RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581180.1

MKS1-210, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKS1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-210ENST00000581180 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.19■■■■□ 3.38
MKS1-210ENST00000581180 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.05■■■□□ 2.72
MKS1-210ENST00000581180 ABCC9O60706 1549 aa30.94■■■□□ 2.54
MKS1-210ENST00000581180 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
MKS1-210ENST00000581180 NACADO15069 1562 aa30.02■■■□□ 2.4
MKS1-210ENST00000581180 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.99■■■□□ 2.39
MKS1-210ENST00000581180 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.98■■■□□ 2.39
MKS1-210ENST00000581180 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.98■■■□□ 2.39
MKS1-210ENST00000581180 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.94■■■□□ 2.38
MKS1-210ENST00000581180 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.4■■■□□ 2.3
MKS1-210ENST00000581180 SCRIBQ14160 1630 aa29.23■■■□□ 2.27
MKS1-210ENST00000581180 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.09■■■□□ 2.25
MKS1-210ENST00000581180 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
MKS1-210ENST00000581180 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.77■■■□□ 2.2
MKS1-210ENST00000581180 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
MKS1-210ENST00000581180 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.15■■■□□ 2.1
MKS1-210ENST00000581180 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.1■■■□□ 2.09
MKS1-210ENST00000581180 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.05■■■□□ 2.08
MKS1-210ENST00000581180 SMARCA4P51532 1647 aa28.02■■■□□ 2.08
MKS1-210ENST00000581180 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
MKS1-210ENST00000581180 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.9■■■□□ 2.06
MKS1-210ENST00000581180 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.77■■■□□ 2.04
MKS1-210ENST00000581180 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.76■■■□□ 2.03
MKS1-210ENST00000581180 SMARCA2P51531 1590 aa27.73■■■□□ 2.03
MKS1-210ENST00000581180 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
MKS1-210ENST00000581180 NCAPD3P42695 1498 aa27.69■■■□□ 2.02
MKS1-210ENST00000581180 WIZO95785 1651 aa27.65■■■□□ 2.02
MKS1-210ENST00000581180 HMGXB3Q12766 1538 aa27.59■■■□□ 2.01
MKS1-210ENST00000581180 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
MKS1-210ENST00000581180 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
MKS1-210ENST00000581180 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
MKS1-210ENST00000581180 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.02■■□□□ 1.92
MKS1-210ENST00000581180 NESP48681 1621 aa26.91■■□□□ 1.9
MKS1-210ENST00000581180 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.9■■□□□ 1.9
MKS1-210ENST00000581180 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.88■■□□□ 1.89
MKS1-210ENST00000581180 CFTRP13569 1480 aa26.81■■□□□ 1.88
MKS1-210ENST00000581180 PRDM2Q13029 1718 aa26.73■■□□□ 1.87
MKS1-210ENST00000581180 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.66■■□□□ 1.86
MKS1-210ENST00000581180 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.65■■□□□ 1.86
MKS1-210ENST00000581180 ERCC6Q03468 1493 aa26.61■■□□□ 1.85
MKS1-210ENST00000581180 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.57■■□□□ 1.84
MKS1-210ENST00000581180 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.49■■□□□ 1.83
MKS1-210ENST00000581180 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
MKS1-210ENST00000581180 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.39■■□□□ 1.82
MKS1-210ENST00000581180 WDR62O43379 1518 aa26.32■■□□□ 1.8
MKS1-210ENST00000581180 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
MKS1-210ENST00000581180 CUX2O14529 1486 aa26.23■■□□□ 1.79
