RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589485.5

ILF3-215, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2

Gene ILF3, Length 620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-215ENST00000589485 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.53■■■■■ 5.68
ILF3-215ENST00000589485 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.07■■■■■ 4.81
ILF3-215ENST00000589485 ABCC9O60706 1549 aa44.31■■■■■ 4.68
ILF3-215ENST00000589485 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.53■■■■■ 4.4
ILF3-215ENST00000589485 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.41■■■■■ 4.38
ILF3-215ENST00000589485 NACADO15069 1562 aa42.39■■■■■ 4.38
ILF3-215ENST00000589485 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
ILF3-215ENST00000589485 MYO15BQ96JP2 1530 aa42■■■■■ 4.31
ILF3-215ENST00000589485 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.76■■■■■ 4.28
ILF3-215ENST00000589485 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.61■■■■■ 4.25
ILF3-215ENST00000589485 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.35■■■■■ 4.215e-10■□□□□ 8.4
ILF3-215ENST00000589485 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.2■■■■■ 4.19
ILF3-215ENST00000589485 SCRIBQ14160 1630 aa41.14■■■■■ 4.18
ILF3-215ENST00000589485 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.78■■■■■ 4.12
ILF3-215ENST00000589485 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.74■■■■■ 4.11
ILF3-215ENST00000589485 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
ILF3-215ENST00000589485 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.07■■■■■ 4.01
ILF3-215ENST00000589485 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.82■■■■□ 3.97
ILF3-215ENST00000589485 SMARCA4P51532 1647 aa39.29■■■■□ 3.88
ILF3-215ENST00000589485 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
ILF3-215ENST00000589485 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.09■■■■□ 3.85
ILF3-215ENST00000589485 NCAPD3P42695 1498 aa39.07■■■■□ 3.85
ILF3-215ENST00000589485 SMARCA2P51531 1590 aa39.07■■■■□ 3.84
ILF3-215ENST00000589485 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.94■■■■□ 3.82
ILF3-215ENST00000589485 HMGXB3Q12766 1538 aa38.9■■■■□ 3.82
ILF3-215ENST00000589485 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.85■■■■□ 3.81
ILF3-215ENST00000589485 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.8■■■■□ 3.8
ILF3-215ENST00000589485 WIZO95785 1651 aa38.56■■■■□ 3.76
ILF3-215ENST00000589485 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
ILF3-215ENST00000589485 NESP48681 1621 aa38.26■■■■□ 3.71
ILF3-215ENST00000589485 ERCC6Q03468 1493 aa38.25■■■■□ 3.71
ILF3-215ENST00000589485 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.14■■■■□ 3.7
ILF3-215ENST00000589485 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
ILF3-215ENST00000589485 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.95■■■■□ 3.67
ILF3-215ENST00000589485 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.89■■■■□ 3.66
ILF3-215ENST00000589485 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.86■■■■□ 3.65
ILF3-215ENST00000589485 CUX2O14529 1486 aa37.86■■■■□ 3.65
ILF3-215ENST00000589485 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
ILF3-215ENST00000589485 CFTRP13569 1480 aa37.67■■■■□ 3.62
ILF3-215ENST00000589485 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.64■■■■□ 3.62
ILF3-215ENST00000589485 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.55■■■■□ 3.6
ILF3-215ENST00000589485 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.54■■■■□ 3.6
ILF3-215ENST00000589485 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.52■■■■□ 3.6
ILF3-215ENST00000589485 PRDM2Q13029 1718 aa37.49■■■■□ 3.59
ILF3-215ENST00000589485 WDR62O43379 1518 aa37.38■■■■□ 3.57
ILF3-215ENST00000589485 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
ILF3-215ENST00000589485 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
