RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590446.2

SBNO2-208, Transcript of strawberry notch homolog 2, humanhuman

TSL 2

Gene SBNO2, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2-208ENST00000590446 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37■■■■□ 3.51
SBNO2-208ENST00000590446 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.06■■■□□ 2.88
SBNO2-208ENST00000590446 ABCC9O60706 1549 aa32.62■■■□□ 2.81
SBNO2-208ENST00000590446 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.29■■■□□ 2.6
SBNO2-208ENST00000590446 NACADO15069 1562 aa31.22■■■□□ 2.59
SBNO2-208ENST00000590446 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.05■■■□□ 2.56
SBNO2-208ENST00000590446 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.8■■■□□ 2.52
SBNO2-208ENST00000590446 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
SBNO2-208ENST00000590446 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.71■■■□□ 2.51
SBNO2-208ENST00000590446 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.56■■■□□ 2.48
SBNO2-208ENST00000590446 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.51■■■□□ 2.47
SBNO2-208ENST00000590446 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.45■■■□□ 2.46
SBNO2-208ENST00000590446 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.41■■■□□ 2.46
SBNO2-208ENST00000590446 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.16■■■□□ 2.42
SBNO2-208ENST00000590446 SCRIBQ14160 1630 aa29.95■■■□□ 2.38
SBNO2-208ENST00000590446 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
SBNO2-208ENST00000590446 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.56■■■□□ 2.32
SBNO2-208ENST00000590446 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.42■■■□□ 2.3
SBNO2-208ENST00000590446 NCAPD3P42695 1498 aa28.89■■■□□ 2.22
SBNO2-208ENST00000590446 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.76■■■□□ 2.19
SBNO2-208ENST00000590446 SMARCA4P51532 1647 aa28.74■■■□□ 2.19
SBNO2-208ENST00000590446 SMARCA2P51531 1590 aa28.67■■■□□ 2.18
SBNO2-208ENST00000590446 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
SBNO2-208ENST00000590446 HMGXB3Q12766 1538 aa28.64■■■□□ 2.17
SBNO2-208ENST00000590446 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.61■■■□□ 2.17
SBNO2-208ENST00000590446 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.46■■■□□ 2.15
SBNO2-208ENST00000590446 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SBNO2-208ENST00000590446 NESP48681 1621 aa28.15■■■□□ 2.1
SBNO2-208ENST00000590446 CUX2O14529 1486 aa28.15■■■□□ 2.1
SBNO2-208ENST00000590446 ERCC6Q03468 1493 aa28.1■■■□□ 2.09
SBNO2-208ENST00000590446 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.09■■■□□ 2.09
SBNO2-208ENST00000590446 WIZO95785 1651 aa28.07■■■□□ 2.08
SBNO2-208ENST00000590446 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
SBNO2-208ENST00000590446 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.96■■■□□ 2.07
SBNO2-208ENST00000590446 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.91■■■□□ 2.06
SBNO2-208ENST00000590446 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
SBNO2-208ENST00000590446 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.85■■■□□ 2.05
SBNO2-208ENST00000590446 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
SBNO2-208ENST00000590446 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.77■■■□□ 2.04
SBNO2-208ENST00000590446 CFTRP13569 1480 aa27.72■■■□□ 2.03
SBNO2-208ENST00000590446 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.61■■■□□ 2.01
SBNO2-208ENST00000590446 WDR62O43379 1518 aa27.58■■■□□ 2.01
SBNO2-208ENST00000590446 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.55■■■□□ 2
SBNO2-208ENST00000590446 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.52■■■□□ 2
SBNO2-208ENST00000590446 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.5■■□□□ 1.99
SBNO2-208ENST00000590446 PRDM2Q13029 1718 aa27.36■■□□□ 1.97
