RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586825.1

TXNL4A-207, Transcript of thioredoxin like 4A, humanhuman

TSL 3

Gene TXNL4A, Length 586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL4A-207ENST00000586825 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.26■■■■■ 8.2
TXNL4A-207ENST00000586825 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.33■■■■■ 7.09
TXNL4A-207ENST00000586825 ABCC9O60706 1549 aa59.26■■■■■ 7.08
TXNL4A-207ENST00000586825 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.41■■■■■ 6.62
TXNL4A-207ENST00000586825 NACADO15069 1562 aa56.08■■■■■ 6.57
TXNL4A-207ENST00000586825 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.83■■■■■ 6.53
TXNL4A-207ENST00000586825 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.55■■■■■ 6.48
TXNL4A-207ENST00000586825 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.36■■■■■ 6.45
TXNL4A-207ENST00000586825 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.23■■■■■ 6.43
TXNL4A-207ENST00000586825 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.2■■■■■ 6.43
TXNL4A-207ENST00000586825 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.95■■■■■ 6.39
TXNL4A-207ENST00000586825 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.86■■■■■ 6.37
TXNL4A-207ENST00000586825 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.71■■■■■ 6.35
TXNL4A-207ENST00000586825 SCRIBQ14160 1630 aa54.13■■■■■ 6.26
TXNL4A-207ENST00000586825 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.02■■■■■ 6.24
TXNL4A-207ENST00000586825 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.53■■■■■ 6.16
TXNL4A-207ENST00000586825 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.45■■■■■ 6.15
TXNL4A-207ENST00000586825 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.35■■■■■ 6.13
TXNL4A-207ENST00000586825 NCAPD3P42695 1498 aa51.8■■■■■ 5.88
TXNL4A-207ENST00000586825 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.68■■■■■ 5.86
TXNL4A-207ENST00000586825 SMARCA4P51532 1647 aa51.64■■■■■ 5.86
TXNL4A-207ENST00000586825 SMARCA2P51531 1590 aa51.48■■■■■ 5.83
TXNL4A-207ENST00000586825 HMGXB3Q12766 1538 aa51.4■■■■■ 5.82
TXNL4A-207ENST00000586825 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.38■■■■■ 5.82
TXNL4A-207ENST00000586825 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.15■■■■■ 5.78
TXNL4A-207ENST00000586825 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.15■■■■■ 5.78
TXNL4A-207ENST00000586825 ERCC6Q03468 1493 aa51.1■■■■■ 5.77
TXNL4A-207ENST00000586825 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.09■■■■■ 5.77
TXNL4A-207ENST00000586825 NESP48681 1621 aa50.98■■■■■ 5.75
TXNL4A-207ENST00000586825 CUX2O14529 1486 aa50.97■■■■■ 5.75
TXNL4A-207ENST00000586825 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.82■■■■■ 5.73
TXNL4A-207ENST00000586825 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.57■■■■■ 5.69
TXNL4A-207ENST00000586825 WIZO95785 1651 aa50.47■■■■■ 5.67
TXNL4A-207ENST00000586825 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.41■■■■■ 5.66
TXNL4A-207ENST00000586825 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.28■■■■■ 5.64
TXNL4A-207ENST00000586825 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.27■■■■■ 5.64
TXNL4A-207ENST00000586825 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.23■■■■■ 5.63
TXNL4A-207ENST00000586825 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.08■■■■■ 5.61
TXNL4A-207ENST00000586825 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.85■■■■■ 5.57
TXNL4A-207ENST00000586825 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.8■■■■■ 5.56
TXNL4A-207ENST00000586825 WDR62O43379 1518 aa49.74■■■■■ 5.55
TXNL4A-207ENST00000586825 CFTRP13569 1480 aa49.69■■■■■ 5.55
TXNL4A-207ENST00000586825 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.67■■■■■ 5.54
TXNL4A-207ENST00000586825 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.66■■■■■ 5.54
TXNL4A-207ENST00000586825 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.28■■■■■ 5.48
TXNL4A-207ENST00000586825 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
TXNL4A-207ENST00000586825 PRDM2Q13029 1718 aa49.15■■■■■ 5.46
TXNL4A-207ENST00000586825 TOPBP1Q92547 1522 aa48.74■■■■■ 5.39
TXNL4A-207ENST00000586825 IFT140Q96RY7 1462 aa48.67■■■■■ 5.38
TXNL4A-207ENST00000586825 OSCARQ8IYS5 282 aa48.67■■■■■ 5.38
TXNL4A-207ENST00000586825 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.66■■■■■ 5.38
TXNL4A-207ENST00000586825 TRIM41Q8WV44 630 aa48.64■■■■■ 5.38
TXNL4A-207ENST00000586825 ABCC8Q09428 1581 aa48.58■■■■■ 5.37
TXNL4A-207ENST00000586825 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.56■■■■■ 5.36
TXNL4A-207ENST00000586825 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
TXNL4A-207ENST00000586825 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.31■■■■■ 5.32
TXNL4A-207ENST00000586825 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.26■■■■■ 5.32
TXNL4A-207ENST00000586825 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.22■■■■■ 5.31
TXNL4A-207ENST00000586825 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.1■■■■■ 5.29
TXNL4A-207ENST00000586825 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.06■■■■■ 5.28
TXNL4A-207ENST00000586825 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.06■■■■■ 5.28
TXNL4A-207ENST00000586825 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.06■■■■■ 5.28
TXNL4A-207ENST00000586825 SOGA1O94964 1423 aa48.03■■■■■ 5.28
TXNL4A-207ENST00000586825 CUX1P39880 1505 aa47.98■■■■■ 5.27
TXNL4A-207ENST00000586825 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.97■■■■■ 5.27
TXNL4A-207ENST00000586825 CHD1O14646 1710 aa47.95■■■■■ 5.27
TXNL4A-207ENST00000586825 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.94■■■■■ 5.26
TXNL4A-207ENST00000586825 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.94■■■■■ 5.26
TXNL4A-207ENST00000586825 ARHGEF11O15085 1522 aa47.91■■■■■ 5.26
TXNL4A-207ENST00000586825 FBLN2P98095 1184 aa47.81■■■■■ 5.24
TXNL4A-207ENST00000586825 WDR97A6NE52 1622 aa47.75■■■■■ 5.23
TXNL4A-207ENST00000586825 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.72■■■■■ 5.23
TXNL4A-207ENST00000586825 GRIN2BQ13224 1484 aa47.58■■■■■ 5.21
TXNL4A-207ENST00000586825 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.55■■■■■ 5.2
TXNL4A-207ENST00000586825 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.55■■■■■ 5.2
TXNL4A-207ENST00000586825 ARAP1Q96P48 1450 aa47.48■■■■■ 5.19
TXNL4A-207ENST00000586825 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.48■■■■■ 5.19
TXNL4A-207ENST00000586825 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.44■■■■■ 5.18
TXNL4A-207ENST00000586825 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.44■■■■■ 5.18
TXNL4A-207ENST00000586825 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.43■■■■■ 5.18
TXNL4A-207ENST00000586825 SYNJ2O15056 1496 aa47.41■■■■■ 5.18
TXNL4A-207ENST00000586825 PBRM1Q86U86 1689 aa47.4■■■■■ 5.18
TXNL4A-207ENST00000586825 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.36■■■■■ 5.17
TXNL4A-207ENST00000586825 SYNJ1O43426 1573 aa47.36■■■■■ 5.17
TXNL4A-207ENST00000586825 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.24■■■■■ 5.15
TXNL4A-207ENST00000586825 TOP2BQ02880 1626 aa47.22■■■■■ 5.15
TXNL4A-207ENST00000586825 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.22■■■■■ 5.15
TXNL4A-207ENST00000586825 ADAMTS12P58397 1594 aa46.98■■■■■ 5.11
TXNL4A-207ENST00000586825 GRIN2AQ12879 1464 aa46.98■■■■■ 5.11
TXNL4A-207ENST00000586825 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.93■■■■■ 5.1
TXNL4A-207ENST00000586825 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.84■■■■■ 5.09
TXNL4A-207ENST00000586825 NUP160Q12769 1436 aa46.84■■■■■ 5.09
TXNL4A-207ENST00000586825 CEP170Q5SW79 1584 aa46.84■■■■■ 5.09
TXNL4A-207ENST00000586825 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.82■■■■■ 5.09
TXNL4A-207ENST00000586825 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.76■■■■■ 5.08
TXNL4A-207ENST00000586825 SHROOM2Q13796 1616 aa46.61■■■■■ 5.05
TXNL4A-207ENST00000586825 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.36■■■■■ 5.01
TXNL4A-207ENST00000586825 JPH4Q96JJ6 628 aa46.35■■■■■ 5.01
TXNL4A-207ENST00000586825 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.32■■■■■ 5.01
TXNL4A-207ENST00000586825 IGF1RP08069 1367 aa46.31■■■■■ 5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms