RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584400.5

SMARCD2-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 2, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCD2, Length 1,017 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2-210ENST00000584400 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.11■■■■■ 8.17
SMARCD2-210ENST00000584400 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.84■■■■■ 7.01
SMARCD2-210ENST00000584400 ABCC9O60706 1549 aa57.81■■■■■ 6.85
SMARCD2-210ENST00000584400 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.57■■■■■ 6.49
SMARCD2-210ENST00000584400 NACADO15069 1562 aa55.46■■■■■ 6.47
SMARCD2-210ENST00000584400 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.45■■■■■ 6.47
SMARCD2-210ENST00000584400 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.08■■■■■ 6.41
SMARCD2-210ENST00000584400 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.01■■■■■ 6.4
SMARCD2-210ENST00000584400 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.74■■■■■ 6.35
SMARCD2-210ENST00000584400 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.04■■■■■ 6.24
SMARCD2-210ENST00000584400 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.01■■■■■ 6.24
SMARCD2-210ENST00000584400 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.75■■■■■ 6.2
SMARCD2-210ENST00000584400 SCRIBQ14160 1630 aa53.63■■■■■ 6.18
SMARCD2-210ENST00000584400 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.37■■■■■ 6.13
SMARCD2-210ENST00000584400 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.21■■■■■ 6.11
SMARCD2-210ENST00000584400 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.43■■■■■ 5.98
SMARCD2-210ENST00000584400 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.25■■■■■ 5.95
SMARCD2-210ENST00000584400 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.01■■■■■ 5.92
SMARCD2-210ENST00000584400 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.3■■■■■ 5.8
SMARCD2-210ENST00000584400 SMARCA4P51532 1647 aa51.3■■■■■ 5.8
SMARCD2-210ENST00000584400 NCAPD3P42695 1498 aa51.19■■■■■ 5.79
SMARCD2-210ENST00000584400 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.14■■■■■ 5.78
SMARCD2-210ENST00000584400 SMARCA2P51531 1590 aa51.11■■■■■ 5.77
SMARCD2-210ENST00000584400 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.89■■■■■ 5.74
SMARCD2-210ENST00000584400 HMGXB3Q12766 1538 aa50.87■■■■■ 5.73
SMARCD2-210ENST00000584400 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.84■■■■■ 5.73
SMARCD2-210ENST00000584400 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.74■■■■■ 5.71
SMARCD2-210ENST00000584400 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.29■■■■■ 5.64
SMARCD2-210ENST00000584400 WIZO95785 1651 aa50.28■■■■■ 5.64
SMARCD2-210ENST00000584400 ERCC6Q03468 1493 aa49.94■■■■■ 5.58
SMARCD2-210ENST00000584400 NESP48681 1621 aa49.9■■■■■ 5.58
SMARCD2-210ENST00000584400 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.85■■■■■ 5.57
SMARCD2-210ENST00000584400 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.84■■■■■ 5.57
SMARCD2-210ENST00000584400 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.7■■■■■ 5.55
SMARCD2-210ENST00000584400 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.61■■■■■ 5.53
SMARCD2-210ENST00000584400 CUX2O14529 1486 aa49.49■■■■■ 5.51
SMARCD2-210ENST00000584400 CFTRP13569 1480 aa49.32■■■■■ 5.49
SMARCD2-210ENST00000584400 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.25■■■■■ 5.47
SMARCD2-210ENST00000584400 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.24■■■■■ 5.47
SMARCD2-210ENST00000584400 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.19■■■■■ 5.46
SMARCD2-210ENST00000584400 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.09■■■■■ 5.45
SMARCD2-210ENST00000584400 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.07■■■■■ 5.45
SMARCD2-210ENST00000584400 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.04■■■■■ 5.44
SMARCD2-210ENST00000584400 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.9■■■■■ 5.42
SMARCD2-210ENST00000584400 WDR62O43379 1518 aa48.84■■■■■ 5.41
SMARCD2-210ENST00000584400 PRDM2Q13029 1718 aa48.76■■■■■ 5.4
SMARCD2-210ENST00000584400 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.54■■■■■ 5.36
