RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.57	■■■■□ 3.93
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.88	■■■■□ 3.17
TBCD-223	ENST00000576691	ABCC9	O60706	1549 aa		34.33	■■■■□ 3.09
TBCD-223	ENST00000576691	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
TBCD-223	ENST00000576691	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.84	■■■□□ 2.85
TBCD-223	ENST00000576691	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.82	■■■□□ 2.85
TBCD-223	ENST00000576691	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TBCD-223	ENST00000576691	NACAD	O15069	1562 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TBCD-223	ENST00000576691	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TBCD-223	ENST00000576691	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TBCD-223	ENST00000576691	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TBCD-223	ENST00000576691	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	31.84	■■■□□ 2.69	3e-7	■■■□□ 18.9
TBCD-223	ENST00000576691	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TBCD-223	ENST00000576691	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TBCD-223	ENST00000576691	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TBCD-223	ENST00000576691	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.09	■■■□□ 2.57
TBCD-223	ENST00000576691	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	30.98	■■■□□ 2.55
TBCD-223	ENST00000576691	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.89	■■■□□ 2.54
TBCD-223	ENST00000576691	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.63	■■■□□ 2.49
TBCD-223	ENST00000576691	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.53	■■■□□ 2.48
TBCD-223	ENST00000576691	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.46	■■■□□ 2.47
TBCD-223	ENST00000576691	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.39	■■■□□ 2.45
TBCD-223	ENST00000576691	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.28	■■■□□ 2.44
TBCD-223	ENST00000576691	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.28	■■■□□ 2.44
TBCD-223	ENST00000576691	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.26	■■■□□ 2.44
TBCD-223	ENST00000576691	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.2	■■■□□ 2.43
TBCD-223	ENST00000576691	WIZ	O95785	1651 aa		30.13	■■■□□ 2.41
TBCD-223	ENST00000576691	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.4
TBCD-223	ENST00000576691	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.06	■■■□□ 2.4
TBCD-223	ENST00000576691	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.03	■■■□□ 2.4
TBCD-223	ENST00000576691	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.9	■■■□□ 2.38
TBCD-223	ENST00000576691	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.61	■■■□□ 2.33
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.57	■■■□□ 2.32
TBCD-223	ENST00000576691	CUX2	O14529	1486 aa		29.56	■■■□□ 2.32
TBCD-223	ENST00000576691	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.53	■■■□□ 2.32
TBCD-223	ENST00000576691	NES	P48681	1621 aa		29.52	■■■□□ 2.32
TBCD-223	ENST00000576691	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.36	■■■□□ 2.29
TBCD-223	ENST00000576691	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
TBCD-223	ENST00000576691	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.31	■■■□□ 2.28
TBCD-223	ENST00000576691	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TBCD-223	ENST00000576691	CFTR	P13569	1480 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TBCD-223	ENST00000576691	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TBCD-223	ENST00000576691	PRDM2	Q13029	1718 aa		29	■■■□□ 2.23
TBCD-223	ENST00000576691	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TBCD-223	ENST00000576691	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TBCD-223	ENST00000576691	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TBCD-223	ENST00000576691	WDR62	O43379	1518 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TBCD-223	ENST00000576691	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TBCD-223	ENST00000576691	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.64	■■■□□ 2.18
TBCD-223	ENST00000576691	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
TBCD-223	ENST00000576691	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TBCD-223	ENST00000576691	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TBCD-223	ENST00000576691	CUX1	P39880	1505 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TBCD-223	ENST00000576691	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TBCD-223	ENST00000576691	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TBCD-223	ENST00000576691	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.45	■■■□□ 2.14
TBCD-223	ENST00000576691	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TBCD-223	ENST00000576691	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TBCD-223	ENST00000576691	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.36	■■■□□ 2.13
TBCD-223	ENST00000576691	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
TBCD-223	ENST00000576691	SOGA1	O94964	1423 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TBCD-223	ENST00000576691	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TBCD-223	ENST00000576691	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TBCD-223	ENST00000576691	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
TBCD-223	ENST00000576691	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
TBCD-223	ENST00000576691	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
TBCD-223	ENST00000576691	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TBCD-223	ENST00000576691	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.03	■■■□□ 2.08
TBCD-223	ENST00000576691	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
TBCD-223	ENST00000576691	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.03	■■■□□ 2.08
TBCD-223	ENST00000576691	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TBCD-223	ENST00000576691	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TBCD-223	ENST00000576691	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TBCD-223	ENST00000576691	CHD1	O14646	1710 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TBCD-223	ENST00000576691	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	27.97	■■■□□ 2.07	1e-7	■■■■□ 21.1
TBCD-223	ENST00000576691	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TBCD-223	ENST00000576691	EEA1	Q15075	1411 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TBCD-223	ENST00000576691	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TBCD-223	ENST00000576691	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TBCD-223	ENST00000576691	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TBCD-223	ENST00000576691	IGF1R	P08069	1367 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TBCD-223	ENST00000576691	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TBCD-223	ENST00000576691	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TBCD-223	ENST00000576691	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TBCD-223	ENST00000576691	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TBCD-223	ENST00000576691	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TBCD-223	ENST00000576691	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TBCD-223	ENST00000576691	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TBCD-223	ENST00000576691	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TBCD-223	ENST00000576691	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TBCD-223	ENST00000576691	CUL7	Q14999	1698 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TBCD-223	ENST00000576691	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TBCD-223	ENST00000576691	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TBCD-223	ENST00000576691	PRX	Q9BXM0	1461 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TBCD-223	ENST00000576691	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TBCD-223	ENST00000576691	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		27.57	■■■□□ 2
TBCD-223	ENST00000576691	FBLN2	P98095	1184 aa		27.55	■■■□□ 2
TBCD-223	ENST00000576691	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.54	■■■□□ 2
TBCD-223	ENST00000576691	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.51	■■□□□ 1.99

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