RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587775.1

TMUB2-208, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene TMUB2, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-208ENST00000587775 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22■■□□□ 1.11
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TMUB2-208ENST00000587775 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.03■□□□□ 0.48
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TMUB2-208ENST00000587775 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.87■□□□□ 0.29
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TMUB2-208ENST00000587775 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.04■□□□□ 0.16
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TMUB2-208ENST00000587775 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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TMUB2-208ENST00000587775 SYNJ1O43426 1573 aa15.8■□□□□ 0.12
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TMUB2-208ENST00000587775 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.65■□□□□ 0.1
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TMUB2-208ENST00000587775 IFT140Q96RY7 1462 aa15.65■□□□□ 0.1
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TMUB2-208ENST00000587775 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.54■□□□□ 0.08
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TMUB2-208ENST00000587775 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.5■□□□□ 0.07
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TMUB2-208ENST00000587775 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.23■□□□□ 0.03
TMUB2-208ENST00000587775 NUP160Q12769 1436 aa15.23■□□□□ 0.03
TMUB2-208ENST00000587775 KIF21BO75037 1637 aa15.22■□□□□ 0.03
TMUB2-208ENST00000587775 CHD1O14646 1710 aa15.2■□□□□ 0.02
TMUB2-208ENST00000587775 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TMUB2-208ENST00000587775 CEP170Q5SW79 1584 aa15.17■□□□□ 0.02
TMUB2-208ENST00000587775 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TMUB2-208ENST00000587775 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.15■□□□□ 0.02
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