RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591474.5

CXXC1-216, Transcript of CXXC finger protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CXXC1, Length 845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1-216ENST00000591474 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.86■■■■■ 6.69
CXXC1-216ENST00000591474 ABCC9O60706 1549 aa51.16■■■■■ 5.78
CXXC1-216ENST00000591474 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.13■■■■■ 5.78
CXXC1-216ENST00000591474 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.7■■■■■ 5.39
CXXC1-216ENST00000591474 NACADO15069 1562 aa48.35■■■■■ 5.33
CXXC1-216ENST00000591474 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.09■■■■■ 5.29
CXXC1-216ENST00000591474 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.89■■■■■ 5.26
CXXC1-216ENST00000591474 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.7■■■■■ 5.23
CXXC1-216ENST00000591474 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.61■■■■■ 5.21
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CXXC1-216ENST00000591474 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.29■■■■■ 5.16
CXXC1-216ENST00000591474 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
CXXC1-216ENST00000591474 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.02■■■■■ 5.12
CXXC1-216ENST00000591474 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.72■■■■■ 5.07
CXXC1-216ENST00000591474 SCRIBQ14160 1630 aa46.5■■■■■ 5.04
CXXC1-216ENST00000591474 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.25■■■■■ 4.99
CXXC1-216ENST00000591474 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.98
CXXC1-216ENST00000591474 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.13■■■■■ 4.98
CXXC1-216ENST00000591474 NCAPD3P42695 1498 aa44.63■■■■■ 4.73
CXXC1-216ENST00000591474 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.46■■■■■ 4.71
CXXC1-216ENST00000591474 SMARCA4P51532 1647 aa44.39■■■■■ 4.7
CXXC1-216ENST00000591474 SMARCA2P51531 1590 aa44.35■■■■■ 4.69
CXXC1-216ENST00000591474 HMGXB3Q12766 1538 aa44.32■■■■■ 4.69
CXXC1-216ENST00000591474 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.3■■■■■ 4.68
CXXC1-216ENST00000591474 CUX2O14529 1486 aa44.24■■■■■ 4.67
CXXC1-216ENST00000591474 ERCC6Q03468 1493 aa44.2■■■■■ 4.67
CXXC1-216ENST00000591474 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
CXXC1-216ENST00000591474 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.01■■■■■ 4.64
CXXC1-216ENST00000591474 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
CXXC1-216ENST00000591474 NESP48681 1621 aa43.92■■■■■ 4.62
CXXC1-216ENST00000591474 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.79■■■■■ 4.6
CXXC1-216ENST00000591474 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.66■■■■■ 4.58
CXXC1-216ENST00000591474 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
CXXC1-216ENST00000591474 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.39■■■■■ 4.54
CXXC1-216ENST00000591474 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.39■■■■■ 4.54
CXXC1-216ENST00000591474 WIZO95785 1651 aa43.26■■■■■ 4.52
CXXC1-216ENST00000591474 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.25■■■■■ 4.51
CXXC1-216ENST00000591474 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.02■■■■■ 4.48
CXXC1-216ENST00000591474 WDR62O43379 1518 aa42.95■■■■■ 4.47
CXXC1-216ENST00000591474 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
CXXC1-216ENST00000591474 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.81■■■■■ 4.44
CXXC1-216ENST00000591474 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.75■■■■■ 4.43
CXXC1-216ENST00000591474 CFTRP13569 1480 aa42.74■■■■■ 4.43
CXXC1-216ENST00000591474 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
CXXC1-216ENST00000591474 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
CXXC1-216ENST00000591474 PRDM2Q13029 1718 aa42.34■■■■■ 4.37
CXXC1-216ENST00000591474 TRIM41Q8WV44 630 aa42.22■■■■■ 4.35
CXXC1-216ENST00000591474 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.22■■■■■ 4.35