MKS1-210ENST00000581180 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.21■■□□□ 1.79
MKS1-210ENST00000581180 TOPBP1Q92547 1522 aa26.21■■□□□ 1.79
MKS1-210ENST00000581180 ABCC8Q09428 1581 aa26.2■■□□□ 1.79
MKS1-210ENST00000581180 CUX1P39880 1505 aa26.15■■□□□ 1.78
MKS1-210ENST00000581180 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
MKS1-210ENST00000581180 SYNJ1O43426 1573 aa26.05■■□□□ 1.76
MKS1-210ENST00000581180 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.05■■□□□ 1.76
MKS1-210ENST00000581180 TOP2BQ02880 1626 aa26.03■■□□□ 1.76
MKS1-210ENST00000581180 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
MKS1-210ENST00000581180 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.99■■□□□ 1.75
MKS1-210ENST00000581180 IFT140Q96RY7 1462 aa25.93■■□□□ 1.74
MKS1-210ENST00000581180 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
MKS1-210ENST00000581180 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.89■■□□□ 1.73
MKS1-210ENST00000581180 SOGA1O94964 1423 aa25.88■■□□□ 1.73
MKS1-210ENST00000581180 WDR97A6NE52 1622 aa25.83■■□□□ 1.73
MKS1-210ENST00000581180 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
MKS1-210ENST00000581180 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.78■■□□□ 1.72
MKS1-210ENST00000581180 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
MKS1-210ENST00000581180 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
MKS1-210ENST00000581180 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
MKS1-210ENST00000581180 TRIM41Q8WV44 630 aa25.68■■□□□ 1.7
MKS1-210ENST00000581180 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.66■■□□□ 1.7
MKS1-210ENST00000581180 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.66■■□□□ 1.7
MKS1-210ENST00000581180 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.6■■□□□ 1.69
MKS1-210ENST00000581180 PBRM1Q86U86 1689 aa25.58■■□□□ 1.69
MKS1-210ENST00000581180 GRIN2BQ13224 1484 aa25.54■■□□□ 1.68
MKS1-210ENST00000581180 KIF27Q86VH2 1401 aa25.51■■□□□ 1.67
MKS1-210ENST00000581180 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.47■■□□□ 1.67
MKS1-210ENST00000581180 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.46■■□□□ 1.67
MKS1-210ENST00000581180 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
MKS1-210ENST00000581180 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.43■■□□□ 1.66
MKS1-210ENST00000581180 IGF1RP08069 1367 aa25.38■■□□□ 1.65
MKS1-210ENST00000581180 CHD1O14646 1710 aa25.37■■□□□ 1.65
MKS1-210ENST00000581180 ADAMTS12P58397 1594 aa25.37■■□□□ 1.65
MKS1-210ENST00000581180 SYNJ2O15056 1496 aa25.34■■□□□ 1.65
MKS1-210ENST00000581180 CUL7Q14999 1698 aa25.32■■□□□ 1.64
MKS1-210ENST00000581180 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.31■■□□□ 1.64
MKS1-210ENST00000581180 EEA1Q15075 1411 aa25.27■■□□□ 1.64
MKS1-210ENST00000581180 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
MKS1-210ENST00000581180 FBLN2P98095 1184 aa25.24■■□□□ 1.63
MKS1-210ENST00000581180 GRIN2AQ12879 1464 aa25.22■■□□□ 1.63
MKS1-210ENST00000581180 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.22■■□□□ 1.63
MKS1-210ENST00000581180 OSCARQ8IYS5 282 aa25.19■■□□□ 1.62
MKS1-210ENST00000581180 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.17■■□□□ 1.62
MKS1-210ENST00000581180 PRXQ9BXM0 1461 aa25.15■■□□□ 1.62
MKS1-210ENST00000581180 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
MKS1-210ENST00000581180 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.12■■□□□ 1.61
MKS1-210ENST00000581180 NUP160Q12769 1436 aa25.12■■□□□ 1.61
MKS1-210ENST00000581180 CEP170Q5SW79 1584 aa25.1■■□□□ 1.61
MKS1-210ENST00000581180 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.08■■□□□ 1.61
MKS1-210ENST00000581180 KIF21BO75037 1637 aa25.02■■□□□ 1.6
MKS1-210ENST00000581180 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25■■□□□ 1.59
MKS1-210ENST00000581180 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.94■■□□□ 1.58
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