RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587708.6

PSENEN-202, Transcript of presenilin enhancer, gamma-secretase subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSENEN, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENEN-202ENST00000587708 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.32■■■■□ 3.88
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PSENEN-202ENST00000587708 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.32■■■□□ 2.76
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PSENEN-202ENST00000587708 NACADO15069 1562 aa31.93■■■□□ 2.7
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PSENEN-202ENST00000587708 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.43■■■□□ 2.46
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PSENEN-202ENST00000587708 SMARCA2P51531 1590 aa29.71■■■□□ 2.35
PSENEN-202ENST00000587708 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.71■■■□□ 2.35
PSENEN-202ENST00000587708 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.66■■■□□ 2.34
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PSENEN-202ENST00000587708 HMGXB3Q12766 1538 aa29.41■■■□□ 2.3
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PSENEN-202ENST00000587708 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.12■■■□□ 2.25
PSENEN-202ENST00000587708 CFTRP13569 1480 aa28.81■■■□□ 2.2
PSENEN-202ENST00000587708 ABCC8Q09428 1581 aa28.79■■■□□ 2.2
PSENEN-202ENST00000587708 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
PSENEN-202ENST00000587708 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.69■■■□□ 2.18
PSENEN-202ENST00000587708 PRDM2Q13029 1718 aa28.62■■■□□ 2.17
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PSENEN-202ENST00000587708 SYNJ1O43426 1573 aa28.52■■■□□ 2.16
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PSENEN-202ENST00000587708 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.48■■■□□ 2.15
PSENEN-202ENST00000587708 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.46■■■□□ 2.15
PSENEN-202ENST00000587708 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
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PSENEN-202ENST00000587708 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.28■■■□□ 2.12
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PSENEN-202ENST00000587708 KIF27Q86VH2 1401 aa28.06■■■□□ 2.08
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PSENEN-202ENST00000587708 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
PSENEN-202ENST00000587708 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.89■■■□□ 2.06
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PSENEN-202ENST00000587708 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
PSENEN-202ENST00000587708 PRXQ9BXM0 1461 aa27.87■■■□□ 2.05
PSENEN-202ENST00000587708 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.87■■■□□ 2.05
PSENEN-202ENST00000587708 CUX2O14529 1486 aa27.87■■■□□ 2.05
PSENEN-202ENST00000587708 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.85■■■□□ 2.05
PSENEN-202ENST00000587708 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.79■■■□□ 2.04
PSENEN-202ENST00000587708 CEP162Q5TB80 1403 aa27.77■■■□□ 2.04
PSENEN-202ENST00000587708 IGF1RP08069 1367 aa27.77■■■□□ 2.04
PSENEN-202ENST00000587708 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.77■■■□□ 2.04
PSENEN-202ENST00000587708 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.72■■■□□ 2.03
PSENEN-202ENST00000587708 WDR97A6NE52 1622 aa27.66■■■□□ 2.02
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PSENEN-202ENST00000587708 GRIN2BQ13224 1484 aa27.32■■□□□ 1.96
PSENEN-202ENST00000587708 PBRM1Q86U86 1689 aa27.28■■□□□ 1.96
PSENEN-202ENST00000587708 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.28■■□□□ 1.96
PSENEN-202ENST00000587708 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
PSENEN-202ENST00000587708 ARAP1Q96P48 1450 aa27.21■■□□□ 1.95
PSENEN-202ENST00000587708 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.21■■□□□ 1.95
PSENEN-202ENST00000587708 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
PSENEN-202ENST00000587708 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PSENEN-202ENST00000587708 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.19■■□□□ 1.94
PSENEN-202ENST00000587708 APLP2Q06481 763 aa27.17■■□□□ 1.94
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