RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576872.1

CAMTA2-216, Transcript of calmodulin binding transcription activator 2, human

TSL 2

Gene CAMTA2, Length 985 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAMTA2-216	ENST00000576872	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		42.7	■■■■■ 4.43
CAMTA2-216	ENST00000576872	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		37.98	■■■■□ 3.67
CAMTA2-216	ENST00000576872	ABCC9	O60706	1549 aa		37.2	■■■■□ 3.55
CAMTA2-216	ENST00000576872	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		35.75	■■■■□ 3.31
CAMTA2-216	ENST00000576872	NACAD	O15069	1562 aa		35.71	■■■■□ 3.31
CAMTA2-216	ENST00000576872	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		35.65	■■■■□ 3.3
CAMTA2-216	ENST00000576872	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.57	■■■■□ 3.28
CAMTA2-216	ENST00000576872	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		35.48	■■■■□ 3.27
CAMTA2-216	ENST00000576872	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		35.32	■■■■□ 3.25
CAMTA2-216	ENST00000576872	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		34.96	■■■■□ 3.19
CAMTA2-216	ENST00000576872	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	34.75	■■■■□ 3.15
CAMTA2-216	ENST00000576872	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.7	■■■■□ 3.15
CAMTA2-216	ENST00000576872	SCRIB	Q14160	1630 aa		34.66	■■■■□ 3.14
CAMTA2-216	ENST00000576872	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.31	■■■■□ 3.08
CAMTA2-216	ENST00000576872	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		34.18	■■■■□ 3.06
CAMTA2-216	ENST00000576872	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
CAMTA2-216	ENST00000576872	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		33.64	■■■□□ 2.98
CAMTA2-216	ENST00000576872	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		33.43	■■■□□ 2.94
CAMTA2-216	ENST00000576872	SMARCA4	P51532	1647 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CAMTA2-216	ENST00000576872	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
CAMTA2-216	ENST00000576872	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CAMTA2-216	ENST00000576872	NCAPD3	P42695	1498 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CAMTA2-216	ENST00000576872	SMARCA2	P51531	1590 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CAMTA2-216	ENST00000576872	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CAMTA2-216	ENST00000576872	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAMTA2-216	ENST00000576872	HMGXB3	Q12766	1538 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CAMTA2-216	ENST00000576872	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
CAMTA2-216	ENST00000576872	WIZ	O95785	1651 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CAMTA2-216	ENST00000576872	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.8
CAMTA2-216	ENST00000576872	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
CAMTA2-216	ENST00000576872	NES	P48681	1621 aa		32.18	■■■□□ 2.74
CAMTA2-216	ENST00000576872	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CAMTA2-216	ENST00000576872	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.05	■■■□□ 2.72
CAMTA2-216	ENST00000576872	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		31.98	■■■□□ 2.71
CAMTA2-216	ENST00000576872	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		31.86	■■■□□ 2.69
CAMTA2-216	ENST00000576872	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.82	■■■□□ 2.68
CAMTA2-216	ENST00000576872	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		31.8	■■■□□ 2.68
CAMTA2-216	ENST00000576872	CFTR	P13569	1480 aa		31.79	■■■□□ 2.68
CAMTA2-216	ENST00000576872	CUX2	O14529	1486 aa		31.73	■■■□□ 2.67
CAMTA2-216	ENST00000576872	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
CAMTA2-216	ENST00000576872	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
CAMTA2-216	ENST00000576872	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.62	■■■□□ 2.65
CAMTA2-216	ENST00000576872	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.59	■■■□□ 2.65
CAMTA2-216	ENST00000576872	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.56	■■■□□ 2.64
CAMTA2-216	ENST00000576872	PRDM2	Q13029	1718 aa		31.55	■■■□□ 2.64
CAMTA2-216	ENST00000576872	WDR62	O43379	1518 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CAMTA2-216	ENST00000576872	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
CAMTA2-216	ENST00000576872	TOPBP1	Q92547	1522 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CAMTA2-216	ENST00000576872	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.09	■■■□□ 2.57
CAMTA2-216	ENST00000576872	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.08	■■■□□ 2.57
CAMTA2-216	ENST00000576872	IFT140	Q96RY7	1462 aa		30.93	■■■□□ 2.54
CAMTA2-216	ENST00000576872	CUX1	P39880	1505 aa		30.88	■■■□□ 2.53
CAMTA2-216	ENST00000576872	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	30.86	■■■□□ 2.53
CAMTA2-216	ENST00000576872	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	30.8	■■■□□ 2.52
CAMTA2-216	ENST00000576872	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.8	■■■□□ 2.52
CAMTA2-216	ENST00000576872	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.79	■■■□□ 2.52
CAMTA2-216	ENST00000576872	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.77	■■■□□ 2.52
CAMTA2-216	ENST00000576872	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.73	■■■□□ 2.51
CAMTA2-216	ENST00000576872	SOGA1	O94964	1423 aa		30.71	■■■□□ 2.51
CAMTA2-216	ENST00000576872	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.68	■■■□□ 2.5
CAMTA2-216	ENST00000576872	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.65	■■■□□ 2.5
CAMTA2-216	ENST00000576872	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.62	■■■□□ 2.49
CAMTA2-216	ENST00000576872	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.59	■■■□□ 2.49
CAMTA2-216	ENST00000576872	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.59	■■■□□ 2.49
CAMTA2-216	ENST00000576872	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.59	■■■□□ 2.49
CAMTA2-216	ENST00000576872	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.54	■■■□□ 2.48
CAMTA2-216	ENST00000576872	WDR97	A6NE52	1622 aa		30.54	■■■□□ 2.48
CAMTA2-216	ENST00000576872	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.47	■■■□□ 2.47
CAMTA2-216	ENST00000576872	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		30.39	■■■□□ 2.46
CAMTA2-216	ENST00000576872	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.37	■■■□□ 2.45
CAMTA2-216	ENST00000576872	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.37	■■■□□ 2.45
CAMTA2-216	ENST00000576872	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.36	■■■□□ 2.45
CAMTA2-216	ENST00000576872	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.34	■■■□□ 2.45
CAMTA2-216	ENST00000576872	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.31	■■■□□ 2.44
CAMTA2-216	ENST00000576872	CHD1	O14646	1710 aa		30.3	■■■□□ 2.44
CAMTA2-216	ENST00000576872	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.29	■■■□□ 2.44
CAMTA2-216	ENST00000576872	FBLN2	P98095	1184 aa		30.23	■■■□□ 2.43
CAMTA2-216	ENST00000576872	SYNJ2	O15056	1496 aa		30.17	■■■□□ 2.42
CAMTA2-216	ENST00000576872	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	30.14	■■■□□ 2.42
CAMTA2-216	ENST00000576872	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.1	■■■□□ 2.41
CAMTA2-216	ENST00000576872	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.08	■■■□□ 2.41
CAMTA2-216	ENST00000576872	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.01	■■■□□ 2.39
CAMTA2-216	ENST00000576872	KIF27	Q86VH2	1401 aa		30.01	■■■□□ 2.39
CAMTA2-216	ENST00000576872	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.98	■■■□□ 2.39
CAMTA2-216	ENST00000576872	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		29.97	■■■□□ 2.39
CAMTA2-216	ENST00000576872	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.94	■■■□□ 2.38
CAMTA2-216	ENST00000576872	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.94	■■■□□ 2.38
CAMTA2-216	ENST00000576872	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.94	■■■□□ 2.38
CAMTA2-216	ENST00000576872	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.93	■■■□□ 2.38
CAMTA2-216	ENST00000576872	IGF1R	P08069	1367 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CAMTA2-216	ENST00000576872	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CAMTA2-216	ENST00000576872	NUP160	Q12769	1436 aa		29.86	■■■□□ 2.37
CAMTA2-216	ENST00000576872	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CAMTA2-216	ENST00000576872	CUL7	Q14999	1698 aa		29.82	■■■□□ 2.36
CAMTA2-216	ENST00000576872	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CAMTA2-216	ENST00000576872	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CAMTA2-216	ENST00000576872	ARAP1	Q96P48	1450 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CAMTA2-216	ENST00000576872	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.63	■■■□□ 2.33
CAMTA2-216	ENST00000576872	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		29.63	■■■□□ 2.33
CAMTA2-216	ENST00000576872	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.57	■■■□□ 2.32

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