RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.57■■■□□ 2.48
CTIF-208ENST00000590422 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.45■■□□□ 1.98
CTIF-208ENST00000590422 ABCC9O60706 1549 aa27.44■■□□□ 1.98
CTIF-208ENST00000590422 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.09■■□□□ 1.77
CTIF-208ENST00000590422 NACADO15069 1562 aa25.91■■□□□ 1.74
CTIF-208ENST00000590422 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.73■■□□□ 1.71
CTIF-208ENST00000590422 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.7■■□□□ 1.7
CTIF-208ENST00000590422 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.61■■□□□ 1.69
CTIF-208ENST00000590422 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.55■■□□□ 1.68
CTIF-208ENST00000590422 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
CTIF-208ENST00000590422 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.4■■□□□ 1.66
CTIF-208ENST00000590422 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CTIF-208ENST00000590422 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.23■■□□□ 1.63
CTIF-208ENST00000590422 SCRIBQ14160 1630 aa25.04■■□□□ 1.6
CTIF-208ENST00000590422 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.98■■□□□ 1.59
CTIF-208ENST00000590422 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.8■■□□□ 1.56
CTIF-208ENST00000590422 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CTIF-208ENST00000590422 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.7■■□□□ 1.54
CTIF-208ENST00000590422 NCAPD3P42695 1498 aa23.91■■□□□ 1.42
CTIF-208ENST00000590422 SMARCA4P51532 1647 aa23.88■■□□□ 1.41
CTIF-208ENST00000590422 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.87■■□□□ 1.41
CTIF-208ENST00000590422 SMARCA2P51531 1590 aa23.78■■□□□ 1.4
CTIF-208ENST00000590422 HMGXB3Q12766 1538 aa23.77■■□□□ 1.4
CTIF-208ENST00000590422 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CTIF-208ENST00000590422 ERCC6Q03468 1493 aa23.65■■□□□ 1.38
CTIF-208ENST00000590422 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.63■■□□□ 1.37
CTIF-208ENST00000590422 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CTIF-208ENST00000590422 CUX2O14529 1486 aa23.61■■□□□ 1.37
CTIF-208ENST00000590422 NESP48681 1621 aa23.6■■□□□ 1.37
CTIF-208ENST00000590422 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.59■■□□□ 1.37
CTIF-208ENST00000590422 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.56■■□□□ 1.36
CTIF-208ENST00000590422 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CTIF-208ENST00000590422 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.39■■□□□ 1.33
CTIF-208ENST00000590422 WIZO95785 1651 aa23.32■■□□□ 1.32
CTIF-208ENST00000590422 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.32■■□□□ 1.32
CTIF-208ENST00000590422 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.2■■□□□ 1.3
CTIF-208ENST00000590422 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.17■■□□□ 1.3
CTIF-208ENST00000590422 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CTIF-208ENST00000590422 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.05■■□□□ 1.28
CTIF-208ENST00000590422 WDR62O43379 1518 aa23.03■■□□□ 1.28
CTIF-208ENST00000590422 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CTIF-208ENST00000590422 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.96■■□□□ 1.27
CTIF-208ENST00000590422 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.95■■□□□ 1.26
CTIF-208ENST00000590422 CFTRP13569 1480 aa22.94■■□□□ 1.26
CTIF-208ENST00000590422 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CTIF-208ENST00000590422 PRDM2Q13029 1718 aa22.77■■□□□ 1.24
CTIF-208ENST00000590422 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.72■■□□□ 1.23
CTIF-208ENST00000590422 TRIM41Q8WV44 630 aa22.54■■□□□ 1.2
CTIF-208ENST00000590422 TOPBP1Q92547 1522 aa22.53■■□□□ 1.2
CTIF-208ENST00000590422 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
CTIF-208ENST00000590422 IFT140Q96RY7 1462 aa22.48■■□□□ 1.19
CTIF-208ENST00000590422 OSCARQ8IYS5 282 aa22.46■■□□□ 1.19
CTIF-208ENST00000590422 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.44■■□□□ 1.18
CTIF-208ENST00000590422 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CTIF-208ENST00000590422 ABCC8Q09428 1581 aa22.39■■□□□ 1.18
CTIF-208ENST00000590422 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CTIF-208ENST00000590422 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTIF-208ENST00000590422 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-208ENST00000590422 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-208ENST00000590422 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-208ENST00000590422 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
CTIF-208ENST00000590422 CHD1O14646 1710 aa22.25■■□□□ 1.15
CTIF-208ENST00000590422 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.22■■□□□ 1.15
CTIF-208ENST00000590422 ARHGEF11O15085 1522 aa22.21■■□□□ 1.15
CTIF-208ENST00000590422 CUX1P39880 1505 aa22.16■■□□□ 1.14
CTIF-208ENST00000590422 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.16■■□□□ 1.14
CTIF-208ENST00000590422 SOGA1O94964 1423 aa22.14■■□□□ 1.13
CTIF-208ENST00000590422 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTIF-208ENST00000590422 WDR97A6NE52 1622 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-208ENST00000590422 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-208ENST00000590422 FBLN2P98095 1184 aa22.06■■□□□ 1.12
CTIF-208ENST00000590422 ARAP1Q96P48 1450 aa22.02■■□□□ 1.12
CTIF-208ENST00000590422 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CTIF-208ENST00000590422 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CTIF-208ENST00000590422 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.97■■□□□ 1.11
CTIF-208ENST00000590422 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.97■■□□□ 1.11
CTIF-208ENST00000590422 GRIN2BQ13224 1484 aa21.96■■□□□ 1.11
CTIF-208ENST00000590422 PBRM1Q86U86 1689 aa21.96■■□□□ 1.11
CTIF-208ENST00000590422 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.91■■□□□ 1.1
CTIF-208ENST00000590422 SYNJ1O43426 1573 aa21.91■■□□□ 1.1
CTIF-208ENST00000590422 SYNJ2O15056 1496 aa21.9■■□□□ 1.1
CTIF-208ENST00000590422 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.9■■□□□ 1.1
CTIF-208ENST00000590422 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.9■■□□□ 1.1
CTIF-208ENST00000590422 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CTIF-208ENST00000590422 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.8■■□□□ 1.08
CTIF-208ENST00000590422 TOP2BQ02880 1626 aa21.79■■□□□ 1.08
CTIF-208ENST00000590422 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
CTIF-208ENST00000590422 ADAMTS12P58397 1594 aa21.74■■□□□ 1.07
CTIF-208ENST00000590422 GRIN2AQ12879 1464 aa21.71■■□□□ 1.07
CTIF-208ENST00000590422 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CTIF-208ENST00000590422 CEP170Q5SW79 1584 aa21.68■■□□□ 1.06
CTIF-208ENST00000590422 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.66■■□□□ 1.06
CTIF-208ENST00000590422 NUP160Q12769 1436 aa21.64■■□□□ 1.06
CTIF-208ENST00000590422 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-208ENST00000590422 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-208ENST00000590422 SHROOM2Q13796 1616 aa21.58■■□□□ 1.04
CTIF-208ENST00000590422 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.45■■□□□ 1.02
CTIF-208ENST00000590422 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CTIF-208ENST00000590422 JPH4Q96JJ6 628 aa21.34■■□□□ 1.01
CTIF-208ENST00000590422 IGF1RP08069 1367 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms