RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572819.6

DPH1-211, Transcript of diphthamide biosynthesis 1, humanhuman

TSL 5

Gene DPH1, Length 1,345 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPH1-211ENST00000572819 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.8■■■■■ 6.04
DPH1-211ENST00000572819 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.06■■■■■ 5.12
DPH1-211ENST00000572819 ABCC9O60706 1549 aa46.28■■■■■ 5
DPH1-211ENST00000572819 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.38■■■■■ 4.69
DPH1-211ENST00000572819 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.32■■■■■ 4.69
DPH1-211ENST00000572819 NACADO15069 1562 aa44.24■■■■■ 4.67
DPH1-211ENST00000572819 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
DPH1-211ENST00000572819 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.81■■■■■ 4.6
DPH1-211ENST00000572819 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.59■■■■■ 4.57
DPH1-211ENST00000572819 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.56■■■■■ 4.56
DPH1-211ENST00000572819 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.22■■■■■ 4.51
DPH1-211ENST00000572819 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.07■■■■■ 4.49
DPH1-211ENST00000572819 SCRIBQ14160 1630 aa43.01■■■■■ 4.48
DPH1-211ENST00000572819 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.63■■■■■ 4.41
DPH1-211ENST00000572819 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.42■■■■■ 4.38
DPH1-211ENST00000572819 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
DPH1-211ENST00000572819 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.87■■■■■ 4.29
DPH1-211ENST00000572819 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.56■■■■■ 4.24
DPH1-211ENST00000572819 SMARCA4P51532 1647 aa41.06■■■■■ 4.16
DPH1-211ENST00000572819 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
DPH1-211ENST00000572819 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.82■■■■■ 4.13
DPH1-211ENST00000572819 NCAPD3P42695 1498 aa40.78■■■■■ 4.12
DPH1-211ENST00000572819 SMARCA2P51531 1590 aa40.77■■■■■ 4.12
DPH1-211ENST00000572819 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.73■■■■■ 4.11
DPH1-211ENST00000572819 HMGXB3Q12766 1538 aa40.6■■■■■ 4.09
DPH1-211ENST00000572819 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.58■■■■■ 4.09
DPH1-211ENST00000572819 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
DPH1-211ENST00000572819 WIZO95785 1651 aa40.37■■■■■ 4.05
DPH1-211ENST00000572819 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
DPH1-211ENST00000572819 NESP48681 1621 aa40.01■■■■■ 4
DPH1-211ENST00000572819 ERCC6Q03468 1493 aa39.88■■■■□ 3.98
DPH1-211ENST00000572819 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.96
DPH1-211ENST00000572819 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.81■■■■□ 3.96
DPH1-211ENST00000572819 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.61■■■■□ 3.93
DPH1-211ENST00000572819 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.61■■■■□ 3.93
DPH1-211ENST00000572819 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.5■■■■□ 3.91
DPH1-211ENST00000572819 CUX2O14529 1486 aa39.45■■■■□ 3.91
DPH1-211ENST00000572819 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
DPH1-211ENST00000572819 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.36■■■■□ 3.89
DPH1-211ENST00000572819 CFTRP13569 1480 aa39.33■■■■□ 3.89
DPH1-211ENST00000572819 PRDM2Q13029 1718 aa39.22■■■■□ 3.87
DPH1-211ENST00000572819 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.2■■■■□ 3.87
DPH1-211ENST00000572819 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.18■■■■□ 3.86
DPH1-211ENST00000572819 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.14■■■■□ 3.86
DPH1-211ENST00000572819 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
DPH1-211ENST00000572819 WDR62O43379 1518 aa39.02■■■■□ 3.84
DPH1-211ENST00000572819 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
DPH1-211ENST00000572819 TOPBP1Q92547 1522 aa38.57■■■■□ 3.76
