RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582429.5

HEXDC-212, Transcript of hexosaminidase D, humanhuman

TSL 2

Gene HEXDC, Length 1,824 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEXDC-212ENST00000582429 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.99■■■■■ 6.23
HEXDC-212ENST00000582429 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.84■■■■■ 5.25
HEXDC-212ENST00000582429 ABCC9O60706 1549 aa45.98■■■■■ 4.95
HEXDC-212ENST00000582429 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
HEXDC-212ENST00000582429 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.78■■■■■ 4.76
HEXDC-212ENST00000582429 NACADO15069 1562 aa44.76■■■■■ 4.76
HEXDC-212ENST00000582429 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.74■■■■■ 4.75
HEXDC-212ENST00000582429 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.65■■■■■ 4.74
HEXDC-212ENST00000582429 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.65■■■■■ 4.74
HEXDC-212ENST00000582429 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.72■■■■■ 4.59
HEXDC-212ENST00000582429 SCRIBQ14160 1630 aa43.58■■■■■ 4.57
HEXDC-212ENST00000582429 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.24■■■■■ 4.51
HEXDC-212ENST00000582429 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43■■■■■ 4.477e-7■■■■□ 20
HEXDC-212ENST00000582429 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.94■■■■■ 4.46
HEXDC-212ENST00000582429 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
HEXDC-212ENST00000582429 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.92■■■■■ 4.3
HEXDC-212ENST00000582429 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
HEXDC-212ENST00000582429 SMARCA4P51532 1647 aa41.8■■■■■ 4.28
HEXDC-212ENST00000582429 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.71■■■■■ 4.27
HEXDC-212ENST00000582429 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.59■■■■■ 4.25
HEXDC-212ENST00000582429 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.53■■■■■ 4.24
HEXDC-212ENST00000582429 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.42■■■■■ 4.22
HEXDC-212ENST00000582429 SMARCA2P51531 1590 aa41.39■■■■■ 4.22
HEXDC-212ENST00000582429 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.34■■■■■ 4.21
HEXDC-212ENST00000582429 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
HEXDC-212ENST00000582429 NCAPD3P42695 1498 aa41.24■■■■■ 4.19
HEXDC-212ENST00000582429 WIZO95785 1651 aa41.21■■■■■ 4.19
HEXDC-212ENST00000582429 HMGXB3Q12766 1538 aa41.16■■■■■ 4.18
HEXDC-212ENST00000582429 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
HEXDC-212ENST00000582429 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
HEXDC-212ENST00000582429 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
HEXDC-212ENST00000582429 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.29■■■■■ 4.04
HEXDC-212ENST00000582429 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.11■■■■■ 4.01
HEXDC-212ENST00000582429 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.04■■■■■ 4
HEXDC-212ENST00000582429 NESP48681 1621 aa39.99■■■■□ 3.99
HEXDC-212ENST00000582429 CFTRP13569 1480 aa39.97■■■■□ 3.99
HEXDC-212ENST00000582429 PRDM2Q13029 1718 aa39.91■■■■□ 3.98
HEXDC-212ENST00000582429 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.75■■■■□ 3.95
HEXDC-212ENST00000582429 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.66■■■■□ 3.94
HEXDC-212ENST00000582429 ERCC6Q03468 1493 aa39.62■■■■□ 3.93
HEXDC-212ENST00000582429 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.59■■■■□ 3.93
HEXDC-212ENST00000582429 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.51■■■■□ 3.91
HEXDC-212ENST00000582429 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
HEXDC-212ENST00000582429 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.31■■■■□ 3.88
HEXDC-212ENST00000582429 WDR62O43379 1518 aa39.2■■■■□ 3.87
HEXDC-212ENST00000582429 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
HEXDC-212ENST00000582429 ABCC8Q09428 1581 aa39.13■■■■□ 3.85
