RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575624.1

CLUH-212, Transcript of clustered mitochondria homolog, humanhuman

TSL 3

Gene CLUH, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUH-212ENST00000575624 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.02■■■■■ 7.84
CLUH-212ENST00000575624 ABCC9O60706 1549 aa57.74■■■■■ 6.83
CLUH-212ENST00000575624 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.65■■■■■ 6.82
CLUH-212ENST00000575624 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.97■■■■■ 6.39
CLUH-212ENST00000575624 NACADO15069 1562 aa54.55■■■■■ 6.32
CLUH-212ENST00000575624 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.38■■■■■ 6.3
CLUH-212ENST00000575624 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.92■■■■■ 6.22
CLUH-212ENST00000575624 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.8■■■■■ 6.2
CLUH-212ENST00000575624 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.68■■■■■ 6.18
CLUH-212ENST00000575624 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.64■■■■■ 6.18
CLUH-212ENST00000575624 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.35■■■■■ 6.13
CLUH-212ENST00000575624 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.01■■■■■ 6.08
CLUH-212ENST00000575624 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.97■■■■■ 6.07
CLUH-212ENST00000575624 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.77■■■■■ 6.04
CLUH-212ENST00000575624 SCRIBQ14160 1630 aa52.35■■■■■ 5.97
CLUH-212ENST00000575624 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.22■■■■■ 5.95
CLUH-212ENST00000575624 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.11■■■■■ 5.93
CLUH-212ENST00000575624 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.07■■■■■ 5.93
CLUH-212ENST00000575624 NCAPD3P42695 1498 aa50.35■■■■■ 5.65
CLUH-212ENST00000575624 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.24■■■■■ 5.63
CLUH-212ENST00000575624 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.11■■■■■ 5.61
CLUH-212ENST00000575624 CUX2O14529 1486 aa50.03■■■■■ 5.6
CLUH-212ENST00000575624 SMARCA2P51531 1590 aa50■■■■■ 5.6
CLUH-212ENST00000575624 SMARCA4P51532 1647 aa50■■■■■ 5.59
CLUH-212ENST00000575624 HMGXB3Q12766 1538 aa49.98■■■■■ 5.59
CLUH-212ENST00000575624 ERCC6Q03468 1493 aa49.91■■■■■ 5.58
CLUH-212ENST00000575624 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.74■■■■■ 5.55
CLUH-212ENST00000575624 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.6■■■■■ 5.53
CLUH-212ENST00000575624 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.6■■■■■ 5.53
CLUH-212ENST00000575624 NESP48681 1621 aa49.52■■■■■ 5.52
CLUH-212ENST00000575624 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.27■■■■■ 5.48
CLUH-212ENST00000575624 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.27■■■■■ 5.48
CLUH-212ENST00000575624 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.18■■■■■ 5.46
CLUH-212ENST00000575624 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.96■■■■■ 5.43
CLUH-212ENST00000575624 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.93■■■■■ 5.42
CLUH-212ENST00000575624 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.77■■■■■ 5.4
CLUH-212ENST00000575624 WIZO95785 1651 aa48.65■■■■■ 5.38
CLUH-212ENST00000575624 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.55■■■■■ 5.36
CLUH-212ENST00000575624 WDR62O43379 1518 aa48.47■■■■■ 5.35
CLUH-212ENST00000575624 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.29■■■■■ 5.32
CLUH-212ENST00000575624 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.19■■■■■ 5.31
CLUH-212ENST00000575624 CFTRP13569 1480 aa48.18■■■■■ 5.3
CLUH-212ENST00000575624 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.15■■■■■ 5.3
CLUH-212ENST00000575624 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
CLUH-212ENST00000575624 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.81■■■■■ 5.24
CLUH-212ENST00000575624 TRIM41Q8WV44 630 aa47.77■■■■■ 5.24
CLUH-212ENST00000575624 PRDM2Q13029 1718 aa47.71■■■■■ 5.23
CLUH-212ENST00000575624 OSCARQ8IYS5 282 aa47.6■■■■■ 5.21
