RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577488.5

MED24-217, Transcript of mediator complex subunit 24, humanhuman

TSL 4

Gene MED24, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED24-217ENST00000577488 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.84■■■□□ 2.37
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MED24-217ENST00000577488 ABCC9O60706 1549 aa26.31■■□□□ 1.8
MED24-217ENST00000577488 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.26■■□□□ 1.63
MED24-217ENST00000577488 NACADO15069 1562 aa25.17■■□□□ 1.62
MED24-217ENST00000577488 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.06■■□□□ 1.6
MED24-217ENST00000577488 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.95■■□□□ 1.58
MED24-217ENST00000577488 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
MED24-217ENST00000577488 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.72■■□□□ 1.55
MED24-217ENST00000577488 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.55■■□□□ 1.52
MED24-217ENST00000577488 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
MED24-217ENST00000577488 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.4■■□□□ 1.5
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MED24-217ENST00000577488 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.29■■□□□ 1.48
MED24-217ENST00000577488 SCRIBQ14160 1630 aa24.28■■□□□ 1.48
MED24-217ENST00000577488 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
MED24-217ENST00000577488 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.79■■□□□ 1.4
MED24-217ENST00000577488 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.71■■□□□ 1.39
MED24-217ENST00000577488 SMARCA4P51532 1647 aa23.21■■□□□ 1.31
MED24-217ENST00000577488 NCAPD3P42695 1498 aa23.2■■□□□ 1.3
MED24-217ENST00000577488 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
MED24-217ENST00000577488 SMARCA2P51531 1590 aa23.17■■□□□ 1.3
MED24-217ENST00000577488 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.16■■□□□ 1.3
MED24-217ENST00000577488 HMGXB3Q12766 1538 aa23.08■■□□□ 1.29
MED24-217ENST00000577488 PEG3Q9GZU2 1588 aa23■■□□□ 1.27
MED24-217ENST00000577488 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
MED24-217ENST00000577488 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.96■■□□□ 1.27
MED24-217ENST00000577488 ERCC6Q03468 1493 aa22.79■■□□□ 1.24
MED24-217ENST00000577488 WIZO95785 1651 aa22.68■■□□□ 1.22
MED24-217ENST00000577488 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.66■■□□□ 1.22
MED24-217ENST00000577488 NESP48681 1621 aa22.65■■□□□ 1.22
MED24-217ENST00000577488 CUX2O14529 1486 aa22.64■■□□□ 1.21
MED24-217ENST00000577488 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
MED24-217ENST00000577488 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.55■■□□□ 1.2
MED24-217ENST00000577488 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.52■■□□□ 1.2
MED24-217ENST00000577488 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
MED24-217ENST00000577488 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
MED24-217ENST00000577488 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.39■■□□□ 1.17
MED24-217ENST00000577488 CFTRP13569 1480 aa22.32■■□□□ 1.16
MED24-217ENST00000577488 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.29■■□□□ 1.16
MED24-217ENST00000577488 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.28■■□□□ 1.16
MED24-217ENST00000577488 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.26■■□□□ 1.15
MED24-217ENST00000577488 WDR62O43379 1518 aa22.21■■□□□ 1.15
MED24-217ENST00000577488 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.19■■□□□ 1.14
MED24-217ENST00000577488 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.19■■□□□ 1.14
MED24-217ENST00000577488 PRDM2Q13029 1718 aa22.11■■□□□ 1.13
MED24-217ENST00000577488 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
MED24-217ENST00000577488 ABCC8Q09428 1581 aa21.92■■□□□ 1.1
MED24-217ENST00000577488 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
MED24-217ENST00000577488 TOPBP1Q92547 1522 aa21.85■■□□□ 1.09
MED24-217ENST00000577488 IFT140Q96RY7 1462 aa21.83■■□□□ 1.09
MED24-217ENST00000577488 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.82■■□□□ 1.08
MED24-217ENST00000577488 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
MED24-217ENST00000577488 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
MED24-217ENST00000577488 OSCARQ8IYS5 282 aa21.64■■□□□ 1.05
MED24-217ENST00000577488 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
MED24-217ENST00000577488 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
MED24-217ENST00000577488 SOGA1O94964 1423 aa21.58■■□□□ 1.05
MED24-217ENST00000577488 CUX1P39880 1505 aa21.56■■□□□ 1.04
MED24-217ENST00000577488 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.56■■□□□ 1.04
MED24-217ENST00000577488 WDR97A6NE52 1622 aa21.53■■□□□ 1.04
MED24-217ENST00000577488 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
MED24-217ENST00000577488 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.52■■□□□ 1.04
MED24-217ENST00000577488 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
MED24-217ENST00000577488 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
MED24-217ENST00000577488 FBLN2P98095 1184 aa21.38■■□□□ 1.01
MED24-217ENST00000577488 GRIN2BQ13224 1484 aa21.38■■□□□ 1.01
MED24-217ENST00000577488 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.37■■□□□ 1.01
MED24-217ENST00000577488 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.36■■□□□ 1.01
MED24-217ENST00000577488 TRIM41Q8WV44 630 aa21.36■■□□□ 1.01
MED24-217ENST00000577488 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
MED24-217ENST00000577488 CHD1O14646 1710 aa21.35■■□□□ 1.01
MED24-217ENST00000577488 TOP2BQ02880 1626 aa21.33■■□□□ 1.01
MED24-217ENST00000577488 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.33■■□□□ 1.01
MED24-217ENST00000577488 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.33■■□□□ 1
MED24-217ENST00000577488 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
MED24-217ENST00000577488 SYNJ1O43426 1573 aa21.27■■□□□ 1
MED24-217ENST00000577488 SYNJ2O15056 1496 aa21.26■□□□□ 0.99
MED24-217ENST00000577488 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.26■□□□□ 0.99
MED24-217ENST00000577488 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.26■□□□□ 0.99
MED24-217ENST00000577488 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.26■□□□□ 0.99
MED24-217ENST00000577488 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.26■□□□□ 0.99
MED24-217ENST00000577488 PBRM1Q86U86 1689 aa21.26■□□□□ 0.99
MED24-217ENST00000577488 ARHGEF11O15085 1522 aa21.24■□□□□ 0.99
MED24-217ENST00000577488 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.14■□□□□ 0.98
MED24-217ENST00000577488 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.12■□□□□ 0.97
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MED24-217ENST00000577488 KIF27Q86VH2 1401 aa20.99■□□□□ 0.95
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MED24-217ENST00000577488 CUL7Q14999 1698 aa20.88■□□□□ 0.93
MED24-217ENST00000577488 IGF1RP08069 1367 aa20.86■□□□□ 0.93
MED24-217ENST00000577488 SHROOM2Q13796 1616 aa20.83■□□□□ 0.93
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MED24-217ENST00000577488 JPH4Q96JJ6 628 aa20.79■□□□□ 0.92
MED24-217ENST00000577488 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.78■□□□□ 0.92
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