CXXC1-216ENST00000591474 OSCARQ8IYS5 282 aa42.11■■■■■ 4.33
CXXC1-216ENST00000591474 IFT140Q96RY7 1462 aa41.98■■■■■ 4.31
CXXC1-216ENST00000591474 TOPBP1Q92547 1522 aa41.94■■■■■ 4.3
CXXC1-216ENST00000591474 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
CXXC1-216ENST00000591474 ABCC8Q09428 1581 aa41.85■■■■■ 4.29
CXXC1-216ENST00000591474 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.79■■■■■ 4.28
CXXC1-216ENST00000591474 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
CXXC1-216ENST00000591474 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.62■■■■■ 4.25
CXXC1-216ENST00000591474 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.62■■■■■ 4.25
CXXC1-216ENST00000591474 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.62■■■■■ 4.25
CXXC1-216ENST00000591474 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
CXXC1-216ENST00000591474 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
CXXC1-216ENST00000591474 ARHGEF11O15085 1522 aa41.49■■■■■ 4.23
CXXC1-216ENST00000591474 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.47■■■■■ 4.237e-7■■■■□ 19.8
CXXC1-216ENST00000591474 CHD1O14646 1710 aa41.4■■■■■ 4.22
CXXC1-216ENST00000591474 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.31■■■■■ 4.2
CXXC1-216ENST00000591474 SOGA1O94964 1423 aa41.27■■■■■ 4.2
CXXC1-216ENST00000591474 WDR97A6NE52 1622 aa41.22■■■■■ 4.19
CXXC1-216ENST00000591474 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.21■■■■■ 4.19
CXXC1-216ENST00000591474 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
CXXC1-216ENST00000591474 FBLN2P98095 1184 aa41.17■■■■■ 4.18
CXXC1-216ENST00000591474 CUX1P39880 1505 aa41.15■■■■■ 4.18
CXXC1-216ENST00000591474 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.1■■■■■ 4.17
CXXC1-216ENST00000591474 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.09■■■■■ 4.17
CXXC1-216ENST00000591474 ARAP1Q96P48 1450 aa41.07■■■■■ 4.16
CXXC1-216ENST00000591474 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
CXXC1-216ENST00000591474 GRIN2BQ13224 1484 aa40.96■■■■■ 4.15
CXXC1-216ENST00000591474 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.95■■■■■ 4.15
CXXC1-216ENST00000591474 SYNJ1O43426 1573 aa40.9■■■■■ 4.14
CXXC1-216ENST00000591474 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
CXXC1-216ENST00000591474 SYNJ2O15056 1496 aa40.86■■■■■ 4.13
CXXC1-216ENST00000591474 PBRM1Q86U86 1689 aa40.82■■■■■ 4.12
CXXC1-216ENST00000591474 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.79■■■■■ 4.12
CXXC1-216ENST00000591474 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.77■■■■■ 4.12
CXXC1-216ENST00000591474 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.73■■■■■ 4.11
CXXC1-216ENST00000591474 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
CXXC1-216ENST00000591474 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
CXXC1-216ENST00000591474 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.54■■■■■ 4.08
CXXC1-216ENST00000591474 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.49■■■■■ 4.07
CXXC1-216ENST00000591474 TOP2BQ02880 1626 aa40.49■■■■■ 4.07
CXXC1-216ENST00000591474 GRIN2AQ12879 1464 aa40.44■■■■■ 4.06
CXXC1-216ENST00000591474 ADAMTS12P58397 1594 aa40.42■■■■■ 4.06
CXXC1-216ENST00000591474 NUP160Q12769 1436 aa40.33■■■■■ 4.05
CXXC1-216ENST00000591474 CEP170Q5SW79 1584 aa40.31■■■■■ 4.04
CXXC1-216ENST00000591474 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.28■■■■■ 4.04
CXXC1-216ENST00000591474 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.26■■■■■ 4.03
CXXC1-216ENST00000591474 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.25■■■■■ 4.03
CXXC1-216ENST00000591474 SHROOM2Q13796 1616 aa40.19■■■■■ 4.02
CXXC1-216ENST00000591474 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
CXXC1-216ENST00000591474 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.86■■■■□ 3.97
CXXC1-216ENST00000591474 JPH4Q96JJ6 628 aa39.85■■■■□ 3.97
CXXC1-216ENST00000591474 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.69■■■■□ 3.94
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