RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584216.5

COPS3-218, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene COPS3, Length 876 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-218ENST00000584216 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.83■■■■□ 3.01
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COPS3-218ENST00000584216 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.22■■■□□ 2.27
COPS3-218ENST00000584216 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.08■■■□□ 2.25
COPS3-218ENST00000584216 NACADO15069 1562 aa28.95■■■□□ 2.22
COPS3-218ENST00000584216 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.69■■■□□ 2.18
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COPS3-218ENST00000584216 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.48■■■□□ 2.15
COPS3-218ENST00000584216 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.37■■■□□ 2.13
COPS3-218ENST00000584216 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.28■■■□□ 2.12
COPS3-218ENST00000584216 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.05■■■□□ 2.08
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COPS3-218ENST00000584216 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.81■■■□□ 2.04
COPS3-218ENST00000584216 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.78■■■□□ 2.04
COPS3-218ENST00000584216 SCRIBQ14160 1630 aa27.72■■■□□ 2.03
COPS3-218ENST00000584216 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
COPS3-218ENST00000584216 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.05■■□□□ 1.92
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COPS3-218ENST00000584216 NCAPD3P42695 1498 aa26.72■■□□□ 1.87
COPS3-218ENST00000584216 ERCC6Q03468 1493 aa26.68■■□□□ 1.86
COPS3-218ENST00000584216 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.56■■□□□ 1.84
COPS3-218ENST00000584216 SMARCA2P51531 1590 aa26.53■■□□□ 1.84
COPS3-218ENST00000584216 HMGXB3Q12766 1538 aa26.49■■□□□ 1.83
COPS3-218ENST00000584216 SMARCA4P51532 1647 aa26.43■■□□□ 1.82
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COPS3-218ENST00000584216 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.21■■□□□ 1.79
COPS3-218ENST00000584216 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.17■■□□□ 1.78
COPS3-218ENST00000584216 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
COPS3-218ENST00000584216 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.08■■□□□ 1.77
COPS3-218ENST00000584216 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.01■■□□□ 1.75
COPS3-218ENST00000584216 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.93■■□□□ 1.74
COPS3-218ENST00000584216 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.9■■□□□ 1.74
COPS3-218ENST00000584216 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.83■■□□□ 1.73
COPS3-218ENST00000584216 WDR62O43379 1518 aa25.76■■□□□ 1.71
COPS3-218ENST00000584216 TRIM41Q8WV44 630 aa25.72■■□□□ 1.71
COPS3-218ENST00000584216 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.67■■□□□ 1.7
COPS3-218ENST00000584216 WIZO95785 1651 aa25.65■■□□□ 1.7
COPS3-218ENST00000584216 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.59■■□□□ 1.69
COPS3-218ENST00000584216 CFTRP13569 1480 aa25.53■■□□□ 1.68
COPS3-218ENST00000584216 OSCARQ8IYS5 282 aa25.47■■□□□ 1.67
COPS3-218ENST00000584216 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
COPS3-218ENST00000584216 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
COPS3-218ENST00000584216 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
COPS3-218ENST00000584216 IFT140Q96RY7 1462 aa25.18■■□□□ 1.62
COPS3-218ENST00000584216 PRDM2Q13029 1718 aa25.15■■□□□ 1.62
COPS3-218ENST00000584216 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
COPS3-218ENST00000584216 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.08■■□□□ 1.6
COPS3-218ENST00000584216 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.08■■□□□ 1.6
COPS3-218ENST00000584216 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.08■■□□□ 1.6
COPS3-218ENST00000584216 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.08■■□□□ 1.6
COPS3-218ENST00000584216 ABCC8Q09428 1581 aa25.06■■□□□ 1.6
COPS3-218ENST00000584216 TOPBP1Q92547 1522 aa25.05■■□□□ 1.6
COPS3-218ENST00000584216 ARHGEF11O15085 1522 aa25.01■■□□□ 1.59
COPS3-218ENST00000584216 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
COPS3-218ENST00000584216 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.94■■□□□ 1.58
COPS3-218ENST00000584216 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.86■■□□□ 1.57
COPS3-218ENST00000584216 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.56
COPS3-218ENST00000584216 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
COPS3-218ENST00000584216 FBLN2P98095 1184 aa24.79■■□□□ 1.56
COPS3-218ENST00000584216 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
COPS3-218ENST00000584216 CHD1O14646 1710 aa24.76■■□□□ 1.55
COPS3-218ENST00000584216 ARAP1Q96P48 1450 aa24.72■■□□□ 1.55
COPS3-218ENST00000584216 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
COPS3-218ENST00000584216 SOGA1O94964 1423 aa24.69■■□□□ 1.54
COPS3-218ENST00000584216 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.65■■□□□ 1.54
COPS3-218ENST00000584216 WDR97A6NE52 1622 aa24.65■■□□□ 1.54
COPS3-218ENST00000584216 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
COPS3-218ENST00000584216 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.6■■□□□ 1.53
COPS3-218ENST00000584216 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
COPS3-218ENST00000584216 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.57■■□□□ 1.52
COPS3-218ENST00000584216 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
COPS3-218ENST00000584216 SYNJ1O43426 1573 aa24.55■■□□□ 1.52
COPS3-218ENST00000584216 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.54■■□□□ 1.52
COPS3-218ENST00000584216 GRIN2BQ13224 1484 aa24.53■■□□□ 1.52
COPS3-218ENST00000584216 SYNJ2O15056 1496 aa24.48■■□□□ 1.51
COPS3-218ENST00000584216 CUX1P39880 1505 aa24.47■■□□□ 1.51
COPS3-218ENST00000584216 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.38■■□□□ 1.49
COPS3-218ENST00000584216 PBRM1Q86U86 1689 aa24.3■■□□□ 1.48
COPS3-218ENST00000584216 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.3■■□□□ 1.48
COPS3-218ENST00000584216 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
COPS3-218ENST00000584216 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.25■■□□□ 1.47
COPS3-218ENST00000584216 GRIN2AQ12879 1464 aa24.19■■□□□ 1.46
COPS3-218ENST00000584216 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
COPS3-218ENST00000584216 NUP160Q12769 1436 aa24.12■■□□□ 1.45
COPS3-218ENST00000584216 ADAMTS12P58397 1594 aa24.1■■□□□ 1.45
COPS3-218ENST00000584216 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.08■■□□□ 1.44
COPS3-218ENST00000584216 CEP170Q5SW79 1584 aa24.08■■□□□ 1.44
COPS3-218ENST00000584216 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.06■■□□□ 1.44
COPS3-218ENST00000584216 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
COPS3-218ENST00000584216 TOP2BQ02880 1626 aa24.02■■□□□ 1.44
COPS3-218ENST00000584216 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24■■□□□ 1.43
COPS3-218ENST00000584216 SHROOM2Q13796 1616 aa24■■□□□ 1.43
COPS3-218ENST00000584216 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24■■□□□ 1.43
COPS3-218ENST00000584216 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
COPS3-218ENST00000584216 JPH4Q96JJ6 628 aa23.88■■□□□ 1.41
COPS3-218ENST00000584216 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.41
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