RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585362.6

GPX4-202, Transcript of glutathione peroxidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene GPX4, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPX4-202ENST00000585362 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.67■■■■■ 7.94
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GPX4-202ENST00000585362 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.44■■■■■ 6.31
GPX4-202ENST00000585362 NACADO15069 1562 aa54.28■■■■■ 6.28
GPX4-202ENST00000585362 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.19■■■■■ 6.27
GPX4-202ENST00000585362 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.8■■■■■ 6.2
GPX4-202ENST00000585362 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.8■■■■■ 6.2
GPX4-202ENST00000585362 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.43■■■■■ 6.14
GPX4-202ENST00000585362 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.28■■■■■ 6.12
GPX4-202ENST00000585362 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.09■■■■■ 6.09
GPX4-202ENST00000585362 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.9■■■■■ 6.06
GPX4-202ENST00000585362 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.64■■■■■ 6.02
GPX4-202ENST00000585362 SCRIBQ14160 1630 aa52.63■■■■■ 6.02
GPX4-202ENST00000585362 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.17■■■■■ 5.94
GPX4-202ENST00000585362 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.5■■■■■ 5.84
GPX4-202ENST00000585362 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.4■■■■■ 5.82
GPX4-202ENST00000585362 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.11■■■■■ 5.77
GPX4-202ENST00000585362 SMARCA4P51532 1647 aa50.27■■■■■ 5.64
GPX4-202ENST00000585362 NCAPD3P42695 1498 aa50.11■■■■■ 5.61
GPX4-202ENST00000585362 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.11■■■■■ 5.61
GPX4-202ENST00000585362 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.11■■■■■ 5.61
GPX4-202ENST00000585362 SMARCA2P51531 1590 aa49.97■■■■■ 5.59
GPX4-202ENST00000585362 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.87■■■■■ 5.57
GPX4-202ENST00000585362 HMGXB3Q12766 1538 aa49.82■■■■■ 5.57
GPX4-202ENST00000585362 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.76■■■■■ 5.56
GPX4-202ENST00000585362 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.65■■■■■ 5.54
GPX4-202ENST00000585362 WIZO95785 1651 aa49.32■■■■■ 5.49
GPX4-202ENST00000585362 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.14■■■■■ 5.46
GPX4-202ENST00000585362 NESP48681 1621 aa49.12■■■■■ 5.45
GPX4-202ENST00000585362 ERCC6Q03468 1493 aa48.99■■■■■ 5.43
GPX4-202ENST00000585362 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.84■■■■■ 5.41
GPX4-202ENST00000585362 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.73■■■■■ 5.39
GPX4-202ENST00000585362 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.64■■■■■ 5.38
GPX4-202ENST00000585362 CUX2O14529 1486 aa48.6■■■■■ 5.37
GPX4-202ENST00000585362 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.5■■■■■ 5.36
GPX4-202ENST00000585362 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.49■■■■■ 5.35
GPX4-202ENST00000585362 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.43■■■■■ 5.34
GPX4-202ENST00000585362 CFTRP13569 1480 aa48.27■■■■■ 5.32
GPX4-202ENST00000585362 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.18■■■■■ 5.3
GPX4-202ENST00000585362 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.1■■■■■ 5.29
GPX4-202ENST00000585362 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.08■■■■■ 5.29
GPX4-202ENST00000585362 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.05■■■■■ 5.28
GPX4-202ENST00000585362 WDR62O43379 1518 aa47.94■■■■■ 5.26
GPX4-202ENST00000585362 PRDM2Q13029 1718 aa47.84■■■■■ 5.25
GPX4-202ENST00000585362 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.68■■■■■ 5.22
GPX4-202ENST00000585362 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.62■■■■■ 5.21
