RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590056.1

KDSR-210, Transcript of 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

TSL 3

Gene KDSR, Length 462 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSR-210ENST00000590056 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.23■■■■■ 7.71
KDSR-210ENST00000590056 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.37■■■■■ 6.61
KDSR-210ENST00000590056 ABCC9O60706 1549 aa55.61■■■■■ 6.49
KDSR-210ENST00000590056 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.36■■■■■ 6.13
KDSR-210ENST00000590056 NACADO15069 1562 aa53.2■■■■■ 6.11
KDSR-210ENST00000590056 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.17■■■■■ 6.1
KDSR-210ENST00000590056 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.76■■■■■ 6.04
KDSR-210ENST00000590056 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.54■■■■■ 6
KDSR-210ENST00000590056 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.35■■■■■ 5.97
KDSR-210ENST00000590056 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.93■■■■■ 5.9
KDSR-210ENST00000590056 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.88■■■■■ 5.9
KDSR-210ENST00000590056 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.6■■■■■ 5.85
KDSR-210ENST00000590056 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.41■■■■■ 5.82
KDSR-210ENST00000590056 SCRIBQ14160 1630 aa51.35■■■■■ 5.81
KDSR-210ENST00000590056 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.24■■■■■ 5.79
KDSR-210ENST00000590056 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.35■■■■■ 5.65
KDSR-210ENST00000590056 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.24■■■■■ 5.63
KDSR-210ENST00000590056 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.07■■■■■ 5.61
KDSR-210ENST00000590056 NCAPD3P42695 1498 aa49.11■■■■■ 5.45
KDSR-210ENST00000590056 SMARCA4P51532 1647 aa49.1■■■■■ 5.45
KDSR-210ENST00000590056 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.08■■■■■ 5.45
KDSR-210ENST00000590056 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.02■■■■■ 5.44
KDSR-210ENST00000590056 SMARCA2P51531 1590 aa48.98■■■■■ 5.43
KDSR-210ENST00000590056 HMGXB3Q12766 1538 aa48.77■■■■■ 5.4
KDSR-210ENST00000590056 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.67■■■■■ 5.38
KDSR-210ENST00000590056 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.66■■■■■ 5.38
KDSR-210ENST00000590056 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.62■■■■■ 5.37
KDSR-210ENST00000590056 WIZO95785 1651 aa48.07■■■■■ 5.29
KDSR-210ENST00000590056 ERCC6Q03468 1493 aa48.06■■■■■ 5.28
KDSR-210ENST00000590056 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.01■■■■■ 5.28
KDSR-210ENST00000590056 NESP48681 1621 aa47.92■■■■■ 5.26
KDSR-210ENST00000590056 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.84■■■■■ 5.25
KDSR-210ENST00000590056 CUX2O14529 1486 aa47.7■■■■■ 5.23
KDSR-210ENST00000590056 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.68■■■■■ 5.22
KDSR-210ENST00000590056 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.64■■■■■ 5.22
KDSR-210ENST00000590056 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.62■■■■■ 5.21
KDSR-210ENST00000590056 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.29■■■■■ 5.16
KDSR-210ENST00000590056 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
KDSR-210ENST00000590056 CFTRP13569 1480 aa47.25■■■■■ 5.15
KDSR-210ENST00000590056 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.08■■■■■ 5.13
KDSR-210ENST00000590056 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.08■■■■■ 5.13
KDSR-210ENST00000590056 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.08■■■■■ 5.13
KDSR-210ENST00000590056 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.08■■■■■ 5.13
KDSR-210ENST00000590056 WDR62O43379 1518 aa46.89■■■■■ 5.1
KDSR-210ENST00000590056 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.8■■■■■ 5.08
KDSR-210ENST00000590056 PRDM2Q13029 1718 aa46.7■■■■■ 5.07
KDSR-210ENST00000590056 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
