RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583136.5

POLI-214, Transcript of DNA polymerase iota, humanhuman

TSL 3

Gene POLI, Length 1,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLI-214ENST00000583136 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.05■■■■■ 6.88
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POLI-214ENST00000583136 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.13■■■■■ 5.94
POLI-214ENST00000583136 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.69■■■■■ 5.54
POLI-214ENST00000583136 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.33■■■■■ 5.49
POLI-214ENST00000583136 NACADO15069 1562 aa49.31■■■■■ 5.48
POLI-214ENST00000583136 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.06■■■■■ 5.44
POLI-214ENST00000583136 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.72■■■■■ 5.39
POLI-214ENST00000583136 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.68■■■■■ 5.38
POLI-214ENST00000583136 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.58■■■■■ 5.37
POLI-214ENST00000583136 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.34■■■■■ 5.33
POLI-214ENST00000583136 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
POLI-214ENST00000583136 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.91■■■■■ 5.26
POLI-214ENST00000583136 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.53■■■■■ 5.2
POLI-214ENST00000583136 SCRIBQ14160 1630 aa47.52■■■■■ 5.2
POLI-214ENST00000583136 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.27■■■■■ 5.16
POLI-214ENST00000583136 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.13■■■■■ 5.13
POLI-214ENST00000583136 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
POLI-214ENST00000583136 NCAPD3P42695 1498 aa45.55■■■■■ 4.88
POLI-214ENST00000583136 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.4■■■■■ 4.86
POLI-214ENST00000583136 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.34■■■■■ 4.85
POLI-214ENST00000583136 SMARCA4P51532 1647 aa45.32■■■■■ 4.85
POLI-214ENST00000583136 SMARCA2P51531 1590 aa45.21■■■■■ 4.83
POLI-214ENST00000583136 HMGXB3Q12766 1538 aa45.17■■■■■ 4.82
POLI-214ENST00000583136 ERCC6Q03468 1493 aa45.12■■■■■ 4.81
POLI-214ENST00000583136 CUX2O14529 1486 aa45.11■■■■■ 4.81
POLI-214ENST00000583136 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
POLI-214ENST00000583136 NESP48681 1621 aa44.95■■■■■ 4.79
POLI-214ENST00000583136 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
POLI-214ENST00000583136 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.87■■■■■ 4.77
POLI-214ENST00000583136 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.77■■■■■ 4.76
POLI-214ENST00000583136 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.53■■■■■ 4.72
POLI-214ENST00000583136 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
POLI-214ENST00000583136 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.35■■■■■ 4.69
POLI-214ENST00000583136 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.25■■■■■ 4.67
POLI-214ENST00000583136 WIZO95785 1651 aa44.23■■■■■ 4.67
POLI-214ENST00000583136 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.16■■■■■ 4.66
POLI-214ENST00000583136 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.91■■■■■ 4.62
POLI-214ENST00000583136 WDR62O43379 1518 aa43.83■■■■■ 4.61
POLI-214ENST00000583136 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
POLI-214ENST00000583136 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.69■■■■■ 4.58
POLI-214ENST00000583136 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.65■■■■■ 4.58
POLI-214ENST00000583136 CFTRP13569 1480 aa43.63■■■■■ 4.57
POLI-214ENST00000583136 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
POLI-214ENST00000583136 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
POLI-214ENST00000583136 TRIM41Q8WV44 630 aa43.26■■■■■ 4.52
POLI-214ENST00000583136 PRDM2Q13029 1718 aa43.18■■■■■ 4.5
POLI-214ENST00000583136 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.14■■■■■ 4.5
POLI-214ENST00000583136 OSCARQ8IYS5 282 aa43.05■■■■■ 4.48
POLI-214ENST00000583136 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
POLI-214ENST00000583136 IFT140Q96RY7 1462 aa42.83■■■■■ 4.45
POLI-214ENST00000583136 TOPBP1Q92547 1522 aa42.82■■■■■ 4.45
POLI-214ENST00000583136 ABCC8Q09428 1581 aa42.65■■■■■ 4.42
POLI-214ENST00000583136 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.64■■■■■ 4.42
POLI-214ENST00000583136 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
POLI-214ENST00000583136 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.56■■■■■ 4.4
POLI-214ENST00000583136 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.56■■■■■ 4.4
POLI-214ENST00000583136 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.56■■■■■ 4.4
POLI-214ENST00000583136 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
POLI-214ENST00000583136 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.43■■■■■ 4.38
POLI-214ENST00000583136 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
POLI-214ENST00000583136 ARHGEF11O15085 1522 aa42.37■■■■■ 4.37
POLI-214ENST00000583136 CHD1O14646 1710 aa42.32■■■■■ 4.36
POLI-214ENST00000583136 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.26■■■■■ 4.36
POLI-214ENST00000583136 SOGA1O94964 1423 aa42.18■■■■■ 4.34
POLI-214ENST00000583136 FBLN2P98095 1184 aa42.14■■■■■ 4.34
POLI-214ENST00000583136 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
POLI-214ENST00000583136 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.09■■■■■ 4.33
POLI-214ENST00000583136 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.08■■■■■ 4.33
POLI-214ENST00000583136 CUX1P39880 1505 aa42.05■■■■■ 4.32
POLI-214ENST00000583136 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
POLI-214ENST00000583136 ARAP1Q96P48 1450 aa41.97■■■■■ 4.31
POLI-214ENST00000583136 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.96■■■■■ 4.31
POLI-214ENST00000583136 WDR97A6NE52 1622 aa41.95■■■■■ 4.31
POLI-214ENST00000583136 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.8■■■■■ 4.28
POLI-214ENST00000583136 GRIN2BQ13224 1484 aa41.8■■■■■ 4.28
POLI-214ENST00000583136 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
POLI-214ENST00000583136 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
POLI-214ENST00000583136 SYNJ1O43426 1573 aa41.71■■■■■ 4.27
POLI-214ENST00000583136 SYNJ2O15056 1496 aa41.68■■■■■ 4.26
POLI-214ENST00000583136 PBRM1Q86U86 1689 aa41.67■■■■■ 4.26
POLI-214ENST00000583136 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.65■■■■■ 4.26
POLI-214ENST00000583136 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
POLI-214ENST00000583136 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.59■■■■■ 4.25
POLI-214ENST00000583136 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.56■■■■■ 4.24
POLI-214ENST00000583136 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.35■■■■■ 4.21
POLI-214ENST00000583136 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.33■■■■■ 4.21
POLI-214ENST00000583136 TOP2BQ02880 1626 aa41.31■■■■■ 4.2
POLI-214ENST00000583136 GRIN2AQ12879 1464 aa41.28■■■■■ 4.2
POLI-214ENST00000583136 ADAMTS12P58397 1594 aa41.25■■■■■ 4.19
POLI-214ENST00000583136 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.2■■■■■ 4.19
POLI-214ENST00000583136 CEP170Q5SW79 1584 aa41.18■■■■■ 4.18
POLI-214ENST00000583136 NUP160Q12769 1436 aa41.16■■■■■ 4.18
POLI-214ENST00000583136 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.1■■■■■ 4.17
POLI-214ENST00000583136 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.04■■■■■ 4.16
POLI-214ENST00000583136 SHROOM2Q13796 1616 aa41.02■■■■■ 4.16
POLI-214ENST00000583136 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
POLI-214ENST00000583136 JPH4Q96JJ6 628 aa40.74■■■■■ 4.11
POLI-214ENST00000583136 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.67■■■■■ 4.1
POLI-214ENST00000583136 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.58■■■■■ 4.09
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