ILF3-215ENST00000589485 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.92■■■■□ 3.5
ILF3-215ENST00000589485 TOPBP1Q92547 1522 aa36.91■■■■□ 3.5
ILF3-215ENST00000589485 ABCC8Q09428 1581 aa36.91■■■■□ 3.5
ILF3-215ENST00000589485 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.87■■■■□ 3.49
ILF3-215ENST00000589485 IFT140Q96RY7 1462 aa36.74■■■■□ 3.47
ILF3-215ENST00000589485 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
ILF3-215ENST00000589485 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
ILF3-215ENST00000589485 CUX1P39880 1505 aa36.55■■■■□ 3.44
ILF3-215ENST00000589485 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
ILF3-215ENST00000589485 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.48■■■■□ 3.43
ILF3-215ENST00000589485 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
ILF3-215ENST00000589485 SOGA1O94964 1423 aa36.44■■■■□ 3.42
ILF3-215ENST00000589485 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.43■■■■□ 3.42
ILF3-215ENST00000589485 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.37■■■■□ 3.416e-9■■■■□ 19.5
ILF3-215ENST00000589485 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
ILF3-215ENST00000589485 OSCARQ8IYS5 282 aa36.26■■■■□ 3.4
ILF3-215ENST00000589485 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.25■■■■□ 3.39
ILF3-215ENST00000589485 WDR97A6NE52 1622 aa36.23■■■■□ 3.39
ILF3-215ENST00000589485 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.21■■■■□ 3.39
ILF3-215ENST00000589485 TOP2BQ02880 1626 aa36.2■■■■□ 3.39
ILF3-215ENST00000589485 SYNJ1O43426 1573 aa36.18■■■■□ 3.38
ILF3-215ENST00000589485 CHD1O14646 1710 aa36.1■■■■□ 3.37
ILF3-215ENST00000589485 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.09■■■■□ 3.37
ILF3-215ENST00000589485 GRIN2BQ13224 1484 aa36.05■■■■□ 3.36
ILF3-215ENST00000589485 FBLN2P98095 1184 aa36.04■■■■□ 3.36
ILF3-215ENST00000589485 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.04■■■■□ 3.36
ILF3-215ENST00000589485 PBRM1Q86U86 1689 aa36.03■■■■□ 3.36
ILF3-215ENST00000589485 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.02■■■■□ 3.36
ILF3-215ENST00000589485 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.99■■■■□ 3.35
ILF3-215ENST00000589485 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
ILF3-215ENST00000589485 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
ILF3-215ENST00000589485 SYNJ2O15056 1496 aa35.83■■■■□ 3.33
ILF3-215ENST00000589485 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.74■■■■□ 3.31
ILF3-215ENST00000589485 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.74■■■■□ 3.31
ILF3-215ENST00000589485 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.74■■■■□ 3.31
ILF3-215ENST00000589485 TRIM41Q8WV44 630 aa35.73■■■■□ 3.31
ILF3-215ENST00000589485 ARHGEF11O15085 1522 aa35.68■■■■□ 3.3
ILF3-215ENST00000589485 ADAMTS12P58397 1594 aa35.68■■■■□ 3.3
ILF3-215ENST00000589485 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.67■■■■□ 3.3
ILF3-215ENST00000589485 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.62■■■■□ 3.29
ILF3-215ENST00000589485 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.58■■■■□ 3.29
ILF3-215ENST00000589485 GRIN2AQ12879 1464 aa35.57■■■■□ 3.28
ILF3-215ENST00000589485 KIF27Q86VH2 1401 aa35.51■■■■□ 3.28
ILF3-215ENST00000589485 CEP170Q5SW79 1584 aa35.42■■■■□ 3.26
ILF3-215ENST00000589485 NUP160Q12769 1436 aa35.39■■■■□ 3.26
ILF3-215ENST00000589485 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.38■■■■□ 3.25
ILF3-215ENST00000589485 ARAP1Q96P48 1450 aa35.37■■■■□ 3.25
ILF3-215ENST00000589485 CUL7Q14999 1698 aa35.35■■■■□ 3.25
ILF3-215ENST00000589485 IGF1RP08069 1367 aa35.35■■■■□ 3.25
ILF3-215ENST00000589485 SHROOM2Q13796 1616 aa35.18■■■■□ 3.22
ILF3-215ENST00000589485 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.17■■■■□ 3.22
ILF3-215ENST00000589485 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.16■■■■□ 3.22
ILF3-215ENST00000589485 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.1 ms