SBNO2-208ENST00000590446 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SBNO2-208ENST00000590446 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SBNO2-208ENST00000590446 ABCC8Q09428 1581 aa27.12■■□□□ 1.93
SBNO2-208ENST00000590446 TOPBP1Q92547 1522 aa27.08■■□□□ 1.93
SBNO2-208ENST00000590446 IFT140Q96RY7 1462 aa27.03■■□□□ 1.92
SBNO2-208ENST00000590446 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.01■■□□□ 1.91
SBNO2-208ENST00000590446 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SBNO2-208ENST00000590446 OSCARQ8IYS5 282 aa26.88■■□□□ 1.89
SBNO2-208ENST00000590446 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SBNO2-208ENST00000590446 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SBNO2-208ENST00000590446 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SBNO2-208ENST00000590446 CUX1P39880 1505 aa26.72■■□□□ 1.87
SBNO2-208ENST00000590446 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.87
SBNO2-208ENST00000590446 SOGA1O94964 1423 aa26.7■■□□□ 1.86
SBNO2-208ENST00000590446 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.67■■□□□ 1.86
SBNO2-208ENST00000590446 WDR97A6NE52 1622 aa26.66■■□□□ 1.86
SBNO2-208ENST00000590446 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.65■■□□□ 1.86
SBNO2-208ENST00000590446 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SBNO2-208ENST00000590446 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.47■■□□□ 1.83
SBNO2-208ENST00000590446 CHD1O14646 1710 aa26.45■■□□□ 1.83
SBNO2-208ENST00000590446 GRIN2BQ13224 1484 aa26.44■■□□□ 1.82
SBNO2-208ENST00000590446 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SBNO2-208ENST00000590446 TRIM41Q8WV44 630 aa26.44■■□□□ 1.82
SBNO2-208ENST00000590446 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
SBNO2-208ENST00000590446 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
SBNO2-208ENST00000590446 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
SBNO2-208ENST00000590446 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
SBNO2-208ENST00000590446 ARHGEF11O15085 1522 aa26.41■■□□□ 1.82
SBNO2-208ENST00000590446 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.41■■□□□ 1.82
SBNO2-208ENST00000590446 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.4■■□□□ 1.82
SBNO2-208ENST00000590446 TOP2BQ02880 1626 aa26.39■■□□□ 1.81
SBNO2-208ENST00000590446 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.37■■□□□ 1.81
SBNO2-208ENST00000590446 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.36■■□□□ 1.81
SBNO2-208ENST00000590446 SYNJ1O43426 1573 aa26.35■■□□□ 1.81
SBNO2-208ENST00000590446 SYNJ2O15056 1496 aa26.34■■□□□ 1.81
SBNO2-208ENST00000590446 FBLN2P98095 1184 aa26.31■■□□□ 1.8
SBNO2-208ENST00000590446 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.29■■□□□ 1.8
SBNO2-208ENST00000590446 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SBNO2-208ENST00000590446 PBRM1Q86U86 1689 aa26.26■■□□□ 1.79
SBNO2-208ENST00000590446 ARAP1Q96P48 1450 aa26.18■■□□□ 1.78
SBNO2-208ENST00000590446 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.13■■□□□ 1.77
SBNO2-208ENST00000590446 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.13■■□□□ 1.77
SBNO2-208ENST00000590446 ADAMTS12P58397 1594 aa26.09■■□□□ 1.77
SBNO2-208ENST00000590446 GRIN2AQ12879 1464 aa26.09■■□□□ 1.77
SBNO2-208ENST00000590446 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.08■■□□□ 1.77
SBNO2-208ENST00000590446 NUP160Q12769 1436 aa26.08■■□□□ 1.77
SBNO2-208ENST00000590446 CEP170Q5SW79 1584 aa25.96■■□□□ 1.75
SBNO2-208ENST00000590446 SHROOM2Q13796 1616 aa25.92■■□□□ 1.74
SBNO2-208ENST00000590446 IGF1RP08069 1367 aa25.9■■□□□ 1.74
SBNO2-208ENST00000590446 KIF27Q86VH2 1401 aa25.88■■□□□ 1.73
SBNO2-208ENST00000590446 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.82■■□□□ 1.72
SBNO2-208ENST00000590446 CUL7Q14999 1698 aa25.8■■□□□ 1.72
SBNO2-208ENST00000590446 JPH4Q96JJ6 628 aa25.76■■□□□ 1.71
SBNO2-208ENST00000590446 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.71■■□□□ 1.71
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