KDSR-210ENST00000590056 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
KDSR-210ENST00000590056 ABCC8Q09428 1581 aa46.37■■■■■ 5.01
KDSR-210ENST00000590056 TOPBP1Q92547 1522 aa46.24■■■■■ 4.99
KDSR-210ENST00000590056 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.15■■■■■ 4.98
KDSR-210ENST00000590056 IFT140Q96RY7 1462 aa46.13■■■■■ 4.98
KDSR-210ENST00000590056 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.85■■■■■ 4.93
KDSR-210ENST00000590056 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
KDSR-210ENST00000590056 OSCARQ8IYS5 282 aa45.76■■■■■ 4.92
KDSR-210ENST00000590056 SOGA1O94964 1423 aa45.71■■■■■ 4.91
KDSR-210ENST00000590056 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.71■■■■■ 4.91
KDSR-210ENST00000590056 CUX1P39880 1505 aa45.68■■■■■ 4.9
KDSR-210ENST00000590056 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.64■■■■■ 4.9
KDSR-210ENST00000590056 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
KDSR-210ENST00000590056 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.6■■■■■ 4.89
KDSR-210ENST00000590056 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.59■■■■■ 4.89
KDSR-210ENST00000590056 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
KDSR-210ENST00000590056 WDR97A6NE52 1622 aa45.44■■■■■ 4.87
KDSR-210ENST00000590056 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.33■■■■■ 4.85
KDSR-210ENST00000590056 FBLN2P98095 1184 aa45.26■■■■■ 4.84
KDSR-210ENST00000590056 GRIN2BQ13224 1484 aa45.22■■■■■ 4.83
KDSR-210ENST00000590056 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.21■■■■■ 4.83
KDSR-210ENST00000590056 TOP2BQ02880 1626 aa45.2■■■■■ 4.83
KDSR-210ENST00000590056 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.15■■■■■ 4.82
KDSR-210ENST00000590056 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.15■■■■■ 4.82
KDSR-210ENST00000590056 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.14■■■■■ 4.82
KDSR-210ENST00000590056 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.14■■■■■ 4.82
KDSR-210ENST00000590056 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.1■■■■■ 4.81
KDSR-210ENST00000590056 SYNJ1O43426 1573 aa45.1■■■■■ 4.81
KDSR-210ENST00000590056 CHD1O14646 1710 aa45.08■■■■■ 4.81
KDSR-210ENST00000590056 TRIM41Q8WV44 630 aa45.05■■■■■ 4.8
KDSR-210ENST00000590056 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.97■■■■■ 4.79
KDSR-210ENST00000590056 SYNJ2O15056 1496 aa44.97■■■■■ 4.79
KDSR-210ENST00000590056 PBRM1Q86U86 1689 aa44.92■■■■■ 4.78
KDSR-210ENST00000590056 ARHGEF11O15085 1522 aa44.84■■■■■ 4.77
KDSR-210ENST00000590056 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.83■■■■■ 4.77
KDSR-210ENST00000590056 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.83■■■■■ 4.77
KDSR-210ENST00000590056 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.83■■■■■ 4.77
KDSR-210ENST00000590056 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.68■■■■■ 4.74
KDSR-210ENST00000590056 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.66■■■■■ 4.74
KDSR-210ENST00000590056 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.64■■■■■ 4.74
KDSR-210ENST00000590056 ADAMTS12P58397 1594 aa44.59■■■■■ 4.73
KDSR-210ENST00000590056 GRIN2AQ12879 1464 aa44.59■■■■■ 4.73
KDSR-210ENST00000590056 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.57■■■■■ 4.73
KDSR-210ENST00000590056 KIF27Q86VH2 1401 aa44.48■■■■■ 4.71
KDSR-210ENST00000590056 ARAP1Q96P48 1450 aa44.41■■■■■ 4.7
KDSR-210ENST00000590056 NUP160Q12769 1436 aa44.41■■■■■ 4.7
KDSR-210ENST00000590056 IGF1RP08069 1367 aa44.31■■■■■ 4.68
KDSR-210ENST00000590056 CEP170Q5SW79 1584 aa44.29■■■■■ 4.68
KDSR-210ENST00000590056 CUL7Q14999 1698 aa44.15■■■■■ 4.66
KDSR-210ENST00000590056 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.06■■■■■ 4.64
KDSR-210ENST00000590056 JPH4Q96JJ6 628 aa44.06■■■■■ 4.64
KDSR-210ENST00000590056 SHROOM2Q13796 1616 aa44.05■■■■■ 4.64
KDSR-210ENST00000590056 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
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