RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591714.5

HDAC5-210, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC5, Length 667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-210ENST00000591714 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.75■■■■■ 4.27
HDAC5-210ENST00000591714 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.27■■■■□ 3.56
HDAC5-210ENST00000591714 ABCC9O60706 1549 aa37.2■■■■□ 3.55
HDAC5-210ENST00000591714 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.39■■■■□ 3.26
HDAC5-210ENST00000591714 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.26■■■■□ 3.24
HDAC5-210ENST00000591714 NACADO15069 1562 aa35.21■■■■□ 3.23
HDAC5-210ENST00000591714 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.84■■■■□ 3.17
HDAC5-210ENST00000591714 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.75■■■■□ 3.15
HDAC5-210ENST00000591714 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.75■■■■□ 3.15
HDAC5-210ENST00000591714 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.72■■■■□ 3.15
HDAC5-210ENST00000591714 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
HDAC5-210ENST00000591714 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.46■■■■□ 3.11
HDAC5-210ENST00000591714 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.41■■■■□ 3.1
HDAC5-210ENST00000591714 SCRIBQ14160 1630 aa34.09■■■■□ 3.05
HDAC5-210ENST00000591714 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.8■■■■□ 3
HDAC5-210ENST00000591714 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.59■■■□□ 2.97
HDAC5-210ENST00000591714 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
HDAC5-210ENST00000591714 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.44■■■□□ 2.94
HDAC5-210ENST00000591714 NCAPD3P42695 1498 aa32.54■■■□□ 2.8
HDAC5-210ENST00000591714 SMARCA4P51532 1647 aa32.51■■■□□ 2.79
HDAC5-210ENST00000591714 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.5■■■□□ 2.79
HDAC5-210ENST00000591714 SMARCA2P51531 1590 aa32.34■■■□□ 2.77
HDAC5-210ENST00000591714 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
HDAC5-210ENST00000591714 HMGXB3Q12766 1538 aa32.26■■■□□ 2.76
HDAC5-210ENST00000591714 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.23■■■□□ 2.75
HDAC5-210ENST00000591714 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
HDAC5-210ENST00000591714 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.15■■■□□ 2.74
HDAC5-210ENST00000591714 NESP48681 1621 aa32.07■■■□□ 2.72
HDAC5-210ENST00000591714 ERCC6Q03468 1493 aa32.02■■■□□ 2.72
HDAC5-210ENST00000591714 WIZO95785 1651 aa31.86■■■□□ 2.69
HDAC5-210ENST00000591714 CUX2O14529 1486 aa31.84■■■□□ 2.69
HDAC5-210ENST00000591714 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.73■■■□□ 2.67
HDAC5-210ENST00000591714 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.7■■■□□ 2.67
HDAC5-210ENST00000591714 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
HDAC5-210ENST00000591714 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.6■■■□□ 2.65
HDAC5-210ENST00000591714 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
HDAC5-210ENST00000591714 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.58■■■□□ 2.65
HDAC5-210ENST00000591714 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.54■■■□□ 2.64
HDAC5-210ENST00000591714 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
HDAC5-210ENST00000591714 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.27■■■□□ 2.6
HDAC5-210ENST00000591714 CFTRP13569 1480 aa31.26■■■□□ 2.59
HDAC5-210ENST00000591714 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.22■■■□□ 2.59
HDAC5-210ENST00000591714 WDR62O43379 1518 aa31.19■■■□□ 2.58
HDAC5-210ENST00000591714 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.19■■■□□ 2.58
HDAC5-210ENST00000591714 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.1■■■□□ 2.57
HDAC5-210ENST00000591714 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
HDAC5-210ENST00000591714 PRDM2Q13029 1718 aa30.93■■■□□ 2.54
HDAC5-210ENST00000591714 TOPBP1Q92547 1522 aa30.67■■■□□ 2.5