GPX4-202ENST00000585362 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.58■■■■■ 5.21
GPX4-202ENST00000585362 TOPBP1Q92547 1522 aa47.3■■■■■ 5.16
GPX4-202ENST00000585362 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.18■■■■■ 5.14
GPX4-202ENST00000585362 ABCC8Q09428 1581 aa47.16■■■■■ 5.14
GPX4-202ENST00000585362 IFT140Q96RY7 1462 aa47.05■■■■■ 5.12
GPX4-202ENST00000585362 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.96■■■■■ 5.11
GPX4-202ENST00000585362 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.87■■■■■ 5.09
GPX4-202ENST00000585362 CUX1P39880 1505 aa46.81■■■■■ 5.08
GPX4-202ENST00000585362 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.81■■■■■ 5.08
GPX4-202ENST00000585362 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
GPX4-202ENST00000585362 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.7■■■■■ 5.07
GPX4-202ENST00000585362 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.7■■■■■ 5.07
GPX4-202ENST00000585362 SOGA1O94964 1423 aa46.64■■■■■ 5.06
GPX4-202ENST00000585362 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.63■■■■■ 5.051e-7■■■■□ 20.4
GPX4-202ENST00000585362 OSCARQ8IYS5 282 aa46.51■■■■■ 5.04
GPX4-202ENST00000585362 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.47■■■■■ 5.03
GPX4-202ENST00000585362 WDR97A6NE52 1622 aa46.33■■■■■ 5.01
GPX4-202ENST00000585362 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.31■■■■■ 5
GPX4-202ENST00000585362 SYNJ1O43426 1573 aa46.27■■■■■ 5
GPX4-202ENST00000585362 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.25■■■■■ 4.99
GPX4-202ENST00000585362 TOP2BQ02880 1626 aa46.25■■■■■ 4.99
GPX4-202ENST00000585362 CHD1O14646 1710 aa46.21■■■■■ 4.99
GPX4-202ENST00000585362 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.2■■■■■ 4.99
GPX4-202ENST00000585362 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.18■■■■■ 4.98
GPX4-202ENST00000585362 GRIN2BQ13224 1484 aa46.13■■■■■ 4.98
GPX4-202ENST00000585362 FBLN2P98095 1184 aa46.1■■■■■ 4.97
GPX4-202ENST00000585362 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.1■■■■■ 4.97
GPX4-202ENST00000585362 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.07■■■■■ 4.97
GPX4-202ENST00000585362 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.05■■■■■ 4.96
GPX4-202ENST00000585362 PBRM1Q86U86 1689 aa46.03■■■■■ 4.96
GPX4-202ENST00000585362 TRIM41Q8WV44 630 aa45.92■■■■■ 4.94
GPX4-202ENST00000585362 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
GPX4-202ENST00000585362 SYNJ2O15056 1496 aa45.88■■■■■ 4.94
GPX4-202ENST00000585362 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.88■■■■■ 4.93
GPX4-202ENST00000585362 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.88■■■■■ 4.93
GPX4-202ENST00000585362 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.88■■■■■ 4.93
GPX4-202ENST00000585362 ARHGEF11O15085 1522 aa45.82■■■■■ 4.92
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GPX4-202ENST00000585362 ADAMTS12P58397 1594 aa45.67■■■■■ 4.9
GPX4-202ENST00000585362 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.62■■■■■ 4.89
GPX4-202ENST00000585362 GRIN2AQ12879 1464 aa45.56■■■■■ 4.88
GPX4-202ENST00000585362 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.53■■■■■ 4.88
GPX4-202ENST00000585362 ARAP1Q96P48 1450 aa45.46■■■■■ 4.87
GPX4-202ENST00000585362 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.4■■■■■ 4.86
GPX4-202ENST00000585362 NUP160Q12769 1436 aa45.39■■■■■ 4.86
GPX4-202ENST00000585362 CEP170Q5SW79 1584 aa45.39■■■■■ 4.86
GPX4-202ENST00000585362 KIF27Q86VH2 1401 aa45.35■■■■■ 4.85
GPX4-202ENST00000585362 IGF1RP08069 1367 aa45.26■■■■■ 4.84
GPX4-202ENST00000585362 CUL7Q14999 1698 aa45.11■■■■■ 4.81
GPX4-202ENST00000585362 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.11■■■■■ 4.81
GPX4-202ENST00000585362 SHROOM2Q13796 1616 aa45.08■■■■■ 4.81
GPX4-202ENST00000585362 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.01■■■■■ 4.8
GPX4-202ENST00000585362 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.96■■■■■ 4.79
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