RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586847.1

RBFA-203, Transcript of ribosome binding factor A, humanhuman

TSL 4

Gene RBFA, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFA-203ENST00000586847 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.24■■■■■ 6.59
RBFA-203ENST00000586847 ABCC9O60706 1549 aa50.76■■■■■ 5.72
RBFA-203ENST00000586847 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.52■■■■■ 5.68
RBFA-203ENST00000586847 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.11■■■■■ 5.29
RBFA-203ENST00000586847 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.83■■■■■ 5.25
RBFA-203ENST00000586847 NACADO15069 1562 aa47.73■■■■■ 5.23
RBFA-203ENST00000586847 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.45■■■■■ 5.19
RBFA-203ENST00000586847 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.31■■■■■ 5.16
RBFA-203ENST00000586847 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.22■■■■■ 5.15
RBFA-203ENST00000586847 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.97■■■■■ 5.11
RBFA-203ENST00000586847 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.93■■■■■ 5.1
RBFA-203ENST00000586847 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.61■■■■■ 5.05
RBFA-203ENST00000586847 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.36■■■■■ 5.01
RBFA-203ENST00000586847 SCRIBQ14160 1630 aa46.16■■■■■ 4.98
RBFA-203ENST00000586847 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.96■■■■■ 4.95
RBFA-203ENST00000586847 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.85■■■■■ 4.93
RBFA-203ENST00000586847 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.69■■■■■ 4.9
RBFA-203ENST00000586847 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.67■■■■■ 4.9
RBFA-203ENST00000586847 NCAPD3P42695 1498 aa44.08■■■■■ 4.65
RBFA-203ENST00000586847 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.99■■■■■ 4.63
RBFA-203ENST00000586847 SMARCA4P51532 1647 aa43.96■■■■■ 4.63
RBFA-203ENST00000586847 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.82■■■■■ 4.61
RBFA-203ENST00000586847 SMARCA2P51531 1590 aa43.77■■■■■ 4.6
RBFA-203ENST00000586847 HMGXB3Q12766 1538 aa43.77■■■■■ 4.6
RBFA-203ENST00000586847 ERCC6Q03468 1493 aa43.7■■■■■ 4.59
RBFA-203ENST00000586847 CUX2O14529 1486 aa43.65■■■■■ 4.58
RBFA-203ENST00000586847 NESP48681 1621 aa43.64■■■■■ 4.58
RBFA-203ENST00000586847 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.61■■■■■ 4.57
RBFA-203ENST00000586847 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
RBFA-203ENST00000586847 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.47■■■■■ 4.55
RBFA-203ENST00000586847 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.43■■■■■ 4.54
RBFA-203ENST00000586847 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
RBFA-203ENST00000586847 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.12■■■■■ 4.49
RBFA-203ENST00000586847 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.09■■■■■ 4.49
RBFA-203ENST00000586847 WIZO95785 1651 aa42.95■■■■■ 4.47
RBFA-203ENST00000586847 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.78■■■■■ 4.44
RBFA-203ENST00000586847 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.72■■■■■ 4.43
RBFA-203ENST00000586847 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.54■■■■■ 4.4
RBFA-203ENST00000586847 WDR62O43379 1518 aa42.49■■■■■ 4.39
RBFA-203ENST00000586847 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
RBFA-203ENST00000586847 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.32■■■■■ 4.37
RBFA-203ENST00000586847 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.3■■■■■ 4.36
RBFA-203ENST00000586847 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
RBFA-203ENST00000586847 CFTRP13569 1480 aa42.24■■■■■ 4.35
RBFA-203ENST00000586847 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
RBFA-203ENST00000586847 PRDM2Q13029 1718 aa41.92■■■■■ 4.3
RBFA-203ENST00000586847 TRIM41Q8WV44 630 aa41.9■■■■■ 4.3
RBFA-203ENST00000586847 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.81■■■■■ 4.28
