CIRBP-241ENST00000593048 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CIRBP-241ENST00000593048 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.42■■■□□ 2.14
CIRBP-241ENST00000593048 GRIN2AQ12879 1464 aa28.27■■■□□ 2.12
CIRBP-241ENST00000593048 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.23■■■□□ 2.11
CIRBP-241ENST00000593048 ADAMTS12P58397 1594 aa28.23■■■□□ 2.11
CIRBP-241ENST00000593048 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.2■■■□□ 2.1
CIRBP-241ENST00000593048 NUP160Q12769 1436 aa28.15■■■□□ 2.1
CIRBP-241ENST00000593048 CEP170Q5SW79 1584 aa28.11■■■□□ 2.09
CIRBP-241ENST00000593048 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.09■■■□□ 2.09
CIRBP-241ENST00000593048 SHROOM2Q13796 1616 aa28.01■■■□□ 2.07
CIRBP-241ENST00000593048 KIF27Q86VH2 1401 aa27.99■■■□□ 2.07
CIRBP-241ENST00000593048 JPH4Q96JJ6 628 aa27.96■■■□□ 2.07
CIRBP-241ENST00000593048 IGF1RP08069 1367 aa27.93■■■□□ 2.06
CIRBP-241ENST00000593048 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
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