RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-211ENST00000584538 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29■■■□□ 2.23
USP22-211ENST00000584538 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.84■■□□□ 1.73
USP22-211ENST00000584538 ABCC9O60706 1549 aa24.93■■□□□ 1.58
USP22-211ENST00000584538 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
USP22-211ENST00000584538 NACADO15069 1562 aa24.13■■□□□ 1.45
USP22-211ENST00000584538 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.12■■□□□ 1.45
USP22-211ENST00000584538 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.1■■□□□ 1.45
USP22-211ENST00000584538 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.06■■□□□ 1.44
USP22-211ENST00000584538 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.79■■□□□ 1.4
USP22-211ENST00000584538 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.74■■□□□ 1.39
USP22-211ENST00000584538 SCRIBQ14160 1630 aa23.5■■□□□ 1.35
USP22-211ENST00000584538 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.48■■□□□ 1.35
USP22-211ENST00000584538 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.22■■□□□ 1.31
USP22-211ENST00000584538 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
USP22-211ENST00000584538 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
USP22-211ENST00000584538 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.68■■□□□ 1.22
USP22-211ENST00000584538 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.64■■□□□ 1.22
USP22-211ENST00000584538 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.56■■□□□ 1.2
USP22-211ENST00000584538 SMARCA4P51532 1647 aa22.53■■□□□ 1.2
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USP22-211ENST00000584538 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.37■■□□□ 1.17
USP22-211ENST00000584538 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.33■■□□□ 1.17
USP22-211ENST00000584538 SMARCA2P51531 1590 aa22.28■■□□□ 1.16
USP22-211ENST00000584538 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.28■■□□□ 1.16
USP22-211ENST00000584538 HMGXB3Q12766 1538 aa22.24■■□□□ 1.15
USP22-211ENST00000584538 NCAPD3P42695 1498 aa22.23■■□□□ 1.15
USP22-211ENST00000584538 WIZO95785 1651 aa22.16■■□□□ 1.14
USP22-211ENST00000584538 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP22-211ENST00000584538 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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USP22-211ENST00000584538 NESP48681 1621 aa21.67■■□□□ 1.06
USP22-211ENST00000584538 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.67■■□□□ 1.06
USP22-211ENST00000584538 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.58■■□□□ 1.05
USP22-211ENST00000584538 PRDM2Q13029 1718 aa21.55■■□□□ 1.04
USP22-211ENST00000584538 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.53■■□□□ 1.04
USP22-211ENST00000584538 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.53■■□□□ 1.04
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USP22-211ENST00000584538 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
USP22-211ENST00000584538 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
USP22-211ENST00000584538 ERCC6Q03468 1493 aa21.42■■□□□ 1.02
USP22-211ENST00000584538 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.38■■□□□ 1.01
USP22-211ENST00000584538 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.33■■□□□ 1.01
USP22-211ENST00000584538 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.31■■□□□ 1
USP22-211ENST00000584538 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.26■□□□□ 0.99
USP22-211ENST00000584538 WDR62O43379 1518 aa21.25■□□□□ 0.99
USP22-211ENST00000584538 CUX2O14529 1486 aa21.23■□□□□ 0.99
USP22-211ENST00000584538 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
USP22-211ENST00000584538 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.08■□□□□ 0.97
USP22-211ENST00000584538 TOPBP1Q92547 1522 aa21.05■□□□□ 0.96
USP22-211ENST00000584538 CUX1P39880 1505 aa20.99■□□□□ 0.95
USP22-211ENST00000584538 ABCC8Q09428 1581 aa20.98■□□□□ 0.95
USP22-211ENST00000584538 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.92■□□□□ 0.94
USP22-211ENST00000584538 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
USP22-211ENST00000584538 SYNJ1O43426 1573 aa20.89■□□□□ 0.93
USP22-211ENST00000584538 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
USP22-211ENST00000584538 TOP2BQ02880 1626 aa20.86■□□□□ 0.93
USP22-211ENST00000584538 WDR97A6NE52 1622 aa20.86■□□□□ 0.93
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USP22-211ENST00000584538 IFT140Q96RY7 1462 aa20.84■□□□□ 0.93
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USP22-211ENST00000584538 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
USP22-211ENST00000584538 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.75■□□□□ 0.91
USP22-211ENST00000584538 SOGA1O94964 1423 aa20.68■□□□□ 0.9
USP22-211ENST00000584538 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.67■□□□□ 0.9
USP22-211ENST00000584538 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.67■□□□□ 0.9
USP22-211ENST00000584538 PBRM1Q86U86 1689 aa20.62■□□□□ 0.89
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USP22-211ENST00000584538 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.5■□□□□ 0.87
USP22-211ENST00000584538 CHD1O14646 1710 aa20.5■□□□□ 0.87
USP22-211ENST00000584538 GRIN2BQ13224 1484 aa20.49■□□□□ 0.87
USP22-211ENST00000584538 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.48■□□□□ 0.87
USP22-211ENST00000584538 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
USP22-211ENST00000584538 ADAMTS12P58397 1594 aa20.45■□□□□ 0.86
USP22-211ENST00000584538 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.43■□□□□ 0.86
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USP22-211ENST00000584538 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.27■□□□□ 0.84
USP22-211ENST00000584538 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.27■□□□□ 0.83
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USP22-211ENST00000584538 TRIM41Q8WV44 630 aa20.24■□□□□ 0.83
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USP22-211ENST00000584538 CEP170Q5SW79 1584 aa20.22■□□□□ 0.83
USP22-211ENST00000584538 IGF1RP08069 1367 aa20.21■□□□□ 0.83
USP22-211ENST00000584538 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.19■□□□□ 0.82
USP22-211ENST00000584538 NUP160Q12769 1436 aa20.19■□□□□ 0.82
USP22-211ENST00000584538 OSCARQ8IYS5 282 aa20.17■□□□□ 0.82
USP22-211ENST00000584538 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP22-211ENST00000584538 FBLN2P98095 1184 aa20.12■□□□□ 0.81
USP22-211ENST00000584538 SHROOM2Q13796 1616 aa20.11■□□□□ 0.81
USP22-211ENST00000584538 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
USP22-211ENST00000584538 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
USP22-211ENST00000584538 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
USP22-211ENST00000584538 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.08■□□□□ 0.81
USP22-211ENST00000584538 EEA1Q15075 1411 aa20.08■□□□□ 0.8
USP22-211ENST00000584538 PRXQ9BXM0 1461 aa20.07■□□□□ 0.8
USP22-211ENST00000584538 ARHGEF11O15085 1522 aa20.07■□□□□ 0.8
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