RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586244.1

GALK1-202, Transcript of galactokinase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GALK1, Length 1,180 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK1-202ENST00000586244 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.05■■■■■ 5.28
GALK1-202ENST00000586244 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.97■■■■■ 4.47
GALK1-202ENST00000586244 ABCC9O60706 1549 aa42.83■■■■■ 4.45
GALK1-202ENST00000586244 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.86■■■■■ 4.13
GALK1-202ENST00000586244 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.65■■■■■ 4.1
GALK1-202ENST00000586244 NACADO15069 1562 aa40.63■■■■■ 4.09
GALK1-202ENST00000586244 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.11■■■■■ 4.01
GALK1-202ENST00000586244 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
GALK1-202ENST00000586244 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.95■■■■□ 3.99
GALK1-202ENST00000586244 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
GALK1-202ENST00000586244 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.83■■■■□ 3.97
GALK1-202ENST00000586244 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.69■■■■□ 3.94
GALK1-202ENST00000586244 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.58■■■■□ 3.93
GALK1-202ENST00000586244 SCRIBQ14160 1630 aa39.22■■■■□ 3.87
GALK1-202ENST00000586244 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.12■■■■□ 3.85
GALK1-202ENST00000586244 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.67■■■■□ 3.78
GALK1-202ENST00000586244 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
GALK1-202ENST00000586244 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.56■■■■□ 3.76
GALK1-202ENST00000586244 NCAPD3P42695 1498 aa37.51■■■■□ 3.59
GALK1-202ENST00000586244 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.42■■■■□ 3.58
GALK1-202ENST00000586244 SMARCA4P51532 1647 aa37.42■■■■□ 3.58
GALK1-202ENST00000586244 SMARCA2P51531 1590 aa37.35■■■■□ 3.57
GALK1-202ENST00000586244 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
GALK1-202ENST00000586244 HMGXB3Q12766 1538 aa37.22■■■■□ 3.55
GALK1-202ENST00000586244 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
GALK1-202ENST00000586244 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.03■■■■□ 3.52
GALK1-202ENST00000586244 ERCC6Q03468 1493 aa37.02■■■■□ 3.52
GALK1-202ENST00000586244 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.02■■■■□ 3.52
GALK1-202ENST00000586244 NESP48681 1621 aa36.83■■■■□ 3.49
GALK1-202ENST00000586244 CUX2O14529 1486 aa36.82■■■■□ 3.48
GALK1-202ENST00000586244 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.62■■■■□ 3.45
GALK1-202ENST00000586244 WIZO95785 1651 aa36.58■■■■□ 3.45
GALK1-202ENST00000586244 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.57■■■■□ 3.44
GALK1-202ENST00000586244 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.47■■■■□ 3.43
GALK1-202ENST00000586244 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.41■■■■□ 3.42
GALK1-202ENST00000586244 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
GALK1-202ENST00000586244 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
GALK1-202ENST00000586244 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.32■■■■□ 3.41
GALK1-202ENST00000586244 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
GALK1-202ENST00000586244 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.09■■■■□ 3.37
GALK1-202ENST00000586244 CFTRP13569 1480 aa36.01■■■■□ 3.36
GALK1-202ENST00000586244 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.01■■■■□ 3.36
GALK1-202ENST00000586244 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.99■■■■□ 3.35
GALK1-202ENST00000586244 WDR62O43379 1518 aa35.95■■■■□ 3.35
GALK1-202ENST00000586244 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.77■■■■□ 3.32
GALK1-202ENST00000586244 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
GALK1-202ENST00000586244 PRDM2Q13029 1718 aa35.6■■■■□ 3.29
