RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576513.2

SLC12A4-218, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SLC12A4, Length 412 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-218ENST00000576513 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.92■■■□□ 2.7
SLC12A4-218ENST00000576513 ABCC9O60706 1549 aa28.96■■■□□ 2.23
SLC12A4-218ENST00000576513 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.76■■■□□ 2.19
SLC12A4-218ENST00000576513 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.52■■■□□ 2
SLC12A4-218ENST00000576513 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.3■■□□□ 1.96
SLC12A4-218ENST00000576513 NACADO15069 1562 aa27.26■■□□□ 1.96
SLC12A4-218ENST00000576513 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.16■■□□□ 1.94
SLC12A4-218ENST00000576513 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
SLC12A4-218ENST00000576513 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC12A4-218ENST00000576513 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC12A4-218ENST00000576513 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4-218ENST00000576513 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SLC12A4-218ENST00000576513 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC12A4-218ENST00000576513 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC12A4-218ENST00000576513 SCRIBQ14160 1630 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC12A4-218ENST00000576513 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.14■■□□□ 1.78
SLC12A4-218ENST00000576513 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.14■■□□□ 1.78
SLC12A4-218ENST00000576513 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SLC12A4-218ENST00000576513 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC12A4-218ENST00000576513 NCAPD3P42695 1498 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC12A4-218ENST00000576513 ERCC6Q03468 1493 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC12A4-218ENST00000576513 CUX2O14529 1486 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC12A4-218ENST00000576513 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC12A4-218ENST00000576513 SMARCA2P51531 1590 aa25■■□□□ 1.59
SLC12A4-218ENST00000576513 SMARCA4P51532 1647 aa24.94■■□□□ 1.58
SLC12A4-218ENST00000576513 HMGXB3Q12766 1538 aa24.94■■□□□ 1.58
SLC12A4-218ENST00000576513 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SLC12A4-218ENST00000576513 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SLC12A4-218ENST00000576513 NESP48681 1621 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC12A4-218ENST00000576513 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.7■■□□□ 1.54
SLC12A4-218ENST00000576513 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.64■■□□□ 1.54
SLC12A4-218ENST00000576513 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.56■■□□□ 1.52
SLC12A4-218ENST00000576513 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SLC12A4-218ENST00000576513 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.55■■□□□ 1.52
SLC12A4-218ENST00000576513 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.46■■□□□ 1.51
SLC12A4-218ENST00000576513 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.41■■□□□ 1.5
SLC12A4-218ENST00000576513 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.3■■□□□ 1.48
SLC12A4-218ENST00000576513 WIZO95785 1651 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC12A4-218ENST00000576513 WDR62O43379 1518 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC12A4-218ENST00000576513 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC12A4-218ENST00000576513 TRIM41Q8WV44 630 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC12A4-218ENST00000576513 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC12A4-218ENST00000576513 CFTRP13569 1480 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC12A4-218ENST00000576513 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SLC12A4-218ENST00000576513 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SLC12A4-218ENST00000576513 OSCARQ8IYS5 282 aa23.97■■□□□ 1.43
SLC12A4-218ENST00000576513 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SLC12A4-218ENST00000576513 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SLC12A4-218ENST00000576513 PRDM2Q13029 1718 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC12A4-218ENST00000576513 IFT140Q96RY7 1462 aa23.71■■□□□ 1.39
SLC12A4-218ENST00000576513 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4-218ENST00000576513 ABCC8Q09428 1581 aa23.64■■□□□ 1.37
SLC12A4-218ENST00000576513 TOPBP1Q92547 1522 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC12A4-218ENST00000576513 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SLC12A4-218ENST00000576513 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC12A4-218ENST00000576513 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC12A4-218ENST00000576513 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC12A4-218ENST00000576513 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.52■■□□□ 1.36
SLC12A4-218ENST00000576513 ARHGEF11O15085 1522 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC12A4-218ENST00000576513 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SLC12A4-218ENST00000576513 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC12A4-218ENST00000576513 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.342e-10■■■■■ 42.5
SLC12A4-218ENST00000576513 FBLN2P98095 1184 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC12A4-218ENST00000576513 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SLC12A4-218ENST00000576513 CHD1O14646 1710 aa23.36■■□□□ 1.33
SLC12A4-218ENST00000576513 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SLC12A4-218ENST00000576513 SOGA1O94964 1423 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC12A4-218ENST00000576513 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.26■■□□□ 1.31
SLC12A4-218ENST00000576513 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SLC12A4-218ENST00000576513 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SLC12A4-218ENST00000576513 ARAP1Q96P48 1450 aa23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4-218ENST00000576513 WDR97A6NE52 1622 aa23.21■■□□□ 1.31
SLC12A4-218ENST00000576513 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SLC12A4-218ENST00000576513 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4-218ENST00000576513 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.17■■□□□ 1.3
SLC12A4-218ENST00000576513 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SLC12A4-218ENST00000576513 SYNJ1O43426 1573 aa23.12■■□□□ 1.29
SLC12A4-218ENST00000576513 GRIN2BQ13224 1484 aa23.11■■□□□ 1.29
SLC12A4-218ENST00000576513 CUX1P39880 1505 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC12A4-218ENST00000576513 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.08■■□□□ 1.28
SLC12A4-218ENST00000576513 SYNJ2O15056 1496 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC12A4-218ENST00000576513 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.99■■□□□ 1.27
SLC12A4-218ENST00000576513 PBRM1Q86U86 1689 aa22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4-218ENST00000576513 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.92■■□□□ 1.26
SLC12A4-218ENST00000576513 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4-218ENST00000576513 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
SLC12A4-218ENST00000576513 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4-218ENST00000576513 GRIN2AQ12879 1464 aa22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4-218ENST00000576513 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4-218ENST00000576513 ADAMTS12P58397 1594 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC12A4-218ENST00000576513 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.71■■□□□ 1.23
SLC12A4-218ENST00000576513 NUP160Q12769 1436 aa22.71■■□□□ 1.23
SLC12A4-218ENST00000576513 TOP2BQ02880 1626 aa22.7■■□□□ 1.22
SLC12A4-218ENST00000576513 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC12A4-218ENST00000576513 CEP170Q5SW79 1584 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-218ENST00000576513 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC12A4-218ENST00000576513 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-218ENST00000576513 SHROOM2Q13796 1616 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC12A4-218ENST00000576513 JPH4Q96JJ6 628 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC12A4-218ENST00000576513 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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