RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584876.1

TRAPPC8-213, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-213ENST00000584876 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.83■■■■■ 6.85
TRAPPC8-213ENST00000584876 ABCC9O60706 1549 aa52.01■■■■■ 5.92
TRAPPC8-213ENST00000584876 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52■■■■■ 5.92
TRAPPC8-213ENST00000584876 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.51■■■■■ 5.52
TRAPPC8-213ENST00000584876 NACADO15069 1562 aa49.13■■■■■ 5.46
TRAPPC8-213ENST00000584876 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.8■■■■■ 5.4
TRAPPC8-213ENST00000584876 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.78■■■■■ 5.4
TRAPPC8-213ENST00000584876 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.46■■■■■ 5.35
TRAPPC8-213ENST00000584876 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.41■■■■■ 5.34
TRAPPC8-213ENST00000584876 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.36■■■■■ 5.33
TRAPPC8-213ENST00000584876 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.05■■■■■ 5.28
TRAPPC8-213ENST00000584876 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.93■■■■■ 5.26
TRAPPC8-213ENST00000584876 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.77■■■■■ 5.24
TRAPPC8-213ENST00000584876 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.4■■■■■ 5.18
TRAPPC8-213ENST00000584876 SCRIBQ14160 1630 aa47.37■■■■■ 5.17
TRAPPC8-213ENST00000584876 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.01■■■■■ 5.12
TRAPPC8-213ENST00000584876 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
TRAPPC8-213ENST00000584876 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.86■■■■■ 5.09
TRAPPC8-213ENST00000584876 NCAPD3P42695 1498 aa45.31■■■■■ 4.84
TRAPPC8-213ENST00000584876 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.19■■■■■ 4.82
TRAPPC8-213ENST00000584876 SMARCA4P51532 1647 aa45.17■■■■■ 4.82
TRAPPC8-213ENST00000584876 SMARCA2P51531 1590 aa45.09■■■■■ 4.81
TRAPPC8-213ENST00000584876 HMGXB3Q12766 1538 aa45.03■■■■■ 4.8
TRAPPC8-213ENST00000584876 ERCC6Q03468 1493 aa44.93■■■■■ 4.78
TRAPPC8-213ENST00000584876 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
TRAPPC8-213ENST00000584876 CUX2O14529 1486 aa44.87■■■■■ 4.77
TRAPPC8-213ENST00000584876 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.86■■■■■ 4.77
TRAPPC8-213ENST00000584876 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
TRAPPC8-213ENST00000584876 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.71■■■■■ 4.75
TRAPPC8-213ENST00000584876 NESP48681 1621 aa44.66■■■■■ 4.74
TRAPPC8-213ENST00000584876 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.56■■■■■ 4.72
TRAPPC8-213ENST00000584876 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.36■■■■■ 4.69
TRAPPC8-213ENST00000584876 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
TRAPPC8-213ENST00000584876 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.16■■■■■ 4.66
TRAPPC8-213ENST00000584876 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.07■■■■■ 4.65
TRAPPC8-213ENST00000584876 WIZO95785 1651 aa44.07■■■■■ 4.64
TRAPPC8-213ENST00000584876 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.93■■■■■ 4.62
TRAPPC8-213ENST00000584876 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.72■■■■■ 4.59
TRAPPC8-213ENST00000584876 WDR62O43379 1518 aa43.63■■■■■ 4.57
TRAPPC8-213ENST00000584876 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
TRAPPC8-213ENST00000584876 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.54■■■■■ 4.56
TRAPPC8-213ENST00000584876 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
TRAPPC8-213ENST00000584876 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.47■■■■■ 4.55
TRAPPC8-213ENST00000584876 CFTRP13569 1480 aa43.43■■■■■ 4.54
TRAPPC8-213ENST00000584876 PRDM2Q13029 1718 aa43.14■■■■■ 4.5
TRAPPC8-213ENST00000584876 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
TRAPPC8-213ENST00000584876 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.96■■■■■ 4.47
TRAPPC8-213ENST00000584876 TRIM41Q8WV44 630 aa42.9■■■■■ 4.46
