RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588475.1

FAM210A-204, Transcript of family with sequence similarity 210 member A, humanhuman

TSL 3

Gene FAM210A, Length 1,389 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM210A-204ENST00000588475 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.98■■■■■ 7.83
FAM210A-204ENST00000588475 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.33■■■■■ 6.77
FAM210A-204ENST00000588475 ABCC9O60706 1549 aa57.3■■■■■ 6.76
FAM210A-204ENST00000588475 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.53■■■■■ 6.32
FAM210A-204ENST00000588475 NACADO15069 1562 aa54.2■■■■■ 6.27
FAM210A-204ENST00000588475 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.85■■■■■ 6.21
FAM210A-204ENST00000588475 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.72■■■■■ 6.19
FAM210A-204ENST00000588475 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.52■■■■■ 6.16
FAM210A-204ENST00000588475 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.35■■■■■ 6.13
FAM210A-204ENST00000588475 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.29■■■■■ 6.12
FAM210A-204ENST00000588475 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.09■■■■■ 6.09
FAM210A-204ENST00000588475 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.03■■■■■ 6.08
FAM210A-204ENST00000588475 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.87■■■■■ 6.05
FAM210A-204ENST00000588475 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.28■■■■■ 5.96
FAM210A-204ENST00000588475 SCRIBQ14160 1630 aa52.28■■■■■ 5.96
FAM210A-204ENST00000588475 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.75■■■■■ 5.87
FAM210A-204ENST00000588475 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.68■■■■■ 5.86
FAM210A-204ENST00000588475 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.6■■■■■ 5.85
FAM210A-204ENST00000588475 NCAPD3P42695 1498 aa50.07■■■■■ 5.61
FAM210A-204ENST00000588475 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.94■■■■■ 5.59
FAM210A-204ENST00000588475 SMARCA4P51532 1647 aa49.89■■■■■ 5.58
FAM210A-204ENST00000588475 SMARCA2P51531 1590 aa49.75■■■■■ 5.56
FAM210A-204ENST00000588475 HMGXB3Q12766 1538 aa49.7■■■■■ 5.55
FAM210A-204ENST00000588475 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.63■■■■■ 5.54
FAM210A-204ENST00000588475 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.43■■■■■ 5.5
FAM210A-204ENST00000588475 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.42■■■■■ 5.5
FAM210A-204ENST00000588475 ERCC6Q03468 1493 aa49.42■■■■■ 5.5
FAM210A-204ENST00000588475 CUX2O14529 1486 aa49.33■■■■■ 5.49
FAM210A-204ENST00000588475 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.33■■■■■ 5.49
FAM210A-204ENST00000588475 NESP48681 1621 aa49.27■■■■■ 5.48
FAM210A-204ENST00000588475 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.19■■■■■ 5.47
FAM210A-204ENST00000588475 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.88■■■■■ 5.42
FAM210A-204ENST00000588475 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.75■■■■■ 5.4
FAM210A-204ENST00000588475 WIZO95785 1651 aa48.7■■■■■ 5.39
FAM210A-204ENST00000588475 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.59■■■■■ 5.37
FAM210A-204ENST00000588475 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.58■■■■■ 5.37
FAM210A-204ENST00000588475 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.54■■■■■ 5.36
FAM210A-204ENST00000588475 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.34■■■■■ 5.33
FAM210A-204ENST00000588475 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.2■■■■■ 5.31
FAM210A-204ENST00000588475 WDR62O43379 1518 aa48.11■■■■■ 5.29
FAM210A-204ENST00000588475 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
FAM210A-204ENST00000588475 CFTRP13569 1480 aa48.03■■■■■ 5.28
FAM210A-204ENST00000588475 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.02■■■■■ 5.28
FAM210A-204ENST00000588475 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.99■■■■■ 5.27
FAM210A-204ENST00000588475 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.62■■■■■ 5.21
FAM210A-204ENST00000588475 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.56■■■■■ 5.2
FAM210A-204ENST00000588475 PRDM2Q13029 1718 aa47.44■■■■■ 5.19
