RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585299.1

NFE2L1-223, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 4

Gene NFE2L1, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-223	ENST00000585299	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.22	■■■■■ 4.19
NFE2L1-223	ENST00000585299	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		36.74	■■■■□ 3.47
NFE2L1-223	ENST00000585299	ABCC9	O60706	1549 aa		36.14	■■■■□ 3.38
NFE2L1-223	ENST00000585299	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.68	■■■■□ 3.14
NFE2L1-223	ENST00000585299	NACAD	O15069	1562 aa		34.6	■■■■□ 3.13
NFE2L1-223	ENST00000585299	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		34.52	■■■■□ 3.12
NFE2L1-223	ENST00000585299	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		34.32	■■■■□ 3.08
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.27	■■■■□ 3.08
NFE2L1-223	ENST00000585299	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.09	■■■■□ 3.05
NFE2L1-223	ENST00000585299	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.93	■■■■□ 3.02
NFE2L1-223	ENST00000585299	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.75	■■■□□ 2.99
NFE2L1-223	ENST00000585299	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		33.65	■■■□□ 2.98
NFE2L1-223	ENST00000585299	SCRIB	Q14160	1630 aa		33.48	■■■□□ 2.95
NFE2L1-223	ENST00000585299	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.4	■■■□□ 2.94
NFE2L1-223	ENST00000585299	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.26	■■■□□ 2.92
NFE2L1-223	ENST00000585299	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.84
NFE2L1-223	ENST00000585299	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.69	■■■□□ 2.82
NFE2L1-223	ENST00000585299	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.51	■■■□□ 2.79
NFE2L1-223	ENST00000585299	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.02	■■■□□ 2.72
NFE2L1-223	ENST00000585299	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
NFE2L1-223	ENST00000585299	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.93	■■■□□ 2.7
NFE2L1-223	ENST00000585299	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.91	■■■□□ 2.7
NFE2L1-223	ENST00000585299	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.86	■■■□□ 2.69
NFE2L1-223	ENST00000585299	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31.76	■■■□□ 2.67
NFE2L1-223	ENST00000585299	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.74	■■■□□ 2.67
NFE2L1-223	ENST00000585299	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.72	■■■□□ 2.67
NFE2L1-223	ENST00000585299	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
NFE2L1-223	ENST00000585299	WIZ	O95785	1651 aa		31.41	■■■□□ 2.62
NFE2L1-223	ENST00000585299	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	NES	P48681	1621 aa		31.22	■■■□□ 2.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.16	■■■□□ 2.58
NFE2L1-223	ENST00000585299	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		31.11	■■■□□ 2.57
NFE2L1-223	ENST00000585299	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
NFE2L1-223	ENST00000585299	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.98	■■■□□ 2.55
NFE2L1-223	ENST00000585299	CUX2	O14529	1486 aa		30.93	■■■□□ 2.54
NFE2L1-223	ENST00000585299	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.91	■■■□□ 2.54
NFE2L1-223	ENST00000585299	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.85	■■■□□ 2.53
NFE2L1-223	ENST00000585299	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.79	■■■□□ 2.52
NFE2L1-223	ENST00000585299	CFTR	P13569	1480 aa		30.76	■■■□□ 2.51
NFE2L1-223	ENST00000585299	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.7	■■■□□ 2.5
NFE2L1-223	ENST00000585299	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		30.62	■■■□□ 2.49
NFE2L1-223	ENST00000585299	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30.6	■■■□□ 2.49
NFE2L1-223	ENST00000585299	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		30.59	■■■□□ 2.49
NFE2L1-223	ENST00000585299	PRDM2	Q13029	1718 aa		30.53	■■■□□ 2.48
NFE2L1-223	ENST00000585299	WDR62	O43379	1518 aa		30.51	■■■□□ 2.47
NFE2L1-223	ENST00000585299	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	30.36	■■■□□ 2.45
NFE2L1-223	ENST00000585299	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	30.33	■■■□□ 2.45
NFE2L1-223	ENST00000585299	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.26	■■■□□ 2.43