TRAPPC8-213ENST00000584876 OSCARQ8IYS5 282 aa42.74■■■■■ 4.43
TRAPPC8-213ENST00000584876 IFT140Q96RY7 1462 aa42.66■■■■■ 4.42
TRAPPC8-213ENST00000584876 TOPBP1Q92547 1522 aa42.65■■■■■ 4.42
TRAPPC8-213ENST00000584876 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
TRAPPC8-213ENST00000584876 ABCC8Q09428 1581 aa42.53■■■■■ 4.4
TRAPPC8-213ENST00000584876 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.51■■■■■ 4.4
TRAPPC8-213ENST00000584876 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
TRAPPC8-213ENST00000584876 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.3■■■■■ 4.36
TRAPPC8-213ENST00000584876 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.3■■■■■ 4.36
TRAPPC8-213ENST00000584876 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.3■■■■■ 4.36
TRAPPC8-213ENST00000584876 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
TRAPPC8-213ENST00000584876 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
TRAPPC8-213ENST00000584876 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.17■■■■■ 4.34
TRAPPC8-213ENST00000584876 CHD1O14646 1710 aa42.15■■■■■ 4.34
TRAPPC8-213ENST00000584876 ARHGEF11O15085 1522 aa42.13■■■■■ 4.33
TRAPPC8-213ENST00000584876 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.04■■■■■ 4.32
TRAPPC8-213ENST00000584876 SOGA1O94964 1423 aa41.97■■■■■ 4.31
TRAPPC8-213ENST00000584876 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.93■■■■■ 4.3
TRAPPC8-213ENST00000584876 FBLN2P98095 1184 aa41.91■■■■■ 4.3
TRAPPC8-213ENST00000584876 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
TRAPPC8-213ENST00000584876 CUX1P39880 1505 aa41.89■■■■■ 4.3
TRAPPC8-213ENST00000584876 WDR97A6NE52 1622 aa41.87■■■■■ 4.29
TRAPPC8-213ENST00000584876 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.79■■■■■ 4.28
TRAPPC8-213ENST00000584876 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.76■■■■■ 4.28
TRAPPC8-213ENST00000584876 ARAP1Q96P48 1450 aa41.71■■■■■ 4.27
TRAPPC8-213ENST00000584876 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
TRAPPC8-213ENST00000584876 GRIN2BQ13224 1484 aa41.65■■■■■ 4.26
TRAPPC8-213ENST00000584876 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.6■■■■■ 4.25
TRAPPC8-213ENST00000584876 SYNJ1O43426 1573 aa41.59■■■■■ 4.25
TRAPPC8-213ENST00000584876 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
TRAPPC8-213ENST00000584876 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
TRAPPC8-213ENST00000584876 PBRM1Q86U86 1689 aa41.58■■■■■ 4.25
TRAPPC8-213ENST00000584876 SYNJ2O15056 1496 aa41.53■■■■■ 4.24
TRAPPC8-213ENST00000584876 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.49■■■■■ 4.23
TRAPPC8-213ENST00000584876 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.44■■■■■ 4.23
TRAPPC8-213ENST00000584876 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.43■■■■■ 4.22
TRAPPC8-213ENST00000584876 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
TRAPPC8-213ENST00000584876 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.24■■■■■ 4.19
TRAPPC8-213ENST00000584876 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.24■■■■■ 4.19
TRAPPC8-213ENST00000584876 TOP2BQ02880 1626 aa41.21■■■■■ 4.19
TRAPPC8-213ENST00000584876 ADAMTS12P58397 1594 aa41.13■■■■■ 4.18
TRAPPC8-213ENST00000584876 GRIN2AQ12879 1464 aa41.12■■■■■ 4.17
TRAPPC8-213ENST00000584876 CEP170Q5SW79 1584 aa40.99■■■■■ 4.15
TRAPPC8-213ENST00000584876 NUP160Q12769 1436 aa40.97■■■■■ 4.15
TRAPPC8-213ENST00000584876 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.95■■■■■ 4.15
TRAPPC8-213ENST00000584876 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.94■■■■■ 4.14
TRAPPC8-213ENST00000584876 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.93■■■■■ 4.14
TRAPPC8-213ENST00000584876 SHROOM2Q13796 1616 aa40.84■■■■■ 4.13
TRAPPC8-213ENST00000584876 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
TRAPPC8-213ENST00000584876 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.56■■■■■ 4.08
TRAPPC8-213ENST00000584876 JPH4Q96JJ6 628 aa40.51■■■■■ 4.08
TRAPPC8-213ENST00000584876 CUL7Q14999 1698 aa40.37■■■■■ 4.05
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