HEXDC-212ENST00000582429 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.1■■■■□ 3.85
HEXDC-212ENST00000582429 TOPBP1Q92547 1522 aa39.05■■■■□ 3.84
HEXDC-212ENST00000582429 CUX2O14529 1486 aa39.02■■■■□ 3.84
HEXDC-212ENST00000582429 CUX1P39880 1505 aa38.99■■■■□ 3.83
HEXDC-212ENST00000582429 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.97■■■■□ 3.83
HEXDC-212ENST00000582429 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.91■■■■□ 3.82
HEXDC-212ENST00000582429 TOP2BQ02880 1626 aa38.89■■■■□ 3.82
HEXDC-212ENST00000582429 SYNJ1O43426 1573 aa38.87■■■■□ 3.81
HEXDC-212ENST00000582429 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
HEXDC-212ENST00000582429 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.75■■■■□ 3.79
HEXDC-212ENST00000582429 IFT140Q96RY7 1462 aa38.65■■■■□ 3.78
HEXDC-212ENST00000582429 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
HEXDC-212ENST00000582429 SOGA1O94964 1423 aa38.57■■■■□ 3.76
HEXDC-212ENST00000582429 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.52■■■■□ 3.76
HEXDC-212ENST00000582429 WDR97A6NE52 1622 aa38.51■■■■□ 3.76
HEXDC-212ENST00000582429 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.44■■■■□ 3.74
HEXDC-212ENST00000582429 TRIM41Q8WV44 630 aa38.42■■■■□ 3.74
HEXDC-212ENST00000582429 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
HEXDC-212ENST00000582429 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.36■■■■□ 3.73
HEXDC-212ENST00000582429 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.34■■■■□ 3.73
HEXDC-212ENST00000582429 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.27■■■■□ 3.72
HEXDC-212ENST00000582429 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
HEXDC-212ENST00000582429 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.21■■■■□ 3.712e-7■■■■■ 34.4
HEXDC-212ENST00000582429 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.17■■■■□ 3.7
HEXDC-212ENST00000582429 PBRM1Q86U86 1689 aa38.16■■■■□ 3.7
HEXDC-212ENST00000582429 KIF27Q86VH2 1401 aa38.11■■■■□ 3.69
HEXDC-212ENST00000582429 GRIN2BQ13224 1484 aa38.08■■■■□ 3.69
HEXDC-212ENST00000582429 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.02■■■■□ 3.68
HEXDC-212ENST00000582429 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
HEXDC-212ENST00000582429 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.93■■■■□ 3.66
HEXDC-212ENST00000582429 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.9■■■■□ 3.66
HEXDC-212ENST00000582429 EEA1Q15075 1411 aa37.87■■■■□ 3.65
HEXDC-212ENST00000582429 CUL7Q14999 1698 aa37.85■■■■□ 3.65
HEXDC-212ENST00000582429 ADAMTS12P58397 1594 aa37.84■■■■□ 3.65
HEXDC-212ENST00000582429 IGF1RP08069 1367 aa37.83■■■■□ 3.65
HEXDC-212ENST00000582429 SYNJ2O15056 1496 aa37.77■■■■□ 3.64
HEXDC-212ENST00000582429 CHD1O14646 1710 aa37.76■■■■□ 3.64
HEXDC-212ENST00000582429 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.76■■■■□ 3.63
HEXDC-212ENST00000582429 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.63■■■■□ 3.61
HEXDC-212ENST00000582429 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
HEXDC-212ENST00000582429 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.61■■■■□ 3.61
HEXDC-212ENST00000582429 GRIN2AQ12879 1464 aa37.6■■■■□ 3.61
HEXDC-212ENST00000582429 FBLN2P98095 1184 aa37.57■■■■□ 3.6
HEXDC-212ENST00000582429 PRXQ9BXM0 1461 aa37.55■■■■□ 3.6
HEXDC-212ENST00000582429 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
HEXDC-212ENST00000582429 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.52■■■■□ 3.6
HEXDC-212ENST00000582429 KIF21BO75037 1637 aa37.45■■■■□ 3.59
HEXDC-212ENST00000582429 OSCARQ8IYS5 282 aa37.43■■■■□ 3.58
HEXDC-212ENST00000582429 NUP160Q12769 1436 aa37.41■■■■□ 3.58
HEXDC-212ENST00000582429 CEP170Q5SW79 1584 aa37.39■■■■□ 3.58
HEXDC-212ENST00000582429 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.32■■■■□ 3.57
HEXDC-212ENST00000582429 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.26■■■■□ 3.55
HEXDC-212ENST00000582429 GOLGA3Q08378 1498 aa37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.3 ms