RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589329.5

TXNL1-208, Transcript of thioredoxin like 1, humanhuman

TSL 3

Gene TXNL1, Length 896 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1-208ENST00000589329 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.67■■■■□ 3.62
TXNL1-208ENST00000589329 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.66■■■□□ 2.98
TXNL1-208ENST00000589329 ABCC9O60706 1549 aa33.1■■■□□ 2.89
TXNL1-208ENST00000589329 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.81■■■□□ 2.68
TXNL1-208ENST00000589329 NACADO15069 1562 aa31.73■■■□□ 2.67
TXNL1-208ENST00000589329 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.5■■■□□ 2.63
TXNL1-208ENST00000589329 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.48■■■□□ 2.63
TXNL1-208ENST00000589329 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
TXNL1-208ENST00000589329 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.24■■■□□ 2.59
TXNL1-208ENST00000589329 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.97■■■□□ 2.55
TXNL1-208ENST00000589329 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.85■■■□□ 2.53
TXNL1-208ENST00000589329 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.79■■■□□ 2.52
TXNL1-208ENST00000589329 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.63■■■□□ 2.49
TXNL1-208ENST00000589329 SCRIBQ14160 1630 aa30.59■■■□□ 2.49
TXNL1-208ENST00000589329 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.58■■■□□ 2.49
TXNL1-208ENST00000589329 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
TXNL1-208ENST00000589329 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.96■■■□□ 2.39
TXNL1-208ENST00000589329 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.83■■■□□ 2.37
TXNL1-208ENST00000589329 SMARCA4P51532 1647 aa29.28■■■□□ 2.28
TXNL1-208ENST00000589329 NCAPD3P42695 1498 aa29.27■■■□□ 2.28
TXNL1-208ENST00000589329 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
TXNL1-208ENST00000589329 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.21■■■□□ 2.27
TXNL1-208ENST00000589329 SMARCA2P51531 1590 aa29.2■■■□□ 2.26
TXNL1-208ENST00000589329 HMGXB3Q12766 1538 aa29.11■■■□□ 2.25
TXNL1-208ENST00000589329 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.05■■■□□ 2.24
TXNL1-208ENST00000589329 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.97■■■□□ 2.23
TXNL1-208ENST00000589329 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
TXNL1-208ENST00000589329 WIZO95785 1651 aa28.62■■■□□ 2.17
TXNL1-208ENST00000589329 ERCC6Q03468 1493 aa28.62■■■□□ 2.17
TXNL1-208ENST00000589329 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
TXNL1-208ENST00000589329 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.54■■■□□ 2.16
TXNL1-208ENST00000589329 NESP48681 1621 aa28.54■■■□□ 2.16
TXNL1-208ENST00000589329 CUX2O14529 1486 aa28.47■■■□□ 2.15
TXNL1-208ENST00000589329 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
TXNL1-208ENST00000589329 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.38■■■□□ 2.13
TXNL1-208ENST00000589329 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.37■■■□□ 2.13
TXNL1-208ENST00000589329 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
TXNL1-208ENST00000589329 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.2■■■□□ 2.11
TXNL1-208ENST00000589329 CFTRP13569 1480 aa28.16■■■□□ 2.1
TXNL1-208ENST00000589329 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.07■■■□□ 2.08
TXNL1-208ENST00000589329 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.05■■■□□ 2.08
TXNL1-208ENST00000589329 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.04■■■□□ 2.08
TXNL1-208ENST00000589329 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.02■■■□□ 2.08
TXNL1-208ENST00000589329 WDR62O43379 1518 aa27.99■■■□□ 2.07
TXNL1-208ENST00000589329 PRDM2Q13029 1718 aa27.89■■■□□ 2.06
TXNL1-208ENST00000589329 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.86■■■□□ 2.05
TXNL1-208ENST00000589329 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