FAM210A-204ENST00000588475 TOPBP1Q92547 1522 aa47.1■■■■■ 5.13
FAM210A-204ENST00000588475 IFT140Q96RY7 1462 aa47.06■■■■■ 5.12
FAM210A-204ENST00000588475 TRIM41Q8WV44 630 aa47.04■■■■■ 5.12
FAM210A-204ENST00000588475 OSCARQ8IYS5 282 aa47.03■■■■■ 5.12
FAM210A-204ENST00000588475 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.03■■■■■ 5.12
FAM210A-204ENST00000588475 ABCC8Q09428 1581 aa46.92■■■■■ 5.1
FAM210A-204ENST00000588475 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.92■■■■■ 5.1
FAM210A-204ENST00000588475 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
FAM210A-204ENST00000588475 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.68■■■■■ 5.06
FAM210A-204ENST00000588475 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
FAM210A-204ENST00000588475 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.58■■■■■ 5.05
FAM210A-204ENST00000588475 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.47■■■■■ 5.03
FAM210A-204ENST00000588475 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.47■■■■■ 5.03
FAM210A-204ENST00000588475 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.47■■■■■ 5.03
FAM210A-204ENST00000588475 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.47■■■■■ 5.03
FAM210A-204ENST00000588475 SOGA1O94964 1423 aa46.38■■■■■ 5.01
FAM210A-204ENST00000588475 ARHGEF11O15085 1522 aa46.37■■■■■ 5.01
FAM210A-204ENST00000588475 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.35■■■■■ 5.01
FAM210A-204ENST00000588475 CUX1P39880 1505 aa46.34■■■■■ 5.01
FAM210A-204ENST00000588475 CHD1O14646 1710 aa46.32■■■■■ 5.01
FAM210A-204ENST00000588475 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
FAM210A-204ENST00000588475 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
FAM210A-204ENST00000588475 FBLN2P98095 1184 aa46.17■■■■■ 4.98
FAM210A-204ENST00000588475 WDR97A6NE52 1622 aa46.16■■■■■ 4.98
FAM210A-204ENST00000588475 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.11■■■■■ 4.97
FAM210A-204ENST00000588475 GRIN2BQ13224 1484 aa45.98■■■■■ 4.95
FAM210A-204ENST00000588475 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
FAM210A-204ENST00000588475 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.96■■■■■ 4.95
FAM210A-204ENST00000588475 ARAP1Q96P48 1450 aa45.94■■■■■ 4.95
FAM210A-204ENST00000588475 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.87■■■■■ 4.93
FAM210A-204ENST00000588475 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.85■■■■■ 4.93
FAM210A-204ENST00000588475 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.83■■■■■ 4.93
FAM210A-204ENST00000588475 SYNJ2O15056 1496 aa45.83■■■■■ 4.93
FAM210A-204ENST00000588475 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.83■■■■■ 4.93
FAM210A-204ENST00000588475 SYNJ1O43426 1573 aa45.78■■■■■ 4.92
FAM210A-204ENST00000588475 PBRM1Q86U86 1689 aa45.77■■■■■ 4.92
FAM210A-204ENST00000588475 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.76■■■■■ 4.92
FAM210A-204ENST00000588475 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.62■■■■■ 4.89
FAM210A-204ENST00000588475 TOP2BQ02880 1626 aa45.58■■■■■ 4.89
FAM210A-204ENST00000588475 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.57■■■■■ 4.89
FAM210A-204ENST00000588475 ADAMTS12P58397 1594 aa45.41■■■■■ 4.86
FAM210A-204ENST00000588475 GRIN2AQ12879 1464 aa45.41■■■■■ 4.86
FAM210A-204ENST00000588475 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
FAM210A-204ENST00000588475 NUP160Q12769 1436 aa45.28■■■■■ 4.84
FAM210A-204ENST00000588475 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.26■■■■■ 4.84
FAM210A-204ENST00000588475 CEP170Q5SW79 1584 aa45.26■■■■■ 4.84
FAM210A-204ENST00000588475 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.23■■■■■ 4.83
FAM210A-204ENST00000588475 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.18■■■■■ 4.82
FAM210A-204ENST00000588475 SHROOM2Q13796 1616 aa45.04■■■■■ 4.8
FAM210A-204ENST00000588475 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
FAM210A-204ENST00000588475 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.77■■■■■ 4.76
FAM210A-204ENST00000588475 JPH4Q96JJ6 628 aa44.74■■■■■ 4.75
FAM210A-204ENST00000588475 IGF1RP08069 1367 aa44.69■■■■■ 4.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms