RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586270.5

H3F3B-202, Transcript of H3 histone family member 3B, humanhuman

TSL 2

Gene H3F3B, Length 468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3B-202ENST00000586270 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.26■■■■■ 7.24
H3F3B-202ENST00000586270 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.82■■■■■ 6.21
H3F3B-202ENST00000586270 ABCC9O60706 1549 aa52.92■■■■■ 6.06
H3F3B-202ENST00000586270 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.83■■■■■ 5.73
H3F3B-202ENST00000586270 NACADO15069 1562 aa50.66■■■■■ 5.7
H3F3B-202ENST00000586270 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.58■■■■■ 5.69
H3F3B-202ENST00000586270 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.19■■■■■ 5.62
H3F3B-202ENST00000586270 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.13■■■■■ 5.62
H3F3B-202ENST00000586270 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.85■■■■■ 5.57
H3F3B-202ENST00000586270 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.66■■■■■ 5.54
H3F3B-202ENST00000586270 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.36■■■■■ 5.49
H3F3B-202ENST00000586270 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.17■■■■■ 5.46
H3F3B-202ENST00000586270 SCRIBQ14160 1630 aa49.06■■■■■ 5.44
H3F3B-202ENST00000586270 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.74■■■■■ 5.39
H3F3B-202ENST00000586270 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.73■■■■■ 5.39
H3F3B-202ENST00000586270 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
H3F3B-202ENST00000586270 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.88■■■■■ 5.25
H3F3B-202ENST00000586270 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.61■■■■■ 5.21
H3F3B-202ENST00000586270 SMARCA4P51532 1647 aa46.87■■■■■ 5.09
H3F3B-202ENST00000586270 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
H3F3B-202ENST00000586270 SMARCA2P51531 1590 aa46.68■■■■■ 5.06
H3F3B-202ENST00000586270 NCAPD3P42695 1498 aa46.67■■■■■ 5.06
H3F3B-202ENST00000586270 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.65■■■■■ 5.06
H3F3B-202ENST00000586270 HMGXB3Q12766 1538 aa46.47■■■■■ 5.03
H3F3B-202ENST00000586270 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.41■■■■■ 5.02
H3F3B-202ENST00000586270 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.38■■■■■ 5.01
H3F3B-202ENST00000586270 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
H3F3B-202ENST00000586270 WIZO95785 1651 aa45.95■■■■■ 4.95
H3F3B-202ENST00000586270 ERCC6Q03468 1493 aa45.74■■■■■ 4.91
H3F3B-202ENST00000586270 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
H3F3B-202ENST00000586270 NESP48681 1621 aa45.66■■■■■ 4.9
H3F3B-202ENST00000586270 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.58■■■■■ 4.89
H3F3B-202ENST00000586270 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
H3F3B-202ENST00000586270 CUX2O14529 1486 aa45.33■■■■■ 4.85
H3F3B-202ENST00000586270 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.32■■■■■ 4.84
H3F3B-202ENST00000586270 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.29■■■■■ 4.84
H3F3B-202ENST00000586270 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.21■■■■■ 4.83
H3F3B-202ENST00000586270 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.08■■■■■ 4.81
H3F3B-202ENST00000586270 CFTRP13569 1480 aa44.96■■■■■ 4.79
H3F3B-202ENST00000586270 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.86■■■■■ 4.77
H3F3B-202ENST00000586270 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.85■■■■■ 4.77
H3F3B-202ENST00000586270 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.83■■■■■ 4.77
H3F3B-202ENST00000586270 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.83■■■■■ 4.77
H3F3B-202ENST00000586270 PRDM2Q13029 1718 aa44.76■■■■■ 4.76
H3F3B-202ENST00000586270 WDR62O43379 1518 aa44.67■■■■■ 4.74
H3F3B-202ENST00000586270 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
H3F3B-202ENST00000586270 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
H3F3B-202ENST00000586270 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.25■■■■■ 4.67
H3F3B-202ENST00000586270 ABCC8Q09428 1581 aa44.1■■■■■ 4.65
H3F3B-202ENST00000586270 TOPBP1Q92547 1522 aa44.06■■■■■ 4.64
H3F3B-202ENST00000586270 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.01■■■■■ 4.64
H3F3B-202ENST00000586270 IFT140Q96RY7 1462 aa43.9■■■■■ 4.62
H3F3B-202ENST00000586270 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
H3F3B-202ENST00000586270 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
H3F3B-202ENST00000586270 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
H3F3B-202ENST00000586270 CUX1P39880 1505 aa43.58■■■■■ 4.57
H3F3B-202ENST00000586270 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
H3F3B-202ENST00000586270 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.52■■■■■ 4.56
H3F3B-202ENST00000586270 SOGA1O94964 1423 aa43.49■■■■■ 4.55
H3F3B-202ENST00000586270 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.45■■■■■ 4.55
H3F3B-202ENST00000586270 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.38■■■■■ 4.542e-9■■■■□ 20.2
H3F3B-202ENST00000586270 OSCARQ8IYS5 282 aa43.38■■■■■ 4.53
H3F3B-202ENST00000586270 WDR97A6NE52 1622 aa43.32■■■■■ 4.53
H3F3B-202ENST00000586270 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
H3F3B-202ENST00000586270 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.22■■■■■ 4.515e-8■■□□□ 14.3
H3F3B-202ENST00000586270 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.17■■■■■ 4.5
H3F3B-202ENST00000586270 TOP2BQ02880 1626 aa43.16■■■■■ 4.5
H3F3B-202ENST00000586270 CHD1O14646 1710 aa43.11■■■■■ 4.49
H3F3B-202ENST00000586270 SYNJ1O43426 1573 aa43.1■■■■■ 4.49
H3F3B-202ENST00000586270 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.07■■■■■ 4.48
H3F3B-202ENST00000586270 GRIN2BQ13224 1484 aa43.05■■■■■ 4.48
H3F3B-202ENST00000586270 FBLN2P98095 1184 aa43.04■■■■■ 4.48
H3F3B-202ENST00000586270 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.02■■■■■ 4.48
H3F3B-202ENST00000586270 PBRM1Q86U86 1689 aa43■■■■■ 4.47
H3F3B-202ENST00000586270 GAPVD1Q14C86 1478 aa43■■■■■ 4.47
H3F3B-202ENST00000586270 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
H3F3B-202ENST00000586270 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.95■■■■■ 4.47
H3F3B-202ENST00000586270 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
H3F3B-202ENST00000586270 SYNJ2O15056 1496 aa42.81■■■■■ 4.44
H3F3B-202ENST00000586270 TRIM41Q8WV44 630 aa42.75■■■■■ 4.43
H3F3B-202ENST00000586270 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.73■■■■■ 4.43
H3F3B-202ENST00000586270 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.73■■■■■ 4.43
H3F3B-202ENST00000586270 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.73■■■■■ 4.43
H3F3B-202ENST00000586270 ARHGEF11O15085 1522 aa42.66■■■■■ 4.42
H3F3B-202ENST00000586270 ADAMTS12P58397 1594 aa42.58■■■■■ 4.41
H3F3B-202ENST00000586270 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.58■■■■■ 4.41
H3F3B-202ENST00000586270 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.55■■■■■ 4.4
H3F3B-202ENST00000586270 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.48■■■■■ 4.39
H3F3B-202ENST00000586270 GRIN2AQ12879 1464 aa42.48■■■■■ 4.39
H3F3B-202ENST00000586270 KIF27Q86VH2 1401 aa42.37■■■■■ 4.37
H3F3B-202ENST00000586270 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.3■■■■■ 4.36
H3F3B-202ENST00000586270 CEP170Q5SW79 1584 aa42.27■■■■■ 4.36
H3F3B-202ENST00000586270 ARAP1Q96P48 1450 aa42.26■■■■■ 4.36
H3F3B-202ENST00000586270 NUP160Q12769 1436 aa42.26■■■■■ 4.36
H3F3B-202ENST00000586270 CUL7Q14999 1698 aa42.19■■■■■ 4.34
H3F3B-202ENST00000586270 IGF1RP08069 1367 aa42.13■■■■■ 4.33
H3F3B-202ENST00000586270 SHROOM2Q13796 1616 aa42.02■■■■■ 4.32
H3F3B-202ENST00000586270 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.95■■■■■ 4.31
H3F3B-202ENST00000586270 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.94■■■■■ 4.3
H3F3B-202ENST00000586270 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.89■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 301.2 ms