GALK1-202ENST00000586244 TOPBP1Q92547 1522 aa35.31■■■■□ 3.24
GALK1-202ENST00000586244 ABCC8Q09428 1581 aa35.3■■■■□ 3.24
GALK1-202ENST00000586244 IFT140Q96RY7 1462 aa35.29■■■■□ 3.24
GALK1-202ENST00000586244 OSCARQ8IYS5 282 aa35.26■■■■□ 3.24
GALK1-202ENST00000586244 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.19■■■■□ 3.22
GALK1-202ENST00000586244 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
GALK1-202ENST00000586244 TRIM41Q8WV44 630 aa35.13■■■■□ 3.21
GALK1-202ENST00000586244 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
GALK1-202ENST00000586244 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
GALK1-202ENST00000586244 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
GALK1-202ENST00000586244 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
GALK1-202ENST00000586244 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.92■■■■□ 3.181e-8■■■■■ 37.4
GALK1-202ENST00000586244 SOGA1O94964 1423 aa34.87■■■■□ 3.17
GALK1-202ENST00000586244 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.84■■■■□ 3.17
GALK1-202ENST00000586244 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.78■■■■□ 3.16
GALK1-202ENST00000586244 CUX1P39880 1505 aa34.76■■■■□ 3.16
GALK1-202ENST00000586244 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
GALK1-202ENST00000586244 FBLN2P98095 1184 aa34.76■■■■□ 3.16
GALK1-202ENST00000586244 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.66■■■■□ 3.14
GALK1-202ENST00000586244 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.66■■■■□ 3.14
GALK1-202ENST00000586244 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.66■■■■□ 3.14
GALK1-202ENST00000586244 CHD1O14646 1710 aa34.65■■■■□ 3.14
GALK1-202ENST00000586244 WDR97A6NE52 1622 aa34.63■■■■□ 3.13
GALK1-202ENST00000586244 ARHGEF11O15085 1522 aa34.59■■■■□ 3.13
GALK1-202ENST00000586244 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.55■■■■□ 3.12
GALK1-202ENST00000586244 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
GALK1-202ENST00000586244 GRIN2BQ13224 1484 aa34.52■■■■□ 3.12
GALK1-202ENST00000586244 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
GALK1-202ENST00000586244 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.43■■■■□ 3.1
GALK1-202ENST00000586244 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.43■■■■□ 3.1
GALK1-202ENST00000586244 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.4■■■■□ 3.1
GALK1-202ENST00000586244 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.37■■■■□ 3.09
GALK1-202ENST00000586244 SYNJ2O15056 1496 aa34.36■■■■□ 3.09
GALK1-202ENST00000586244 SYNJ1O43426 1573 aa34.32■■■■□ 3.09
GALK1-202ENST00000586244 PBRM1Q86U86 1689 aa34.32■■■■□ 3.08
GALK1-202ENST00000586244 TOP2BQ02880 1626 aa34.28■■■■□ 3.08
GALK1-202ENST00000586244 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.28■■■■□ 3.08
GALK1-202ENST00000586244 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.26■■■■□ 3.07
GALK1-202ENST00000586244 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.25■■■■□ 3.07
GALK1-202ENST00000586244 ARAP1Q96P48 1450 aa34.25■■■■□ 3.07
GALK1-202ENST00000586244 GRIN2AQ12879 1464 aa34.05■■■■□ 3.04
GALK1-202ENST00000586244 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
GALK1-202ENST00000586244 ADAMTS12P58397 1594 aa34.02■■■■□ 3.04
GALK1-202ENST00000586244 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34■■■■□ 3.03
GALK1-202ENST00000586244 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.98■■■■□ 3.03
GALK1-202ENST00000586244 NUP160Q12769 1436 aa33.9■■■■□ 3.02
GALK1-202ENST00000586244 CEP170Q5SW79 1584 aa33.88■■■■□ 3.01
GALK1-202ENST00000586244 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.74■■■□□ 2.99
GALK1-202ENST00000586244 KIF27Q86VH2 1401 aa33.7■■■□□ 2.98
GALK1-202ENST00000586244 SHROOM2Q13796 1616 aa33.69■■■□□ 2.98
GALK1-202ENST00000586244 JPH4Q96JJ6 628 aa33.66■■■□□ 2.98
GALK1-202ENST00000586244 IGF1RP08069 1367 aa33.63■■■□□ 2.97
GALK1-202ENST00000586244 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
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