SMARCD2-210ENST00000584400 ABCC8Q09428 1581 aa48.37■■■■■ 5.33
SMARCD2-210ENST00000584400 TOPBP1Q92547 1522 aa48.25■■■■■ 5.31
SMARCD2-210ENST00000584400 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.24■■■■■ 5.31
SMARCD2-210ENST00000584400 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.17■■■■■ 5.3
SMARCD2-210ENST00000584400 IFT140Q96RY7 1462 aa48.07■■■■■ 5.29
SMARCD2-210ENST00000584400 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.83■■■■■ 5.25
SMARCD2-210ENST00000584400 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.76■■■■■ 5.24
SMARCD2-210ENST00000584400 CUX1P39880 1505 aa47.76■■■■■ 5.24
SMARCD2-210ENST00000584400 SOGA1O94964 1423 aa47.7■■■■■ 5.23
SMARCD2-210ENST00000584400 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.68■■■■■ 5.22
SMARCD2-210ENST00000584400 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.68■■■■■ 5.22
SMARCD2-210ENST00000584400 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.59■■■■■ 5.21
SMARCD2-210ENST00000584400 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.56■■■■■ 5.2
SMARCD2-210ENST00000584400 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.52■■■■■ 5.23e-8■■■■□ 23.4
SMARCD2-210ENST00000584400 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.47■■■■■ 5.19
SMARCD2-210ENST00000584400 OSCARQ8IYS5 282 aa47.47■■■■■ 5.19
SMARCD2-210ENST00000584400 WDR97A6NE52 1622 aa47.41■■■■■ 5.18
SMARCD2-210ENST00000584400 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
SMARCD2-210ENST00000584400 TOP2BQ02880 1626 aa47.31■■■■■ 5.16
SMARCD2-210ENST00000584400 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.27■■■■■ 5.16
SMARCD2-210ENST00000584400 SYNJ1O43426 1573 aa47.24■■■■■ 5.15
SMARCD2-210ENST00000584400 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.23■■■■■ 5.15
SMARCD2-210ENST00000584400 GRIN2BQ13224 1484 aa47.16■■■■■ 5.14
SMARCD2-210ENST00000584400 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.13■■■■■ 5.13
SMARCD2-210ENST00000584400 FBLN2P98095 1184 aa47.09■■■■■ 5.13
SMARCD2-210ENST00000584400 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.08■■■■■ 5.13
SMARCD2-210ENST00000584400 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.06■■■■■ 5.12
SMARCD2-210ENST00000584400 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.98■■■■■ 5.11
SMARCD2-210ENST00000584400 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.96■■■■■ 5.11
SMARCD2-210ENST00000584400 CHD1O14646 1710 aa46.93■■■■■ 5.1
SMARCD2-210ENST00000584400 PBRM1Q86U86 1689 aa46.89■■■■■ 5.1
SMARCD2-210ENST00000584400 SYNJ2O15056 1496 aa46.87■■■■■ 5.09
SMARCD2-210ENST00000584400 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.68■■■■■ 5.06
SMARCD2-210ENST00000584400 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.6■■■■■ 5.05
SMARCD2-210ENST00000584400 ADAMTS12P58397 1594 aa46.57■■■■■ 5.05
SMARCD2-210ENST00000584400 ARHGEF11O15085 1522 aa46.56■■■■■ 5.04
SMARCD2-210ENST00000584400 TRIM41Q8WV44 630 aa46.56■■■■■ 5.04
SMARCD2-210ENST00000584400 KIF27Q86VH2 1401 aa46.55■■■■■ 5.04
SMARCD2-210ENST00000584400 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.53■■■■■ 5.04
SMARCD2-210ENST00000584400 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.53■■■■■ 5.04
SMARCD2-210ENST00000584400 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.53■■■■■ 5.04
SMARCD2-210ENST00000584400 GRIN2AQ12879 1464 aa46.52■■■■■ 5.04
SMARCD2-210ENST00000584400 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.5■■■■■ 5.03
SMARCD2-210ENST00000584400 NUP160Q12769 1436 aa46.33■■■■■ 5.01
SMARCD2-210ENST00000584400 IGF1RP08069 1367 aa46.33■■■■■ 5.01
SMARCD2-210ENST00000584400 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.23■■■■■ 4.99
SMARCD2-210ENST00000584400 CEP170Q5SW79 1584 aa46.22■■■■■ 4.99
SMARCD2-210ENST00000584400 CUL7Q14999 1698 aa46.18■■■■■ 4.98
SMARCD2-210ENST00000584400 ARAP1Q96P48 1450 aa46.14■■■■■ 4.98
SMARCD2-210ENST00000584400 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.09■■■■■ 4.97
SMARCD2-210ENST00000584400 JPH4Q96JJ6 628 aa45.92■■■■■ 4.94
SMARCD2-210ENST00000584400 SHROOM2Q13796 1616 aa45.92■■■■■ 4.94
SMARCD2-210ENST00000584400 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.88■■■■■ 4.94
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