NFE2L1-223	ENST00000585299	TOPBP1	Q92547	1522 aa		30.12	■■■□□ 2.41
NFE2L1-223	ENST00000585299	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.11	■■■□□ 2.41
NFE2L1-223	ENST00000585299	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.06	■■■□□ 2.4
NFE2L1-223	ENST00000585299	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.97	■■■□□ 2.39
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.86	■■■□□ 2.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.84	■■■□□ 2.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	CUX1	P39880	1505 aa		29.81	■■■□□ 2.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.73	■■■□□ 2.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	SOGA1	O94964	1423 aa		29.72	■■■□□ 2.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.71	■■■□□ 2.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.67	■■■□□ 2.34
NFE2L1-223	ENST00000585299	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.63	■■■□□ 2.33
NFE2L1-223	ENST00000585299	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.58	■■■□□ 2.33
NFE2L1-223	ENST00000585299	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.55	■■■□□ 2.32
NFE2L1-223	ENST00000585299	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.53	■■■□□ 2.32
NFE2L1-223	ENST00000585299	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.49	■■■□□ 2.31
NFE2L1-223	ENST00000585299	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.49	■■■□□ 2.31
NFE2L1-223	ENST00000585299	SYNJ1	O43426	1573 aa		29.46	■■■□□ 2.31
NFE2L1-223	ENST00000585299	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29.44	■■■□□ 2.3
NFE2L1-223	ENST00000585299	CHD1	O14646	1710 aa		29.41	■■■□□ 2.3
NFE2L1-223	ENST00000585299	GRIN2B	Q13224	1484 aa		29.4	■■■□□ 2.3
NFE2L1-223	ENST00000585299	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.37	■■■□□ 2.29
NFE2L1-223	ENST00000585299	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		29.36	■■■□□ 2.29
NFE2L1-223	ENST00000585299	FBLN2	P98095	1184 aa		29.35	■■■□□ 2.29
NFE2L1-223	ENST00000585299	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	29.34	■■■□□ 2.29
NFE2L1-223	ENST00000585299	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.34	■■■□□ 2.29
NFE2L1-223	ENST00000585299	PBRM1	Q86U86	1689 aa		29.32	■■■□□ 2.28
NFE2L1-223	ENST00000585299	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
NFE2L1-223	ENST00000585299	SYNJ2	O15056	1496 aa		29.23	■■■□□ 2.27
NFE2L1-223	ENST00000585299	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.16	■■■□□ 2.26
NFE2L1-223	ENST00000585299	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.16	■■■□□ 2.26
NFE2L1-223	ENST00000585299	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.16	■■■□□ 2.26
NFE2L1-223	ENST00000585299	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.14	■■■□□ 2.26
NFE2L1-223	ENST00000585299	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NFE2L1-223	ENST00000585299	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.09	■■■□□ 2.25
NFE2L1-223	ENST00000585299	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		29.07	■■■□□ 2.24
NFE2L1-223	ENST00000585299	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.06	■■■□□ 2.24
NFE2L1-223	ENST00000585299	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.02	■■■□□ 2.24
NFE2L1-223	ENST00000585299	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.01	■■■□□ 2.23
NFE2L1-223	ENST00000585299	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.93	■■■□□ 2.22
NFE2L1-223	ENST00000585299	NUP160	Q12769	1436 aa		28.9	■■■□□ 2.22
NFE2L1-223	ENST00000585299	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.89	■■■□□ 2.22
NFE2L1-223	ENST00000585299	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.88	■■■□□ 2.21
NFE2L1-223	ENST00000585299	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.88	■■■□□ 2.21
NFE2L1-223	ENST00000585299	IGF1R	P08069	1367 aa		28.86	■■■□□ 2.21
NFE2L1-223	ENST00000585299	CUL7	Q14999	1698 aa		28.77	■■■□□ 2.2
NFE2L1-223	ENST00000585299	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.71	■■■□□ 2.19
NFE2L1-223	ENST00000585299	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.67	■■■□□ 2.18
NFE2L1-223	ENST00000585299	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.66	■■■□□ 2.18
NFE2L1-223	ENST00000585299	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.64	■■■□□ 2.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.8 ms