HDAC5-210ENST00000591714 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
HDAC5-210ENST00000591714 IFT140Q96RY7 1462 aa30.55■■■□□ 2.48
HDAC5-210ENST00000591714 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.53■■■□□ 2.48
HDAC5-210ENST00000591714 OSCARQ8IYS5 282 aa30.52■■■□□ 2.48
HDAC5-210ENST00000591714 ABCC8Q09428 1581 aa30.52■■■□□ 2.48
HDAC5-210ENST00000591714 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
HDAC5-210ENST00000591714 TRIM41Q8WV44 630 aa30.44■■■□□ 2.46
HDAC5-210ENST00000591714 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
HDAC5-210ENST00000591714 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
HDAC5-210ENST00000591714 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.36■■■□□ 2.451e-12■■■■■ 49.3
HDAC5-210ENST00000591714 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
HDAC5-210ENST00000591714 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.32■■■□□ 2.44
HDAC5-210ENST00000591714 CUX1P39880 1505 aa30.25■■■□□ 2.43
HDAC5-210ENST00000591714 SOGA1O94964 1423 aa30.24■■■□□ 2.43
HDAC5-210ENST00000591714 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.21■■■□□ 2.43
HDAC5-210ENST00000591714 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
HDAC5-210ENST00000591714 CHD1O14646 1710 aa30.13■■■□□ 2.41
HDAC5-210ENST00000591714 FBLN2P98095 1184 aa30.1■■■□□ 2.41
HDAC5-210ENST00000591714 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.09■■■□□ 2.41
HDAC5-210ENST00000591714 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.09■■■□□ 2.41
HDAC5-210ENST00000591714 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.09■■■□□ 2.41
HDAC5-210ENST00000591714 ARHGEF11O15085 1522 aa30.01■■■□□ 2.39
HDAC5-210ENST00000591714 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.99■■■□□ 2.39
HDAC5-210ENST00000591714 WDR97A6NE52 1622 aa29.96■■■□□ 2.39
HDAC5-210ENST00000591714 GRIN2BQ13224 1484 aa29.9■■■□□ 2.38
HDAC5-210ENST00000591714 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
HDAC5-210ENST00000591714 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.86■■■□□ 2.37
HDAC5-210ENST00000591714 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.86■■■□□ 2.37
HDAC5-210ENST00000591714 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
HDAC5-210ENST00000591714 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.85■■■□□ 2.37
HDAC5-210ENST00000591714 PBRM1Q86U86 1689 aa29.82■■■□□ 2.36
HDAC5-210ENST00000591714 SYNJ1O43426 1573 aa29.8■■■□□ 2.36
HDAC5-210ENST00000591714 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.79■■■□□ 2.36
HDAC5-210ENST00000591714 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.78■■■□□ 2.36
HDAC5-210ENST00000591714 SYNJ2O15056 1496 aa29.78■■■□□ 2.36
HDAC5-210ENST00000591714 TOP2BQ02880 1626 aa29.77■■■□□ 2.36
HDAC5-210ENST00000591714 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.76■■■□□ 2.35
HDAC5-210ENST00000591714 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.76■■■□□ 2.35
HDAC5-210ENST00000591714 ARAP1Q96P48 1450 aa29.75■■■□□ 2.35
HDAC5-210ENST00000591714 ADAMTS12P58397 1594 aa29.54■■■□□ 2.32
HDAC5-210ENST00000591714 GRIN2AQ12879 1464 aa29.54■■■□□ 2.32
HDAC5-210ENST00000591714 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.46■■■□□ 2.31
HDAC5-210ENST00000591714 CEP170Q5SW79 1584 aa29.46■■■□□ 2.31
HDAC5-210ENST00000591714 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.45■■■□□ 2.3
HDAC5-210ENST00000591714 NUP160Q12769 1436 aa29.43■■■□□ 2.3
HDAC5-210ENST00000591714 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
HDAC5-210ENST00000591714 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.41■■■□□ 2.3
HDAC5-210ENST00000591714 SHROOM2Q13796 1616 aa29.27■■■□□ 2.28
HDAC5-210ENST00000591714 IGF1RP08069 1367 aa29.24■■■□□ 2.27
HDAC5-210ENST00000591714 JPH4Q96JJ6 628 aa29.19■■■□□ 2.26
HDAC5-210ENST00000591714 KIF27Q86VH2 1401 aa29.19■■■□□ 2.26
HDAC5-210ENST00000591714 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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