RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587932.2

GPX4-205, Transcript of glutathione peroxidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene GPX4, Length 274 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPX4-205ENST00000587932 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.53■■■■■ 8.72
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GPX4-205ENST00000587932 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.13■■■■■ 6.58
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GPX4-205ENST00000587932 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.85■■■■■ 6.37
GPX4-205ENST00000587932 SMARCA4P51532 1647 aa54.03■■■■■ 6.24
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GPX4-205ENST00000587932 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.84■■■■■ 6.21
GPX4-205ENST00000587932 SMARCA2P51531 1590 aa53.74■■■■■ 6.19
GPX4-205ENST00000587932 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.58■■■■■ 6.17
GPX4-205ENST00000587932 HMGXB3Q12766 1538 aa53.56■■■■■ 6.16
GPX4-205ENST00000587932 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.52■■■■■ 6.16
GPX4-205ENST00000587932 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.35■■■■■ 6.13
GPX4-205ENST00000587932 WIZO95785 1651 aa52.98■■■■■ 6.07
GPX4-205ENST00000587932 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.83■■■■■ 6.05
GPX4-205ENST00000587932 NESP48681 1621 aa52.68■■■■■ 6.02
GPX4-205ENST00000587932 ERCC6Q03468 1493 aa52.58■■■■■ 6.01
GPX4-205ENST00000587932 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.49■■■■■ 5.99
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GPX4-205ENST00000587932 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.14■■■■■ 5.94
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GPX4-205ENST00000587932 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.67■■■■■ 5.86
GPX4-205ENST00000587932 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.64■■■■■ 5.86
GPX4-205ENST00000587932 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.63■■■■■ 5.86
GPX4-205ENST00000587932 WDR62O43379 1518 aa51.49■■■■■ 5.83
GPX4-205ENST00000587932 PRDM2Q13029 1718 aa51.47■■■■■ 5.83
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GPX4-205ENST00000587932 TOPBP1Q92547 1522 aa50.81■■■■■ 5.72
GPX4-205ENST00000587932 ABCC8Q09428 1581 aa50.77■■■■■ 5.72
GPX4-205ENST00000587932 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.71■■■■■ 5.71
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GPX4-205ENST00000587932 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.14■■■■■ 5.62
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GPX4-205ENST00000587932 WDR97A6NE52 1622 aa49.86■■■■■ 5.57
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GPX4-205ENST00000587932 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.2■■■■■ 5.47
GPX4-205ENST00000587932 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.2■■■■■ 5.47
GPX4-205ENST00000587932 ARHGEF11O15085 1522 aa49.15■■■■■ 5.46
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GPX4-205ENST00000587932 SHROOM2Q13796 1616 aa48.44■■■■■ 5.35
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GPX4-205ENST00000587932 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.35■■■■■ 5.33
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