RBFA-203ENST00000586847 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
RBFA-203ENST00000586847 OSCARQ8IYS5 282 aa41.56■■■■■ 4.24
RBFA-203ENST00000586847 TOPBP1Q92547 1522 aa41.51■■■■■ 4.24
RBFA-203ENST00000586847 IFT140Q96RY7 1462 aa41.45■■■■■ 4.23
RBFA-203ENST00000586847 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
RBFA-203ENST00000586847 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.33■■■■■ 4.21
RBFA-203ENST00000586847 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.29■■■■■ 4.2
RBFA-203ENST00000586847 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.29■■■■■ 4.2
RBFA-203ENST00000586847 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.29■■■■■ 4.2
RBFA-203ENST00000586847 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
RBFA-203ENST00000586847 ABCC8Q09428 1581 aa41.2■■■■■ 4.19
RBFA-203ENST00000586847 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.178e-10■■■■□ 25.7
RBFA-203ENST00000586847 CHD1O14646 1710 aa41.1■■■■■ 4.17
RBFA-203ENST00000586847 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
RBFA-203ENST00000586847 ARHGEF11O15085 1522 aa41.08■■■■■ 4.17
RBFA-203ENST00000586847 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41■■■■■ 4.15
RBFA-203ENST00000586847 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
RBFA-203ENST00000586847 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.81■■■■■ 4.12
RBFA-203ENST00000586847 CUX1P39880 1505 aa40.81■■■■■ 4.12
RBFA-203ENST00000586847 SOGA1O94964 1423 aa40.8■■■■■ 4.12
RBFA-203ENST00000586847 FBLN2P98095 1184 aa40.76■■■■■ 4.12
RBFA-203ENST00000586847 ARAP1Q96P48 1450 aa40.71■■■■■ 4.11
RBFA-203ENST00000586847 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.7■■■■■ 4.11
RBFA-203ENST00000586847 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.7■■■■■ 4.11
RBFA-203ENST00000586847 WDR97A6NE52 1622 aa40.63■■■■■ 4.09
RBFA-203ENST00000586847 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.56■■■■■ 4.08
RBFA-203ENST00000586847 PBRM1Q86U86 1689 aa40.47■■■■■ 4.07
RBFA-203ENST00000586847 GRIN2BQ13224 1484 aa40.46■■■■■ 4.07
RBFA-203ENST00000586847 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
RBFA-203ENST00000586847 SYNJ1O43426 1573 aa40.4■■■■■ 4.06
RBFA-203ENST00000586847 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
RBFA-203ENST00000586847 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
RBFA-203ENST00000586847 SYNJ2O15056 1496 aa40.36■■■■■ 4.05
RBFA-203ENST00000586847 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.33■■■■■ 4.05
RBFA-203ENST00000586847 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.32■■■■■ 4.05
RBFA-203ENST00000586847 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.28■■■■■ 4.04
RBFA-203ENST00000586847 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
RBFA-203ENST00000586847 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.09■■■■■ 4.01
RBFA-203ENST00000586847 TOP2BQ02880 1626 aa40.05■■■■■ 4
RBFA-203ENST00000586847 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.04■■■■■ 4
RBFA-203ENST00000586847 ADAMTS12P58397 1594 aa40.03■■■■■ 4
RBFA-203ENST00000586847 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40■■■■□ 3.99
RBFA-203ENST00000586847 GRIN2AQ12879 1464 aa40■■■■□ 3.99
RBFA-203ENST00000586847 CEP170Q5SW79 1584 aa39.97■■■■□ 3.99
RBFA-203ENST00000586847 NUP160Q12769 1436 aa39.87■■■■□ 3.97
RBFA-203ENST00000586847 SHROOM2Q13796 1616 aa39.78■■■■□ 3.96
RBFA-203ENST00000586847 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.77■■■■□ 3.96
RBFA-203ENST00000586847 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.74■■■■□ 3.95
RBFA-203ENST00000586847 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.49■■■■□ 3.91
RBFA-203ENST00000586847 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
RBFA-203ENST00000586847 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.41■■■■□ 3.9
RBFA-203ENST00000586847 JPH4Q96JJ6 628 aa39.37■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.9 ms