CLUH-212ENST00000575624 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.49■■■■■ 5.19
CLUH-212ENST00000575624 IFT140Q96RY7 1462 aa47.36■■■■■ 5.17
CLUH-212ENST00000575624 TOPBP1Q92547 1522 aa47.25■■■■■ 5.16
CLUH-212ENST00000575624 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
CLUH-212ENST00000575624 ABCC8Q09428 1581 aa47.22■■■■■ 5.15
CLUH-212ENST00000575624 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.09■■■■■ 5.13
CLUH-212ENST00000575624 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.03■■■■■ 5.12
CLUH-212ENST00000575624 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.03■■■■■ 5.12
CLUH-212ENST00000575624 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.03■■■■■ 5.12
CLUH-212ENST00000575624 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
CLUH-212ENST00000575624 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
CLUH-212ENST00000575624 ARHGEF11O15085 1522 aa46.87■■■■■ 5.09
CLUH-212ENST00000575624 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.76■■■■■ 5.08
CLUH-212ENST00000575624 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.75■■■■■ 5.07
CLUH-212ENST00000575624 CHD1O14646 1710 aa46.69■■■■■ 5.06
CLUH-212ENST00000575624 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.51■■■■■ 5.04
CLUH-212ENST00000575624 SOGA1O94964 1423 aa46.51■■■■■ 5.04
CLUH-212ENST00000575624 WDR97A6NE52 1622 aa46.5■■■■■ 5.04
CLUH-212ENST00000575624 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.44■■■■■ 5.02
CLUH-212ENST00000575624 FBLN2P98095 1184 aa46.43■■■■■ 5.02
CLUH-212ENST00000575624 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.4■■■■■ 5.02
CLUH-212ENST00000575624 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
CLUH-212ENST00000575624 ARAP1Q96P48 1450 aa46.37■■■■■ 5.01
CLUH-212ENST00000575624 CUX1P39880 1505 aa46.32■■■■■ 5.01
CLUH-212ENST00000575624 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.3■■■■■ 5
CLUH-212ENST00000575624 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.25■■■■■ 4.99
CLUH-212ENST00000575624 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.2■■■■■ 4.99
CLUH-212ENST00000575624 GRIN2BQ13224 1484 aa46.19■■■■■ 4.98
CLUH-212ENST00000575624 SYNJ1O43426 1573 aa46.15■■■■■ 4.98
CLUH-212ENST00000575624 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
CLUH-212ENST00000575624 SYNJ2O15056 1496 aa46.07■■■■■ 4.97
CLUH-212ENST00000575624 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
CLUH-212ENST00000575624 PBRM1Q86U86 1689 aa45.98■■■■■ 4.95
CLUH-212ENST00000575624 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.96■■■■■ 4.95
CLUH-212ENST00000575624 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.92■■■■■ 4.94
CLUH-212ENST00000575624 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.88■■■■■ 4.93
CLUH-212ENST00000575624 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.65■■■■■ 4.9
CLUH-212ENST00000575624 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
CLUH-212ENST00000575624 GRIN2AQ12879 1464 aa45.58■■■■■ 4.89
CLUH-212ENST00000575624 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.56■■■■■ 4.88
CLUH-212ENST00000575624 TOP2BQ02880 1626 aa45.55■■■■■ 4.88
CLUH-212ENST00000575624 ADAMTS12P58397 1594 aa45.54■■■■■ 4.88
CLUH-212ENST00000575624 NUP160Q12769 1436 aa45.47■■■■■ 4.87
CLUH-212ENST00000575624 CEP170Q5SW79 1584 aa45.41■■■■■ 4.86
CLUH-212ENST00000575624 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.39■■■■■ 4.86
CLUH-212ENST00000575624 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.36■■■■■ 4.85
CLUH-212ENST00000575624 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.36■■■■■ 4.85
CLUH-212ENST00000575624 SHROOM2Q13796 1616 aa45.33■■■■■ 4.85
CLUH-212ENST00000575624 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.99■■■■■ 4.79
CLUH-212ENST00000575624 JPH4Q96JJ6 628 aa44.92■■■■■ 4.78
CLUH-212ENST00000575624 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.91■■■■■ 4.78
CLUH-212ENST00000575624 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.88■■■■■ 4.78
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