TXNL1-208ENST00000589329 ABCC8Q09428 1581 aa27.61■■■□□ 2.01
TXNL1-208ENST00000589329 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TXNL1-208ENST00000589329 TOPBP1Q92547 1522 aa27.56■■■□□ 2
TXNL1-208ENST00000589329 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.52■■■□□ 2
TXNL1-208ENST00000589329 IFT140Q96RY7 1462 aa27.49■■□□□ 1.99
TXNL1-208ENST00000589329 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TXNL1-208ENST00000589329 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TXNL1-208ENST00000589329 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
TXNL1-208ENST00000589329 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
TXNL1-208ENST00000589329 CUX1P39880 1505 aa27.21■■□□□ 1.95
TXNL1-208ENST00000589329 OSCARQ8IYS5 282 aa27.19■■□□□ 1.94
TXNL1-208ENST00000589329 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.19■■□□□ 1.94
TXNL1-208ENST00000589329 SOGA1O94964 1423 aa27.18■■□□□ 1.94
TXNL1-208ENST00000589329 WDR97A6NE52 1622 aa27.15■■□□□ 1.94
TXNL1-208ENST00000589329 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.13■■□□□ 1.93
TXNL1-208ENST00000589329 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
TXNL1-208ENST00000589329 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TXNL1-208ENST00000589329 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
TXNL1-208ENST00000589329 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.95■■□□□ 1.9
TXNL1-208ENST00000589329 TOP2BQ02880 1626 aa26.94■■□□□ 1.9
TXNL1-208ENST00000589329 GRIN2BQ13224 1484 aa26.93■■□□□ 1.9
TXNL1-208ENST00000589329 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.93■■□□□ 1.9
TXNL1-208ENST00000589329 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TXNL1-208ENST00000589329 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.89■■□□□ 1.9
TXNL1-208ENST00000589329 CHD1O14646 1710 aa26.89■■□□□ 1.9
TXNL1-208ENST00000589329 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.87■■□□□ 1.89
TXNL1-208ENST00000589329 SYNJ1O43426 1573 aa26.87■■□□□ 1.89
TXNL1-208ENST00000589329 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.84■■□□□ 1.89
TXNL1-208ENST00000589329 FBLN2P98095 1184 aa26.84■■□□□ 1.89
TXNL1-208ENST00000589329 SYNJ2O15056 1496 aa26.8■■□□□ 1.88
TXNL1-208ENST00000589329 PBRM1Q86U86 1689 aa26.79■■□□□ 1.88
TXNL1-208ENST00000589329 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TXNL1-208ENST00000589329 TRIM41Q8WV44 630 aa26.75■■□□□ 1.87
TXNL1-208ENST00000589329 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.74■■□□□ 1.87
TXNL1-208ENST00000589329 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.74■■□□□ 1.87
TXNL1-208ENST00000589329 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.74■■□□□ 1.87
TXNL1-208ENST00000589329 ARHGEF11O15085 1522 aa26.74■■□□□ 1.87
TXNL1-208ENST00000589329 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.65■■□□□ 1.86
TXNL1-208ENST00000589329 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.64■■□□□ 1.85
TXNL1-208ENST00000589329 ADAMTS12P58397 1594 aa26.61■■□□□ 1.85
TXNL1-208ENST00000589329 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.58■■□□□ 1.85
TXNL1-208ENST00000589329 GRIN2AQ12879 1464 aa26.57■■□□□ 1.84
TXNL1-208ENST00000589329 ARAP1Q96P48 1450 aa26.49■■□□□ 1.83
TXNL1-208ENST00000589329 NUP160Q12769 1436 aa26.48■■□□□ 1.83
TXNL1-208ENST00000589329 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.46■■□□□ 1.83
TXNL1-208ENST00000589329 KIF27Q86VH2 1401 aa26.46■■□□□ 1.83
TXNL1-208ENST00000589329 CEP170Q5SW79 1584 aa26.41■■□□□ 1.82
TXNL1-208ENST00000589329 IGF1RP08069 1367 aa26.34■■□□□ 1.81
TXNL1-208ENST00000589329 CUL7Q14999 1698 aa26.33■■□□□ 1.81
TXNL1-208ENST00000589329 SHROOM2Q13796 1616 aa26.29■■□□□ 1.8
TXNL1-208ENST00000589329 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.22■■□□□ 1.79
TXNL1-208ENST00000589329 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.19■■□□□ 1.78
TXNL1-208ENST00000589329 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.5 ms