DPH1-211ENST00000572819 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.5■■■■□ 3.75
DPH1-211ENST00000572819 ABCC8Q09428 1581 aa38.48■■■■□ 3.75
DPH1-211ENST00000572819 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.48■■■■□ 3.75
DPH1-211ENST00000572819 IFT140Q96RY7 1462 aa38.32■■■■□ 3.73
DPH1-211ENST00000572819 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
DPH1-211ENST00000572819 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
DPH1-211ENST00000572819 CUX1P39880 1505 aa38.21■■■■□ 3.71
DPH1-211ENST00000572819 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
DPH1-211ENST00000572819 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.12■■■■□ 3.69
DPH1-211ENST00000572819 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
DPH1-211ENST00000572819 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.1■■■■□ 3.69
DPH1-211ENST00000572819 SOGA1O94964 1423 aa38.06■■■■□ 3.68
DPH1-211ENST00000572819 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38■■■■□ 3.678e-13■■■■■ 53.8
DPH1-211ENST00000572819 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
DPH1-211ENST00000572819 WDR97A6NE52 1622 aa37.87■■■■□ 3.65
DPH1-211ENST00000572819 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.86■■■■□ 3.65
DPH1-211ENST00000572819 SYNJ1O43426 1573 aa37.86■■■■□ 3.65
DPH1-211ENST00000572819 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.86■■■■□ 3.65
DPH1-211ENST00000572819 TOP2BQ02880 1626 aa37.83■■■■□ 3.65
DPH1-211ENST00000572819 OSCARQ8IYS5 282 aa37.81■■■■□ 3.64
DPH1-211ENST00000572819 CHD1O14646 1710 aa37.75■■■■□ 3.63
DPH1-211ENST00000572819 PBRM1Q86U86 1689 aa37.69■■■■□ 3.62
DPH1-211ENST00000572819 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.68■■■■□ 3.62
DPH1-211ENST00000572819 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.64■■■■□ 3.62
DPH1-211ENST00000572819 FBLN2P98095 1184 aa37.62■■■■□ 3.61
DPH1-211ENST00000572819 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.61■■■■□ 3.61
DPH1-211ENST00000572819 GRIN2BQ13224 1484 aa37.61■■■■□ 3.61
DPH1-211ENST00000572819 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.61■■■■□ 3.61
DPH1-211ENST00000572819 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.6
DPH1-211ENST00000572819 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
DPH1-211ENST00000572819 SYNJ2O15056 1496 aa37.39■■■■□ 3.58
DPH1-211ENST00000572819 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.34■■■■□ 3.57
DPH1-211ENST00000572819 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.34■■■■□ 3.57
DPH1-211ENST00000572819 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.34■■■■□ 3.57
DPH1-211ENST00000572819 TRIM41Q8WV44 630 aa37.28■■■■□ 3.56
DPH1-211ENST00000572819 ADAMTS12P58397 1594 aa37.27■■■■□ 3.56
DPH1-211ENST00000572819 ARHGEF11O15085 1522 aa37.23■■■■□ 3.55
DPH1-211ENST00000572819 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.23■■■■□ 3.55
DPH1-211ENST00000572819 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.2■■■■□ 3.55
DPH1-211ENST00000572819 GRIN2AQ12879 1464 aa37.15■■■■□ 3.54
DPH1-211ENST00000572819 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.13■■■■□ 3.54
DPH1-211ENST00000572819 KIF27Q86VH2 1401 aa37.07■■■■□ 3.53
DPH1-211ENST00000572819 CEP170Q5SW79 1584 aa37.02■■■■□ 3.52
DPH1-211ENST00000572819 NUP160Q12769 1436 aa36.94■■■■□ 3.5
DPH1-211ENST00000572819 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.93■■■■□ 3.5
DPH1-211ENST00000572819 IGF1RP08069 1367 aa36.93■■■■□ 3.5
DPH1-211ENST00000572819 ARAP1Q96P48 1450 aa36.92■■■■□ 3.5
DPH1-211ENST00000572819 CUL7Q14999 1698 aa36.92■■■■□ 3.5
DPH1-211ENST00000572819 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.78■■■■□ 3.48
DPH1-211ENST00000572819 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.76■■■■□ 3.48
DPH1-211ENST00000572819 SHROOM2Q13796 1616 aa36.75■■■■□ 3.47
DPH1-211ENST00000572819 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.74■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.4 ms