RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591055.5

CIRBP-230, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 2

Gene CIRBP, Length 928 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-230	ENST00000591055	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.4	■■■■□ 3.9
CIRBP-230	ENST00000591055	ABCC9	O60706	1549 aa		35.38	■■■■□ 3.25
CIRBP-230	ENST00000591055	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.35	■■■■□ 3.25
CIRBP-230	ENST00000591055	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.67	■■■□□ 2.98
CIRBP-230	ENST00000591055	NACAD	O15069	1562 aa		33.43	■■■□□ 2.94
CIRBP-230	ENST00000591055	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CIRBP-230	ENST00000591055	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIRBP-230	ENST00000591055	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CIRBP-230	ENST00000591055	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.96	■■■□□ 2.87
CIRBP-230	ENST00000591055	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CIRBP-230	ENST00000591055	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CIRBP-230	ENST00000591055	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
CIRBP-230	ENST00000591055	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.54	■■■□□ 2.8
CIRBP-230	ENST00000591055	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CIRBP-230	ENST00000591055	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.22	■■■□□ 2.75
CIRBP-230	ENST00000591055	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.95	■■■□□ 2.71
CIRBP-230	ENST00000591055	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
CIRBP-230	ENST00000591055	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.87	■■■□□ 2.69
CIRBP-230	ENST00000591055	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.87	■■■□□ 2.53
CIRBP-230	ENST00000591055	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.78	■■■□□ 2.52
CIRBP-230	ENST00000591055	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.74	■■■□□ 2.51
CIRBP-230	ENST00000591055	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.7	■■■□□ 2.5
CIRBP-230	ENST00000591055	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.63	■■■□□ 2.49
CIRBP-230	ENST00000591055	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.59	■■■□□ 2.49
CIRBP-230	ENST00000591055	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.57	■■■□□ 2.48
CIRBP-230	ENST00000591055	CUX2	O14529	1486 aa		30.5	■■■□□ 2.47
CIRBP-230	ENST00000591055	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.49	■■■□□ 2.47
CIRBP-230	ENST00000591055	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.49	■■■□□ 2.47
CIRBP-230	ENST00000591055	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.43	■■■□□ 2.46
CIRBP-230	ENST00000591055	NES	P48681	1621 aa		30.38	■■■□□ 2.45
CIRBP-230	ENST00000591055	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.37	■■■□□ 2.45
CIRBP-230	ENST00000591055	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.17	■■■□□ 2.42
CIRBP-230	ENST00000591055	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.06	■■■□□ 2.4
CIRBP-230	ENST00000591055	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.03	■■■□□ 2.4
CIRBP-230	ENST00000591055	WIZ	O95785	1651 aa		30	■■■□□ 2.39
CIRBP-230	ENST00000591055	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.98	■■■□□ 2.39
CIRBP-230	ENST00000591055	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.95	■■■□□ 2.39
CIRBP-230	ENST00000591055	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CIRBP-230	ENST00000591055	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
CIRBP-230	ENST00000591055	WDR62	O43379	1518 aa		29.66	■■■□□ 2.34
CIRBP-230	ENST00000591055	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.63	■■■□□ 2.33
CIRBP-230	ENST00000591055	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.62	■■■□□ 2.33
CIRBP-230	ENST00000591055	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CIRBP-230	ENST00000591055	CFTR	P13569	1480 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CIRBP-230	ENST00000591055	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.35	■■■□□ 2.29
CIRBP-230	ENST00000591055	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.3	■■■□□ 2.28
CIRBP-230	ENST00000591055	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CIRBP-230	ENST00000591055	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.18	■■■□□ 2.26
CIRBP-230	ENST00000591055	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CIRBP-230	ENST00000591055	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-230	ENST00000591055	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-230	ENST00000591055	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CIRBP-230	ENST00000591055	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
CIRBP-230	ENST00000591055	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CIRBP-230	ENST00000591055	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
CIRBP-230	ENST00000591055	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
CIRBP-230	ENST00000591055	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.74	■■■□□ 2.19	3e-10	■■■■■ 35.8
CIRBP-230	ENST00000591055	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
CIRBP-230	ENST00000591055	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CIRBP-230	ENST00000591055	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CIRBP-230	ENST00000591055	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CIRBP-230	ENST00000591055	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.64	■■■□□ 2.17
CIRBP-230	ENST00000591055	SOGA1	O94964	1423 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CIRBP-230	ENST00000591055	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CIRBP-230	ENST00000591055	CHD1	O14646	1710 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CIRBP-230	ENST00000591055	FBLN2	P98095	1184 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-230	ENST00000591055	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
CIRBP-230	ENST00000591055	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-230	ENST00000591055	CUX1	P39880	1505 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CIRBP-230	ENST00000591055	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.47	■■■□□ 2.15
CIRBP-230	ENST00000591055	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
CIRBP-230	ENST00000591055	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.45	■■■□□ 2.14
CIRBP-230	ENST00000591055	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.44	■■■□□ 2.14
CIRBP-230	ENST00000591055	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
CIRBP-230	ENST00000591055	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.37	■■■□□ 2.13
CIRBP-230	ENST00000591055	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
CIRBP-230	ENST00000591055	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.34	■■■□□ 2.13
CIRBP-230	ENST00000591055	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.28	■■■□□ 2.12
CIRBP-230	ENST00000591055	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.28	■■■□□ 2.12
CIRBP-230	ENST00000591055	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.27	■■■□□ 2.12
CIRBP-230	ENST00000591055	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.27	■■■□□ 2.12
CIRBP-230	ENST00000591055	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-230	ENST00000591055	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-230	ENST00000591055	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.18	■■■□□ 2.1
CIRBP-230	ENST00000591055	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
CIRBP-230	ENST00000591055	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.14	■■■□□ 2.1	1e-6	■■■■■ 58.5
CIRBP-230	ENST00000591055	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.07	■■■□□ 2.08
CIRBP-230	ENST00000591055	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.07	■■■□□ 2.08
CIRBP-230	ENST00000591055	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28	■■■□□ 2.07
CIRBP-230	ENST00000591055	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CIRBP-230	ENST00000591055	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CIRBP-230	ENST00000591055	NUP160	Q12769	1436 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-230	ENST00000591055	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CIRBP-230	ENST00000591055	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CIRBP-230	ENST00000591055	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CIRBP-230	ENST00000591055	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CIRBP-230	ENST00000591055	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.65	■■■□□ 2.02
CIRBP-230	ENST00000591055	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
CIRBP-230	ENST00000591055	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.57	■■■□□ 2
CIRBP-230	ENST00000591055	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.55	■■■□□ 2

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